Чем открыть файлы SVS
Файлы Aperio SVS можно открыть в Aperio ImageScope — бесплатной программе просмотра от Leica для Windows, которая больше активно не развивается; в QuPath — бесплатно в Windows, на Mac и в Linux; или в SlideScope — настольной программе просмотра для Windows и Mac с бесплатным пробным периодом. На Mac ImageScope использовать нельзя. В шагах ниже используется SlideScope.
Источник: Сравнение программ для просмотра полнослайдовых изображений (платформы и цены, у каждой — ссылка на источник) (на английском).
См. также: ImageScope на Mac: где скачать и альтернативы; Чтение файлов SVS в Python с помощью OpenSlide или tifffile (на английском).
Когда SlideScope является практичным выбором
- SVS Aperio для полноразмерных патологических слайдов
- Пользователям нужен настольный интерфейс без сценариев и настройки плагинов.
- Переключайтесь между каналами, Z-плоскостями, временными точками и сценами, если они есть в файле, проверьте размер пикселя в Details и измеряйте в калиброванных единицах.
- Измерения, заметки и области остаются привязанными к препарату и экспортируются в GeoJSON или CSV.
Выбор по рабочему процессу
Оцените SlideScope, если нужна одна настольная программа, которая открывает файлы разных микроскопов и считает стандартные объекты на вашем собственном компьютере. Оригинальная программа предпочтительнее для управления микроскопом, программируемой обработки, скриптовых конвейеров анализа или централизованного управления изображениями.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Расширяемой обработки, макросов, плагинов, сценариев, сегментации, анализа патологии и научных процессов Python.
OMERO: Централизованного хранилища, прав доступа, совместной работы и управления данными учреждения.
Независимость и товарные знаки
SlideScope является независимым продуктом и не связан с Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari или OMERO. Названия используются только для объективного сравнения.