IMSファイルを開く方法
- お使いのパソコンに合うWindows版またはMac版をダウンロードしてインストールします。無料プレビューにアカウントは不要です。
- SlideScopeを開き、.imsファイルをビューアへドラッグします。
- シーンや位置がある場合は選択し、利用できるチャンネル、Zスライス、時点を確認します。
- 測定前にメタデータのピクセルサイズを確認します。エクスポート時も元のファイルを保持します。
顕微鏡画像ビューア
IMSファイルを開く方法
WindowsまたはmacOSのSlideScopeで、Imaris IMSファイル（Bitplane、現Oxford Instruments）を変換せずに開けます。チャンネルはファイルに保存された色と表示範囲で開き、焦点面はµm単位、タイムポイントは秒単位で表示されます。圧縮されたIMSファイルも開けます。SlideScopeはファイルのフル解像度レベルを読み込みます。ローカル表示では画像をアップロードしません。
CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.11.1
IMS ファイルを開く方法
| ツール | 費用 | 対応 OS | 主な用途 |
|---|---|---|---|
| Imaris Viewer | 無料（ダウンロードには登録フォームの入力が必要） | Windows、macOS（Apple シリコンおよび Intel） | メーカー純正の IMS 向け 3D・4D ビューア |
| Fiji / ImageJ と Bio-Formats | 無料・オープンソース | Windows、macOS、Linux | プラグインやマクロを使った解析 |
| SlideScope | 無料プレビュー（カード登録不要）、3 日間の無料トライアル、その後は月額 $25 からのサブスクリプション | Windows 10+、macOS 14+（Apple シリコンおよび Intel） | CZI、ND2、SVS、NDPI、MRXS、DICOM、TIFF とあわせて IMS を表示・計測・アノテーションでき、ファイルはお使いのコンピューター内に保持されます |
Imaris IMS ファイルは、Oxford Instruments の Windows・Mac 向け無料ビューア Imaris Viewer、Bio-Formats を介して Windows・Mac・Linux で IMS を読み込める Fiji、または無料トライアル付きの Windows・Mac 向けデスクトップビューア SlideScope で開けます。以下の手順では SlideScope を使用します。
SlideScopeが実用的な選択となる条件
- Imaris/Bitplane のマルチチャンネル画像の IMS
- スクリプトやプラグイン設定なしで使えるデスクトップ画面が必要である。
- ファイルに含まれるチャンネル、Z平面、タイムポイント、シーンを切り替えて確認し、Details でピクセルサイズを確認して、校正済みの単位で計測します。
- 計測、メモ、領域はスライドに紐づいたまま保持され、GeoJSON または CSV としてエクスポートできます。
ワークフロー別の選び方
複数形式の顕微鏡画像を一つのデスクトップ環境で開き、標準的な対象を自分のマシン上で定量したい場合はSlideScopeをご検討ください。顕微鏡制御、プログラム可能な画像処理、スクリプトによる解析パイプライン、組織全体の画像管理が必要な場合は、各専用製品が適します。
Fiji/ImageJ、QuPath、napari: 拡張可能な処理、マクロ、プラグイン、スクリプト、セグメンテーション、病理解析、Python科学計算。
OMERO: 画像の一元保管、権限管理、共同作業、組織的なデータ管理。
IMSファイルに関する質問
Fiji で IMS ファイルを開けますか？
はい。Fiji は Bio-Formats を介して、HDF5 ベースのバージョン 5.5 を含む Imaris IMS ファイルを読み込めます。Imaris Viewer も Windows と Mac 向けに無料で提供されています。 SlideScope は無料でダウンロードでき、ご自身の画像を開いて計測・アノテーションできる無料プレビュー（カード登録不要）と、全機能を 3 日間試せる無料トライアル（PayPal またはカードの登録が必要）をご利用いただけます。トライアル終了後はサブスクリプションになります。
MacでIMSを開く
macOS 14以降を使用してください。Macに合うApple Silicon版またはIntel版を選び、ファイルをローカルストレージにコピーしてから開きます。
ファイルを開けない場合
ファイルのコピーが完了しているか確認します。問題が続く場合は、アプリのバージョン、ファイル形式、エラーメッセージをサポートにお知らせください。
誰向けですか？
研究室、顕微鏡コア施設、教育現場、学生、病理レビューのチーム向けです。
形式のドキュメント
形式の原典ドキュメントをご覧ください。
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独立性と商標
SlideScopeは独立した製品であり、Leica Biosystems、ZEISS、Nikon、ImageJ、Fiji、QuPath、napari、OMEROとは提携していません。製品名は客観的な比較のためにのみ使用しています。
SlideScopeをダウンロード
全スライド画像、蛍光チャンネル、画像スタックを、WindowsとmacOSの一つの作業空間でじっくり確認できます。
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