О чём это видео
Aperio ImageScope, обычный просмотрщик SVS, работает только в Windows. Полнослайдовое изображение SVS — это пирамида размером в несколько гигабайт, поэтому обычные программы для изображений на Mac либо отказываются его открывать, либо пытаются загрузить целиком сразу.
В этом видео объясняется, почему полнослайдовым изображениям нужен просмотрщик другого типа, а затем слайд SVS открывается на Mac: масштабирование от всего среза ткани до отдельных клеток, чтение метаданных сканирования, измерение в калиброванных микронах и форматы, которые просмотрщик не откроет.
Предпочитаете читать? Как открыть файлы SVS: сравнение всех вариантов.
Расшифровка
Обновлено после записи. В видео сказано, что Olympus VSI не открывается, но это изменилось: начиная с версии 1.10.0, SlideScope открывает слайды Olympus/Evident VSI напрямую, включая слайды с несколькими областями сканирования, а с версии 1.20.0 — и слайды Philips iSyntax. Пробный период из озвучки больше не предлагается новым пользователям, а названные цены изменились: встроенная библиотека образцов бесплатна со всеми инструментами, а чтобы открывать собственные изображения, нужна подписка, оплата при оформлении через PayPal или картой. Актуальные цены — на странице цен. См. цены.
Вам прислали слайд SVS размером два гигабайта. Preview его не откроет, а ImageScope работает только в Windows.
SVS — это полнослайдовое изображение со сканера Aperio или Leica, пирамида на основе TIFF.
Это один и тот же слайд, сохранённый во многих разрешениях.
Открываем .svs напрямую. Обзорное изображение появляется сразу.
Сначала читается самый грубый уровень пирамиды, поэтому ничего не ждёт загрузки всего файла.
При увеличении подгружаются более детальные тайлы. Слайд в несколько гигабайт на обычном ноутбуке.
Ни сервера изображений, ни PACS. Слайд читается с диска.
Метаданные слайда находятся рядом с изображением.
Сканер записал размер пикселя, поэтому это измерение — в настоящих микрометрах.
Обратно к слайду целиком одним действием.
Два честных ограничения. Первое — форматы.
SVS, пирамидальный TIFF, OME-TIFF, NDPI, MRXS и полнослайдовый DICOM открываются.
Philips iSyntax и Olympus VSI — нет. Для них экспортируйте TIFF на сканере.
Мультиплексный QPTIFF открывается, но в виде RGB, а не по отдельным каналам.
Второе — назначение: это инструмент для просмотра, а не система управления случаями и не диагностическое устройство.
Пробный период с полным доступом на 3 дня, затем $25.00 в месяц. Ссылка — в описании.