Fiji nebo ImageJ zvolte, když
Fiji nebo ImageJ použijte, když vaše práce závisí na open-source zpracování, skriptování, vlastních pluginech, dávkových makrech nebo na metodě, kterou už vaše laboratoř validovala. SlideScope dnes zvládá standardní segmentaci a počítání jader, buněk a částic s uloženým postupem, nemá ale makro jazyk a neumožňuje sestavovat vlastní pipeline, takže tento ekosystém doplňuje, nikoli nahrazuje.
Kam zapadají další analytické nástroje
Fiji a ImageJ nejsou jediné nástroje, které lidé v této situaci zvažují. Pokud jde o opakovatelnou měřicí pipeline přes mnoho snímků, porovnejte raději CellProfiler. Pokud jde o detekci objektů v celoplošných snímcích nebo o práci nativně v Pythonu, porovnejte QuPath a napari. Stránka software pro analýzu mikroskopických snímků ukazuje, kam patří prohlížení, kalibrované měření a kvantifikace.
Upozornění na nezávislost
SlideScope je nezávislý a není nijak spojen s Fiji ani ImageJ. Názvy produktů jsou uvedeny pouze pro popis srovnání a hledání alternativ.
Zkontrolujte své soubory zdarma
Vyzkoušejte SlideScope, když jde o kontrolu souborů, ne o vlastní analýzu obrazu. Už máte jasno? Předplatit nyní.
Prozkoumejte vestavěnou knihovnu ukázek zdarma, se všemi nástroji. Pro otevírání vlastních snímků potřebujete předplatné: $35/měsíc, účtované při předplacení (PayPal nebo karta), a zrušit ho můžete kdykoli ve svém účtu. K dispozici je i roční platba za $349.99/rok, což vychází zhruba na dva měsíce zdarma.