TIFF・OME-TIFF ファイルを開く方法
通常の TIFF 画像は、Windows(フォト)や macOS(プレビュー)に標準搭載のビューアで開けます。16 ビットデータ、複数のチャンネル、Z スタック、ホールスライドのピラミッド構造を含む顕微鏡の TIFF や OME-TIFF ファイルは、それらのビューアでは真っ黒に見えたり、最初の画像しか表示されなかったりすることがよくあります。そうしたファイルは、ファイルをアップロードせずにブラウザ内で読み込む本サイトの無料オンライン TIFF ビューア、Windows・Mac・Linux で無料の Fiji や QuPath、または無料トライアル付きの Windows・Mac 向けデスクトップビューア SlideScope で開けます。以下の手順では SlideScope を使用します。
出典:ファイル互換性:SlideScope で開けるファイルとその制限(英語)。
関連情報:OME-TIFF ビューア:チャンネル、Z、時間、OME-XML をブラウザで確認(英語);顕微鏡 TIFF を JPG または PNG に変換する(英語)。
TIFF を開くと真っ黒、または何も表示されない?
顕微鏡カメラは輝度を 12 ビットまたは 16 ビットで記録しますが、写真ビューアはその範囲をそのまま画面に割り当てるため、範囲のごく一部しか使わない弱い信号は黒く表示されます。科学用ビューアは、代わりにデータに合わせてコントラストを引き伸ばします。本サイトのオンライン TIFF ビューア、Fiji、QuPath、SlideScope はいずれもそうしています。Fiji では「Image › Adjust › Brightness/Contrast」を開き、「Auto」をクリックしてください。
出典:オンライン TIFF ビューア:ブラウザで TIFF を開き、何もアップロードしません(英語)。