显微镜图像查看器

如何打开 MRXS 文件

使用 Windows 或 macOS 版 SlideScope 打开 3DHISTECH MRXS 全切片图像,无需预先转换。平移和缩放整张切片,按扫描仪校准以 µm 测量,并添加注释。本地查看不会将图像上传到服务器。

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.17.2

如何打开 MRXS 文件

  1. 下载适合电脑的 Windows 或 Mac 版本并安装。内置示例库免费开放,所有工具均可使用;打开您自己的切片需开始免费试用,结账时需通过 PayPal 或银行卡授权。
  2. 将 .mrxs 文件拖入查看器,或选择 File › Open File…。请从本地存储打开扫描切片。
  3. 通过概览图跳转到目标区域,然后放大。SlideScope 会加载与屏幕显示区域相匹配的金字塔层级。
  4. 测量前在文件详情中检查像素大小(µm/px),然后进行测量、添加注释,并将当前视图导出为图像。

打开 MRXS 文件的方法

工具费用平台适用场景
3DHISTECH SlideViewer通过合作伙伴门户免费下载Windows 10 64 位或更高版本;未列出 macOS 版本厂商官方的 MRXS 查看器
QuPath免费、开源Windows、macOS、Linux全切片图像分析项目和脚本编写
SlideScope内置示例免费(所有工具),3 天免费试用可打开您自己的图像,之后订阅 $25/月起Windows 10+、macOS 14+(Apple 芯片和 Intel)查看、测量和标注 MRXS,同时支持 CZI、ND2、SVS、NDPI、MRXS、DICOM 和 TIFF,文件始终保存在您自己的电脑上

您可以使用 3DHISTECH 官方的免费 Windows 查看器 SlideViewer 打开 3DHISTECH MRXS 切片;也可以使用 QuPath,在 Windows、Mac 和 Linux 上均可免费使用;或者使用 SlideScope,一款适用于 Windows 和 Mac 的桌面查看器,提供免费试用。请将 .mrxs 文件与其同名数据文件夹放在同一位置。以下步骤以 SlideScope 为例。

来源:全切片图像查看器对比:平台与价格,均附来源链接(英文)。

另请参阅:在哪里下载 3DHISTECH SlideViewer,以及为什么没有 Mac 版。

何时适合选择 SlideScope

  • 来自 Hamamatsu、3DHISTECH、Leica、Ventana、Aperio、Vectra 和 Agilent ARGOS 扫描仪的 NDPI、VMS、VMU、MRXS、SCN、BIF、SVSLIDE、QPTIFF 和 AVS 切片
  • 审阅人员需要无需编写脚本或配置插件的桌面界面。
  • 在文件包含通道、Z 平面、时间点和场景时逐个浏览,在 Details 中检查像素尺寸,并以校准单位进行测量。
  • 测量、笔记和区域始终与切片关联,并可导出为 GeoJSON 或 CSV。

按工作流程选择

如果需要一款桌面软件既能统一打开多种显微文件、又能在本机完成常规对象定量,可评估 SlideScope。若需要显微镜控制、可编程图像处理、脚本化分析流程或机构级图像管理,应继续使用相应专业平台。

Fiji/ImageJ、QuPath、napari: 可扩展处理、宏、插件、脚本、分割、病理分析和 Python 科学计算流程。

OMERO: 集中式图像库、权限、协作和机构级数据管理。

关于 MRXS 文件的问题

有免费打开 MRXS 文件的方法吗?

有。3DHISTECH SlideViewer(Windows)和 QuPath 都是免费的。 SlideScope 可免费下载,内置示例库免费开放,所有工具均可使用;打开您自己的图像需开始 3 天免费试用(需绑定 PayPal 或银行卡);试用结束后转为订阅制。

在 Mac 上打开 MRXS 切片

SlideScope 原生支持 macOS 14 或更高版本,无需为厂商查看器准备 Windows 电脑或虚拟机。选择 Apple Silicon 或 Intel 版本,打开前将切片复制到本地存储。

切片无法打开时

.mrxs 文件只是索引。它必须与同名数据文件夹放在一起,该文件夹包含 Slidedat.ini、Index.dat 和 Data*.dat 文件;请将两者一起复制到本地存储。MRXS 无法通过共享链接或远程 URL 打开。如果仍然失败,请将应用版本和错误信息告知支持团队。

适合谁使用?

适合科研实验室、显微成像平台、教学用户和病理审阅团队。

格式文档

阅读原始格式文档。

MRXS

中文相关搜索词

独立性与商标说明

SlideScope 为独立产品,与 Leica Biosystems、ZEISS、Nikon、ImageJ、Fiji、QuPath、napari 或 OMERO 无关联。产品名称仅用于客观比较和替代方案检索。

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