Whole slide imaging op de desktop

Viewer voor digitale pathologie voor onderzoek, onderwijs en beoordeling

SlideScope is een desktopviewer voor digitale pathologie voor Windows en macOS. Open whole-slide-beelden van scanners van Aperio, Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana en Akoya op volledige resolutie, meet in gekalibreerde micrometers, houd annotaties aan de coupe gekoppeld, vergelijk een H&E naast de IHC-herkleuring ervan, en stuur een collega een link die precies het gezichtsveld opent waar je naar kijkt.

SVS, NDPI, MRXS, VSI, SCN, BIF, QPTIFF, DICOM Windows, Apple Silicon en Intel-Mac Probeer het gratis op voorbeelden

Wat een viewer voor digitale pathologie moet kunnen

Een whole-slide-beeld is geen foto. Een scanner legt een glazen objectglaasje op 20x of 40x vast als een piramide van tegels die kan oplopen tot enkele gigabytes en meer dan 100.000 pixels per zijde. Een viewer die dat als één beeld probeert te laden, faalt; een viewer die de piramide begrijpt, opent het in seconden. Al het andere wat een pathologieteam nodig heeft, bouwt daarop voort.

De piramide van de scanner lezen

SlideScope leest de resolutieniveaus die de scanner heeft geschreven, dus een SVS- of NDPI-coupe van 3 GB opent op een gewone laptop, zonder beeldserver, zonder conversiestap en zonder upload.

Meten op echte schaal

De waarde in micron per pixel die de scanner heeft vastgelegd, bepaalt elke liniaal en elke oppervlaktemeting, dus een tumormarge die op 40x is gemeten, geeft op 5x dezelfde afstand.

De context van de beoordeling bewaren

Annotaties, opgeslagen gebieden en notities blijven gekoppeld aan de coupe en aan je account, en een gedeelde weergavelink opent dezelfde positie, zoom en hetzelfde vlak op de computer van iemand anders.

Whole-slide-formaten die SlideScope opent

Digitale pathologie is versnipperd per scannerleverancier. Elke fabrikant schrijft zijn eigen container, en een viewer die er maar één leest, dwingt het lab een tweede tool te houden voor elke andere scanner waarvan het coupes ontvangt. SlideScope leest de volgende leveranciersformaten, de meeste via de OpenSlide-backend, naast zijn eigen lezers voor microscopiebestanden.

Scanner of bronFormaatOpmerkingen
Aperio en Leica BiosystemsSVS, SVSLIDEHet meest voorkomende whole-slide-formaat in onderzoeksarchieven. Opent op de Mac en op Windows.
Hamamatsu NanoZoomerNDPI, NDPIS, VMS, VMUVMS en VMU bewaren pixels in bijbehorende bestanden, dus ze openen alleen vanaf lokale opslag. Sinds 1.10.0 openen NDPIS-fluorescentiesets met hun echte kanaalnamen en kleuren, en openen ook NDPI-coupes die met JPEG XR zijn gecomprimeerd. Sinds 1.20.0 verschijnen annotaties die in NDP.view zijn getekend (.ndpa) over de coupe en kun je ze naar je metingen kopiëren.
3DHISTECH PannoramicMRXSHet .mrxs-bestand en de map met dezelfde naam moeten naast elkaar staan. Alleen lokale opslag.
Olympus en Evident (cellSens)VSIOpent direct sinds 1.10.0: whole-slide- en fluorescentiescans, ook coupes met meerdere scangebieden, elk gemeten op zijn eigen pixelgrootte.
Philips Ultra Fast Scanner en SG-serieiSyntaxOpent direct sinds 1.20.0, met het label en het macrobeeld van de coupe. SlideScope toont de gedecodeerde pixels zonder de eigen verscherping en kleurbewerking van Philips, dus een coupe kan er iets anders uitzien dan in de viewer van Philips.
KFBio KF-PROKFBHelderveld-KFB-coupes openen direct sinds 1.20.0. KFBF-fluorescentiecoupes openen niet.
Leica SCN400 en Aperio GTSCNGelezen via de OpenSlide-backend; sinds 1.10.0 openen ook SCN-coupes die OpenSlide niet kan lezen.
Ventana en RocheBIFHelderveldscans uit de iScan-familie. Sinds 1.10.0 openen ook BIF-coupes die OpenSlide niet kan lezen, al worden de naden tussen hun tegels nog niet aan elkaar gezet.
Akoya, PerkinElmer, VectraQPTIFFMultiplex-immunofluorescentie met regelaars voor kleur en intensiteit per kanaal.
Agilent ARGOSAVSGelezen via de OpenSlide-backend.
Elke export van een scanner of PACSDICOM, piramidale TIFF, OME-TIFFLeveranciersonafhankelijke exports, waaronder DICOM-series voor whole slide imaging.
OnderzoeksmicroscopenCZI, ND2, LIF, IMS, OIB en OIR, LSM, ZVI, LOF en XLEF, DeltaVision, MetaMorph, OME-ZarrBestanden van Zeiss, Nikon, Leica-confocale systemen en Imaris uit hetzelfde project openen in hetzelfde venster. De lezers voor Olympus FluoView, Zeiss ZVI en LSM, Leica LOF en XLEF, DeltaVision, MetaMorph en OME-Zarr kwamen erbij in 1.10.0; OME-Zarr opent alleen vanuit lokale mappen.

