Whole slide imaging

Een viewer voor slidescannerbeelden voor iedereen die de scanner niet heeft gekocht

Whole slide imaging lost het acquisitieprobleem op en schept een distributieprobleem. De scanner staat in één lab, maar de mensen die de resultaten moeten bekijken zijn verspreid over collega's, studenten en beoordelaars met hun eigen Windows- en Mac-computers. SlideScope is de viewer voor die tweede groep.

Ben je scanners aan het kiezen of vergelijken? Bekijk de vergelijking van scanners voor digitale pathologie: modellen, capaciteit en het bestandsformaat dat elk ervan schrijft.

Gigapixelcoupes op een laptop Geen beeldserver nodig Windows en macOS

Waarom scannerbeelden lastig te delen zijn

De bestanden zijn enorm

Eén gescande coupe is gewoonlijk enkele gigabytes groot en tienduizenden pixels breed. Gewone beeldviewers weigeren hem of proberen alles in het geheugen te laden.

Viewers zijn per leverancier

Scannersoftware is geschreven voor de eigenaar van de scanner. Collega's installeren uiteindelijk voor elk partnerlab een andere tool, en een aantal van die tools draait alleen op Windows.

De schaal raakt onderweg kwijt

Zodra er van een coupe een screenshot is gemaakt of hij slordig is geconverteerd, is de kalibratie in micrometer per pixel verdwenen en kan niemand verderop nog eerlijk iets meten.

Zo gaat SlideScope om met whole-slide-bestanden

Slidescanners schrijven een piramide: hetzelfde beeld opgeslagen in veel resoluties, zodat een viewer goedkoop een grof overzicht kan ophalen en steeds fijnere tegels terwijl je inzoomt. SlideScope gebruikt die piramide direct. Het laadt alleen de tegels die de huidige weergave nodig heeft, en daarom opent een coupe van meerdere gigabytes op een gewone laptop, zonder beeldserver, PACS of pathologie-informaticasysteem erachter.

De kalibratie die de scanner heeft vastgelegd reist mee met het bestand, dus metingen komen terug in micrometer in plaats van pixels. De metadata blijven inzichtelijk in plaats van verstopt, en annotaties worden aan je account gekoppeld opgeslagen, zodat een tweede beoordelaar de coupe opent met de markeringen van de eerste beoordelaar al op hun plek.

Waar dit staat naast systemen voor pathologiebeeldvorming

Pathologiebeeldvorming bestaat uit verschillende lagen, en het helpt om precies te weten naar welke je op zoek bent.

Acquisitie is de scanner met zijn besturingssoftware. SlideScope komt niet aan deze laag.

Beheer is de beeldserver, het casusbeheer en het pathologie-informaticasysteem dat coupes opslaat en koppelt aan monsters en verslagen. SlideScope is daar geen vervanging voor.

Beoordeling is een coupe openen, erdoor navigeren, meten, annoteren en bevindingen doorgeven. Voor deze laag is SlideScope gemaakt, en juist op deze laag hebben teams het vaakst geen goede cross-platform optie.

Voor dezelfde taak vanuit het perspectief van onderzoeksbeoordeling, zie de pagina viewer voor digitale pathologie. Voor beoordeling gericht op weefsel, zie de pagina viewer voor histologiecoupes.

Snelle antwoorden over SlideScope voor slidescannerbeelden

Het meest geschikt voor: collega's, studenten en beoordelaars die whole-slide-beelden van de scanner van iemand anders ontvangen en ze op hun eigen computer moeten openen.

Belangrijkste sterke punten: gigapixelnavigatie zonder server, ondersteuning voor SVS, piramidale TIFF, NDPI, NDPIS, VMS, MRXS, SCN, BIF en VSI, gekalibreerde metingen, zichtbare metadata, opgeslagen annotaties, laden via gedeelde links, en dezelfde mogelijkheden op Windows en macOS.

Belangrijke beperking: geen ondersteuning voor SQRAY SDPC, Motic MDSX of UNIC TMAP, en geen scannerbesturing of beheer van casussen en monsters.

Laatst gecontroleerd: 1 augustus 2026.

Vragen over slidescannerbeelden

Welke slidescannerformaten opent SlideScope?

SlideScope opent Aperio SVS-whole-slide-beelden, exports in piramidale TIFF en OME-TIFF, en Hamamatsu NDPI- en VMS-, 3DHISTECH MRXS-, Leica SCN- en Ventana BIF-scans via de OpenSlide-backend. Sinds versie 1.10.0 opent het ook Olympus/Evident VSI-coupes, waarbij elk scangebied op zijn eigen pixelgrootte wordt gemeten, en Hamamatsu NDPIS-fluorescentiesets, en sinds versie 1.20.0 Philips iSyntax- en KFBio KFB-coupes. MRXS- en VMS-coupes openen alleen vanaf lokale opslag, omdat hun pixels in een bijbehorende map staan. Het opent geen SQRAY SDPC, Motic MDSX of UNIC TMAP.

Wat als mijn scanner een formaat schrijft dat SlideScope niet leest?

De meeste scansoftware kan exporteren naar piramidale TIFF of OME-TIFF. Door één keer bij de scanner te exporteren, blijft de rest van de beoordelingsworkflow in SlideScope, zonder een viewer per leverancier op de computer van elke beoordelaar.

Openen whole-slide-beelden van gigapixels zonder server?

Ja. SlideScope leest de beeldpiramide die de scanner al heeft geschreven en laadt alleen de tegels die de huidige weergave nodig heeft, dus een coupe van meerdere gigabytes opent op een gewone laptop zonder beeldserver of PACS erachter.

Is SlideScope een pathologie-informaticaplatform?

Nee. SlideScope is de laag voor bekijken en beoordelen. Het beheert geen casussen, monsters of laboratoriumgegevens, en het is geen vervanging voor een pathologie-informaticasysteem of een beeldbeheerserver.

Open een van je gescande coupes en kijk zelf

SlideScope geeft volledige toegang vanaf het eerste abonnement. Laad een echt whole-slide-beeld en controleer de navigatiesnelheid en de meetnauwkeurigheid voordat je iets beslist.

SlideScope downloaden