Herramientas gratuitas para imágenes de microscopía

Herramientas

• Visor TIFF en líneaTIFF de 16 bits, multicanal, multipágina, OME-TIFF y TIFF piramidal en tu navegador
• Visor de metadatos TIFFTodas las etiquetas, OME-XML, metadatos de ImageJ y SVS, tamaño de píxel y campos identificables
• Visor SVS en líneaImágenes de lámina completa de Aperio con etiqueta, imagen macro y MPP, con zoom en tu navegador
• Visor OME-TIFFCanales, Z y tiempo a partir del OME-XML, con contraste por canal
• Conversor de TIFF a JPG/PNGTIFF de 16 bits, multicanal y multipágina a PNG o JPEG, con el contraste que tú definas
• Agregar una barra de escalaUna barra de escala calibrada en una micrografía PNG o JPEG
• Calculadoras de microscopíaAumento, campo de visión, resolución, tamaño de píxel, hemocitómetro, siembra

Cuándo usar una aplicación de escritorio

• SVS con JPEG 2000 (compresión Aperio 33003/33005), JPEG XR y JPEG XL no se pueden decodificar en un navegador sin WebAssembly, que esta página no carga.
• No basados en TIFF: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR y DICOM necesitan un lector de escritorio. NDPI es similar a TIFF, pero guarda cada nivel como un único JPEG enorme, demasiado grande para una pestaña del navegador.
• OME-TIFF con varias series muestra la primera serie.
• Sin mediciones, anotaciones ni análisis: es un visor.

Para esos formatos, y para medir, anotar y contar células en tus propias imágenes, SlideScope abre 34 formatos de microscopio y de escáner de láminas en Windows y Mac. SlideScope, la aplicación de microscopía de escritorio creada por el mismo equipo, es una aplicación de pago con una biblioteca de muestras gratuita (con todas las herramientas) y una suscripción para tus propias imágenes. Alternativas gratuitas: Fiji (Bio-Formats) y QuPath.

Preguntas