Niet ondersteund: SQRAY SDPC, Motic MDSX, UNIC TMAP en KFBio KFBF-fluorescentiecoupes. Olympus/Evident VSI opent direct sinds versie 1.10.0, en Philips iSyntax en helderveld-KFBio KFB sinds versie 1.20.0. Voor de formaten van andere scanners geeft de vergelijking van scanners voor digitale pathologie de open DICOM- en TIFF-exports die die scanners kunnen schrijven. Het volledige compatibiliteitsoverzicht voor bestanden geeft extensies, dimensies en codecbeperkingen.

Beoordelingstools gemaakt voor pathologiewerk

Naast elkaar vergelijken. Open een tweede coupe naast de eerste en beide panelen blijven op hetzelfde gebied bij dezelfde vergroting. De schaal wordt gelijkgetrokken in micrometer, niet op zoomfactor, dus een H&E die op 20x is gescand en de IHC-herkleuring ervan die op 40x is gescand komen echt overeen. Pannen of zoomen in het ene paneel beweegt het andere mee.

Gekalibreerd meten en annoteren. Linialen, oppervlakten en genummerde markeringen gebruiken de pixelgrootte van de scanner en blijven aan de coupe gekoppeld. Gebieden en metingen worden geëxporteerd als GeoJSON op volledige coupe-resolutie, wat QuPath, ASAP en de Python-tools eromheen direct lezen, en als CSV voor meettabellen.

Gedeelde weergavelinks. Een link bevat de coupe samen met positie, zoom en vlak. Geïnstalleerde exemplaren van SlideScope openen hem met één klik; wie de app niet heeft, ziet eerst op de website waar de link naar verwijst. Zo worden onderzoeksbeoordeling op afstand, tumorbesprekingen en onderwijs praktisch haalbaar zonder beeldserver.

Local Quantification. Segmenteer kernen, cellen of deeltjes op je eigen computer en krijg gekalibreerde aantallen, dichtheid per vierkante millimeter, morfologie, gemiddelde intensiteit per kanaal en markerpositiviteit, met export naar CSV, GeoJSON en masker-TIFF. De pixels verlaten de computer nooit. Zie de kwantificatiegids voor wat het wel en niet doet.

AI Analysis. Op verzoek stuurt SlideScope een gecomprimeerde weergave van het huidige beeld en krijg je een uitleg in gewone taal van wat er zichtbaar is, in 14 talen. Het vraagt toestemming voor de eerste upload en stuurt anders nooit iets, zoals beschreven op de pagina vertrouwen en gegevensverwerking.

Gratis viewers voor digitale pathologie, en wanneer SlideScope beter past

Verschillende capabele viewers kosten niets, en deze site zegt dat ronduit. Aperio ImageScope is gratis en leest SVS goed, maar draait alleen op Windows en Leica ontwikkelt het niet meer actief. Hamamatsu NDP.view2 is gratis voor NDPI-coupes; voor de formaten van andere leveranciers heb je de betaalde Plus-editie nodig. QuPath is open source, cross-platform en de juiste tool voor gescripte analyse, ten koste van een steilere leercurve voor mensen die alleen coupes willen bekijken. ObjectiveView is een gratis leveranciersonafhankelijke viewer voor Windows en Mac.

SlideScope past beter als het lab coupes van meer dan één scanner ontvangt, Mac-gebruikers heeft, metingen en annotaties wil die een overdracht overleven, twee coupes op gelijke schaal moet vergelijken, of een collega een exact gezichtsveld wil sturen in plaats van een screenshot. De vergelijking van acht viewers zet platform, prijs, formaten en onderhoudsstatus op een rij, met bronnen.

Wie SlideScope gebruikt voor digitale pathologie

  • Onderzoeksgroepen in de pathologie die gescande cohorten beoordelen, laesies meten en gebieden markeren voor verdere analyse in QuPath.
  • Onderwijslabs met cursussen virtuele microscopie, waarin elke student dezelfde set coupes opent op zijn eigen Windows-laptop of Mac.
  • Core facilities die gescande coupes teruggeven aan onderzoekers die de software van de scannerleverancier niet hebben.
  • Preklinische en toxicologische teams die coupes van een contractlab ontvangen en snel een tweede blik willen werpen zonder beeldbeheersysteem.
  • Collega's op een Mac die een SVS- of NDPI-bestand toegestuurd kregen en ImageScope niet kunnen draaien.

