OME-Zarrファイルを開く方法

SlideScopeが実用的な選択となる条件

• Olympus/Evident VSI、OIB/OIF・OIR、Zeiss ZVI・LSM、Leica LOF・XLEF、DeltaVision DV、MetaMorph STK・ND、Hamamatsu NDPIS、OME-Zarr（HCS プレートを含む）と、各ファイルが記録している装置設定
• スクリプトやプラグイン設定なしで使えるデスクトップ画面が必要である。
• ファイルに含まれるチャンネル、Z平面、タイムポイント、シーンを切り替えて確認し、Details でピクセルサイズを確認して、校正済みの単位で計測します。
• 計測、メモ、領域はスライドに紐づいたまま保持され、GeoJSON または CSV としてエクスポートできます。

ワークフロー別の選び方

複数形式の顕微鏡画像を一つのデスクトップ環境で開き、標準的な対象を自分のマシン上で定量したい場合はSlideScopeをご検討ください。顕微鏡制御、プログラム可能な画像処理、スクリプトによる解析パイプライン、組織全体の画像管理が必要な場合は、各専用製品が適します。

Fiji/ImageJ、QuPath、napari: 拡張可能な処理、マクロ、プラグイン、スクリプト、セグメンテーション、病理解析、Python科学計算。

OMERO: 画像の一元保管、権限管理、共同作業、組織的なデータ管理。