Gratis tools voor microscopiebeelden

Tools

• Online TIFF-viewer16-bit, meerdere kanalen, meerdere pagina's, OME-TIFF en piramidale TIFF in je browser
• TIFF-metadataviewerElke tag, OME-XML-, ImageJ- en SVS-metadata, pixelgrootte en identificerende velden
• SVS-viewer onlineAperio-whole-slide-beelden met label, macro en MPP, zoombaar in je browser
• OME-TIFF-viewerKanalen, Z en tijd uit de OME-XML, met contrast per kanaal
• TIFF-naar-JPG/PNG-converter16-bit-TIFF's, TIFF's met meerdere kanalen en met meerdere pagina's naar PNG of JPEG, met het contrast dat jij instelt
• Een schaalbalk toevoegenEen gekalibreerde schaalbalk op een microfoto in PNG of JPEG
• MicroscopiecalculatorsVergroting, beeldveld, resolutie, pixelgrootte, hemocytometer, celzaaiing

Wanneer je beter een desktopapp gebruikt

• JPEG 2000-SVS (Aperio-compressie 33003/33005), JPEG XR en JPEG XL kunnen in een browser niet worden gedecodeerd zonder WebAssembly, en dat laadt deze pagina niet.
• Niet op TIFF gebaseerd: CZI, ND2, LIF, MRXS, VSI, IMS, OIB/OIR en DICOM hebben een desktoplezer nodig. NDPI lijkt op TIFF, maar slaat elk niveau op als één enorme JPEG, te groot voor een browsertabblad.
• OME-TIFF met meerdere series toont de eerste serie.
• Geen metingen, annotaties of analyse: het is een viewer.

Voor die formaten, en om te meten, te annoteren en cellen te tellen op je eigen beelden, opent SlideScope 34 formaten van microscopen en slidescanners op Windows en Mac. SlideScope, de desktopapp voor microscopie van hetzelfde team, is een betaalde app met een gratis voorbeeldbibliotheek (elke tool) en een abonnement voor je eigen beelden. Gratis alternatieven: Fiji (Bio-Formats) en QuPath.

Vragen