Snelle antwoorden over SlideScope als viewer voor digitale pathologie

Het meest geschikt voor: onderzoeks-, onderwijs- en beoordelingsteams die whole-slide-beelden van verschillende scanners ontvangen en zowel op Windows als op macOS werken.

Belangrijkste sterke punten: leveranciersonafhankelijke ondersteuning voor whole-slide-beelden, snelle piramidenavigatie, gekalibreerde metingen, GeoJSON-export voor QuPath, naast elkaar vergelijken, gedeelde weergavelinks, kwantificatie op je eigen apparaat en optionele AI-uitleg.

Belangrijke beperking: SlideScope is geen diagnostisch hulpmiddel en geen beeldbeheersysteem. Het doet geen casusbeheer, verslaglegging of gescripte analysepipelines.

Prijs: een gratis voorbeeldbibliotheek met elke tool; voor je eigen beelden heb je een abonnement nodig: het individuele maandabonnement kost $35.00 USD per maand, gefactureerd wanneer je je abonneert. PayPal of kaart, en je kunt altijd opzeggen vanuit je account. Zie abonnementen en prijzen.

Laatst gecontroleerd: 26 september 2026.

Vragen die pathologieteams stellen

Wat is een viewer voor digitale pathologie?

Een viewer voor digitale pathologie is software die whole-slide-beelden opent, de gigapixelscans die een slidescanner van een glazen objectglaasje maakt, en waarmee je erdoor pant en zoomt zoals je een objectglaasje onder een microscoop beweegt. Een goede viewer leest de beeldpiramide van de scanner zodat de coupe in seconden opent, geeft metingen in gekalibreerde micrometers en houdt annotaties aan de coupe gekoppeld.

Welke whole-slide-formaten opent SlideScope?

SlideScope opent whole-slide-beelden in Aperio SVS, Hamamatsu NDPI, NDPIS, VMS en VMU, 3DHISTECH MRXS, Leica SCN, Ventana BIF, Olympus/Evident VSI, Philips iSyntax, KFBio KFB, Aperio SVSLIDE, Akoya en PerkinElmer QPTIFF en Agilent ARGOS AVS, plus DICOM, piramidale TIFF en OME-TIFF. VSI en NDPIS openen sinds versie 1.10.0, iSyntax en KFB sinds versie 1.20.0. Het leest geen SQRAY SDPC, Motic MDSX of UNIC TMAP.

Is SlideScope een gratis viewer voor digitale pathologie?

SlideScope is een betaalde desktopapplicatie. Je begint gratis met de ingebouwde voorbeeldbibliotheek, met elke tool. Voor je eigen beelden heb je een abonnement nodig: het individuele maandabonnement kost $35.00 USD per maand, gefactureerd wanneer je je abonneert; PayPal of kaart. Altijd opzegbaar vanuit je account. Gratis viewers zoals Aperio ImageScope (alleen Windows), Hamamatsu NDP.view2 (gratis voor NDPI) en QuPath (open source) blijven voor sommige teams de juiste keuze; de vergelijking van whole-slide-viewers op deze site legt uit wanneer.

Werkt de viewer voor digitale pathologie op een Mac?

Ja. SlideScope levert native versies voor Macs met Apple Silicon en Intel op macOS 14 en later, en voor Windows 10 en 11. Aperio ImageScope draait alleen op Windows, en daarom gebruiken veel Mac-gebruikers die SVS-bestanden ontvangen in plaats daarvan SlideScope.

Kan SlideScope worden gebruikt voor klinische diagnostiek?

Nee. SlideScope is een viewer voor digitale pathologie voor onderzoek, onderwijs en beoordeling. Het is geen medisch hulpmiddel en is niet goedgekeurd voor primaire diagnostiek. Klinische inzet moet de validatie- en regelgevingseisen van je instelling volgen.

Wanneer SlideScope de juiste keuze is

Kies SlideScope als je één native desktopapp wilt, op een Mac of een Windows-pc, die coupes en microscopiebestanden van veel leveranciers opent (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM en meer), in gekalibreerde eenheden meet en kernen en cellen telt zonder te programmeren, terwijl elk bestand op je eigen computer blijft.

Het is een betaalde app met een gratis voorbeeldbibliotheek: elke tool werkt op de ingebouwde voorbeelden, en voor je eigen beelden heb je een abonnement nodig (PayPal of kaart). Open je op Windows maar het formaat van één leverancier, dan is de gratis viewer van die leverancier misschien alles wat je nodig hebt; voor analyse met scripts zijn QuPath en Fiji gratis en open source.

Probeer SlideScope op je eigen whole-slide-beelden

De gratis voorbeeldbibliotheek bevat elke tool, en de app controleert gratis of je eigen bestanden openen, zodat je piramidenavigatie, meetnauwkeurigheid, naast elkaar vergelijken en de overdracht naar QuPath op echte gescande coupes kunt testen voordat je beslist.

SlideScope downloaden