Бесплатные инструменты

Бесплатные инструменты для микроскопических изображений

Открывайте, изучайте и конвертируйте микроскопические и полнослайдовые изображения в браузере, добавляйте масштабную линейку и рассчитывайте увеличение, размер пикселя или число клеток. Все инструменты работают на вашем компьютере: файлы никогда не загружаются на сервер.

Открыть TIFFВсе инструменты

Инструменты

Когда лучше взять настольное приложение

  • SVS с JPEG 2000 (сжатие Aperio 33003/33005), JPEG XR и JPEG XL невозможно декодировать в браузере без WebAssembly, а эта страница его не загружает.
  • Форматы не на основе TIFF: для CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR и DICOM нужна настольная программа. NDPI похож на TIFF, но хранит каждый уровень как один огромный JPEG, слишком большой для вкладки браузера.
  • OME-TIFF с несколькими сериями: показывается первая серия.
  • Никаких измерений, аннотаций и анализа: это только просмотрщик.

Для этих форматов, а также для измерений, аннотаций и подсчёта клеток на собственных изображениях SlideScope открывает 34 формата микроскопов и сканеров слайдов в Windows и на Mac. SlideScope — настольное приложение для микроскопии от той же команды — платное, с бесплатной библиотекой образцов (все инструменты) и подпиской для ваших собственных изображений. Бесплатные альтернативы: Fiji (Bio-Formats) и QuPath.

Вопросы

Эти инструменты бесплатные?

Да. Они бесплатны, не требуют учётной записи и работают в браузере. SlideScope — настольное приложение для микроскопии от той же команды — платное, с бесплатной библиотекой образцов (все инструменты) и подпиской для собственных изображений.

Загружаются ли мои изображения?

Нет. Каждый инструмент читает файл на вашем компьютере и работает внутри страницы; на сервер ничего не отправляется.

Какие файлы открывают просмотрщики?

TIFF и BigTIFF (от 8 до 32 бит), OME-TIFF, ImageJ TIFF, пирамидальные TIFF и Aperio SVS со сжатием JPEG. Для CZI, ND2, LIF, MRXS, NDPI и SVS с JPEG 2000 нужна настольная программа.

Работают ли они на телефоне?

Да, в любом современном браузере, хотя большие слайды удобнее изучать на компьютере.

Нужно больше, чем умеет браузер?

SlideScope открывает 34 формата микроскопов и сканеров слайдов в Windows и на Mac, в том числе CZI, ND2, LIF, MRXS и SVS с JPEG 2000, с измерениями, аннотациями, подсчётом клеток и экспортом в OME-TIFF в полном разрешении. Попробуйте все инструменты бесплатно на встроенных образцах; чтобы открывать собственные изображения, нужна подписка. Уже решили? Оформите подписку.

Скачать SlideScope