Contenu de cette vidéo
Aperio ImageScope, la visionneuse SVS habituelle, ne fonctionne que sous Windows. Une image de lame entière SVS est une pyramide de plusieurs gigaoctets : les applications d’images ordinaires sur Mac la refusent ou tentent de la charger entièrement d’un coup.
Cette vidéo explique pourquoi les images de lames entières demandent un autre type de visionneuse, puis ouvre une lame SVS sur un Mac : zoom de la coupe de tissu entière jusqu’aux cellules individuelles, lecture des métadonnées de numérisation, mesure en microns étalonnés, et formats que la visionneuse n’ouvrira pas.
Vous préférez lire ? Comment ouvrir des fichiers SVS : toutes les options comparées.
Transcription
Mis à jour depuis l’enregistrement. Là où la vidéo indique que le format Olympus VSI ne s’ouvre pas, cela a changé : depuis la version 1.10.0, SlideScope ouvre directement les lames Olympus/Evident VSI, y compris celles qui comportent plusieurs régions de numérisation, et depuis la version 1.20.0, il ouvre aussi les lames Philips iSyntax. L’essai évoqué dans la narration n’est plus proposé aux nouveaux inscrits, et les prix cités ont changé : la bibliothèque d’échantillons intégrée est gratuite avec tous les outils, et pour ouvrir vos propres images il faut un abonnement, facturé dès la souscription par PayPal ou carte. Les prix actuels figurent sur la page des tarifs. Voir les tarifs.
On vous a envoyé une lame SVS de deux gigaoctets. Aperçu ne l’ouvre pas, et ImageScope ne fonctionne que sous Windows.
Un SVS est une image de lame entière issue d’un scanner Aperio ou Leica : une pyramide basée sur le TIFF.
C’est la même lame stockée à de nombreuses résolutions.
Ouvrez le .svs directement. La vue d’ensemble s’affiche immédiatement.
L’application lit d’abord le niveau le plus grossier de la pyramide : rien n’attend le fichier complet.
Zoomez et des tuiles plus fines arrivent au fil de l’eau. Une lame de plusieurs gigaoctets, sur un ordinateur portable ordinaire.
Ni serveur d’images, ni PACS. La lame est lue depuis le disque.
Les métadonnées de la lame s’affichent à côté de l’image.
Le scanner a enregistré la taille de pixel : cette mesure est donc en vrais micromètres.
Retour à la lame entière en une seule étape.
Deux limites, en toute honnêteté. D’abord, les formats.
SVS, TIFF pyramidal, OME-TIFF, NDPI, MRXS et DICOM de lame entière s’ouvrent tous.
Philips iSyntax et Olympus VSI, non. Pour ceux-là, exportez en TIFF depuis le scanner.
Un QPTIFF multiplex s’ouvre, mais affiche une vue RVB plutôt que ses canaux séparés.
Ensuite, le périmètre : c’est la couche de relecture, pas un outil de gestion des cas, ni un dispositif de diagnostic.
Un essai de 3 jours avec accès complet, puis $25.00 par mois. Le lien est dans la description.