顕微鏡画像ビューア

MRXSファイルを開く方法

WindowsまたはmacOSのSlideScopeで、3DHISTECHのMRXSバーチャルスライドを事前変換せずに開けます。スライド全体を移動・拡大し、スキャナーのキャリブレーションに基づいてµm単位で計測し、アノテーションを追加できます。ローカル表示では画像をアップロードしません。

SlideScopeをダウンロード対応ファイル形式
CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.17.2

MRXSファイルを開く方法

  1. お使いのパソコンに合うWindows版またはMac版をダウンロードしてインストールします。内蔵のサンプルライブラリは、すべてのツールとともに無料でお使いいただけます。ご自身のスライドは無料トライアルで開けます（購入手続きでPayPalまたはカードの承認が必要です）。
  2. .mrxsファイルをビューアへドラッグするか、File › Open File…を選びます。スキャンしたスライドはローカルストレージから開きます。
  3. オーバービューで目的の領域へ移動し、拡大します。SlideScopeは画面の表示範囲に合ったピラミッド階層を読み込みます。
  4. 計測前にファイル詳細でピクセルサイズ（µm/px）を確認し、計測とアノテーションを行い、現在のビューを画像としてエクスポートします。

インストールのヘルプファイルや形式を報告代替候補

MRXS ファイルを開く方法

ツール費用対応 OS主な用途
3DHISTECH SlideViewerパートナーポータルから無料でダウンロードWindows 10 64 ビット以降。macOS 版の記載なしメーカー純正の MRXS ビューア
QuPath無料・オープンソースWindows、macOS、Linuxホールスライドイメージの解析プロジェクトとスクリプト処理
SlideScopeサンプルは全ツール付きで無料、ご自身の画像は 3 日間の無料トライアルで、その後は月額 $25 からのサブスクリプションWindows 10+、macOS 14+（Apple シリコンおよび Intel）CZI、ND2、SVS、NDPI、MRXS、DICOM、TIFF とあわせて MRXS を表示・計測・アノテーションでき、ファイルはお使いのコンピューター内に保持されます

3DHISTECH MRXS スライドは、3DHISTECH の Windows 向け無料ビューア SlideViewer、Windows・Mac・Linux で無料の QuPath、または無料トライアル付きの Windows・Mac 向けデスクトップビューア SlideScope で開けます。.mrxs ファイルは、同じ名前のデータフォルダと同じ場所に置いてください。以下の手順では SlideScope を使用します。

出典：ホールスライドイメージビューアの比較：対応 OS と価格、各項目に出典リンク付き（英語）。

関連情報：3DHISTECH SlideViewerのダウンロード先と、Mac版がない理由。

SlideScopeが実用的な選択となる条件

  • Hamamatsu、3DHISTECH、Leica、Ventana、Aperio、Vectra、Agilent ARGOS スキャナーの NDPI・VMS・VMU・MRXS・SCN・BIF・SVSLIDE・QPTIFF・AVS スライド
  • スクリプトやプラグイン設定なしで使えるデスクトップ画面が必要である。
  • ファイルに含まれるチャンネル、Z平面、タイムポイント、シーンを切り替えて確認し、Details でピクセルサイズを確認して、校正済みの単位で計測します。
  • 計測、メモ、領域はスライドに紐づいたまま保持され、GeoJSON または CSV としてエクスポートできます。

ワークフロー別の選び方

複数形式の顕微鏡画像を一つのデスクトップ環境で開き、標準的な対象を自分のマシン上で定量したい場合はSlideScopeをご検討ください。顕微鏡制御、プログラム可能な画像処理、スクリプトによる解析パイプライン、組織全体の画像管理が必要な場合は、各専用製品が適します。

Fiji/ImageJ、QuPath、napari: 拡張可能な処理、マクロ、プラグイン、スクリプト、セグメンテーション、病理解析、Python科学計算。

OMERO: 画像の一元保管、権限管理、共同作業、組織的なデータ管理。

MRXSファイルに関する質問

MRXS ファイルを無料で開く方法はありますか？

はい。3DHISTECH SlideViewer（Windows）と QuPath は無料です。 SlideScope は無料でダウンロードでき、内蔵のサンプルライブラリはすべてのツールとともに無料でお使いいただけます。ご自身の画像は 3 日間の無料トライアル（PayPal またはカードの登録が必要）で開けます。トライアル終了後はサブスクリプションになります。

MacでMRXSスライドを開く

SlideScopeはmacOS 14以降でネイティブに動作するため、メーカー製ビューアのためにWindows PCや仮想マシンを用意する必要はありません。Apple Silicon版またはIntel版を選び、スライドをローカルストレージにコピーしてから開きます。

スライドを開けない場合

.mrxsファイルはインデックスにすぎません。Slidedat.ini、Index.dat、Data*.datファイルを含む同名のデータフォルダと同じ場所に置き、両方をまとめてローカルストレージにコピーしてください。MRXSは共有リンクやリモートURLからは開けません。問題が続く場合は、アプリのバージョンとエラーメッセージをサポートにお知らせください。

誰向けですか？

研究室、顕微鏡コア施設、教育現場、学生、病理レビューのチーム向けです。

形式のドキュメント

形式の原典ドキュメントをご覧ください。

MRXS

日本語での関連検索

独立性と商標

SlideScopeは独立した製品であり、Leica Biosystems、ZEISS、Nikon、ImageJ、Fiji、QuPath、napari、OMEROとは提携していません。製品名は客観的な比較のためにのみ使用しています。

SlideScopeをダウンロード

全スライド画像、蛍光チャンネル、画像スタックを、WindowsとmacOSの一つの作業空間でじっくり確認できます。

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