visionneuse d’images de microscopie

Comment ouvrir des fichiers LIF

Ouvrez les fichiers Leica LIF issus de LAS X dans SlideScope sous Windows ou macOS sans conversion préalable. Les canaux conservent leurs noms et couleurs réels, les plans focaux sont exprimés en µm et les points temporels en secondes, et le panneau Details affiche les réglages enregistrés dans le fichier, comme l’objectif, les raies laser, les détecteurs et les gains. Les acquisitions en mosaïque s’ouvrent sous forme de positions disposées dans la vue XY Overview. Un projet LIF qui contient plusieurs images s’ouvre sur sa première image. La visualisation locale ne téléverse pas l’image.

Télécharger SlideScopeformats de fichiers pris en charge
CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.11.1

Comment ouvrir des fichiers LIF

  1. Téléchargez la version Windows ou Mac adaptée et installez-la. L’aperçu gratuit ne demande aucun compte.
  2. Ouvrez SlideScope et faites glisser votre fichier .lif dans la visionneuse.
  3. Sélectionnez la scène ou position, si présente, puis examinez les canaux, plans Z et points temporels disponibles.
  4. Vérifiez la taille des pixels dans les métadonnées avant de mesurer. Conservez le fichier original lors de l’export.

Aide à l’installationSignaler un fichier ou un formatAlternatives

Logiciels pour ouvrir les fichiers LIF

OutilPrixPlateformesIdéal pour
Leica LAS X OfficeGratuit (formulaire d’inscription pour télécharger)Windows 10/11, 64 bitsLa visionneuse de Leica : piles Z, projections, barres d’échelle, export TIFF
Fiji / ImageJ avec Bio-FormatsGratuit, open sourceWindows, macOS, LinuxToutes les images d’un projet ; analyse avec plugins et macros
SlideScopeAperçu gratuit (sans carte bancaire), essai gratuit de 3 jours, puis abonnement à partir de $25/moisWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon et Intel)Visualiser, mesurer et annoter des fichiers LIF aux côtés des CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM et TIFF, en gardant les fichiers sur votre ordinateur

Vous pouvez ouvrir les fichiers Leica LIF avec LAS X Office, la visionneuse gratuite de Leica pour Windows ; avec Fiji, gratuit, qui lit les LIF via Bio-Formats sous Windows, Mac et Linux ; ou avec SlideScope, une visionneuse de bureau pour Windows et Mac avec essai gratuit. SlideScope ouvre la première image d’un projet LIF qui en contient plusieurs ; Fiji permet de choisir n’importe laquelle. Les étapes ci-dessous utilisent SlideScope.

Source : Compatibilité des fichiers : ce que SlideScope ouvre, et ses limites (en anglais).

Quand SlideScope constitue un choix pratique

  • LIF Leica pour microscopie confocale et à champ large
  • Les examinateurs ont besoin d’une interface de bureau sans scripts ni modules à installer.
  • Parcourez les canaux, plans Z, points temporels et scènes lorsque le fichier en contient, vérifiez la taille de pixel dans Details et mesurez en unités étalonnées.
  • Les mesures, notes et régions restent attachées à la lame et s’exportent en GeoJSON ou CSV.

Choisir selon le flux de travail

Évaluez SlideScope si vous cherchez une application de bureau qui ouvre plusieurs formats de microscopie et quantifie les objets courants sur votre propre machine. Gardez l’outil d’origine pour le pilotage du microscope, le traitement programmable, les chaînes d’analyse scriptées ou la gestion institutionnelle des images.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Traitement extensible, macros, modules, scripts, segmentation, analyse en pathologie et flux Python scientifiques.

OMERO: Référentiel central, droits d’accès, collaboration et gestion institutionnelle des données.

Questions sur les fichiers LIF

Fiji peut-il ouvrir les fichiers LIF ?

Oui. Fiji ouvre les fichiers LIF via Bio-Formats et permet de choisir quelle image d’un projet ouvrir. LAS X Office de Leica est également gratuit, sous Windows. SlideScope se télécharge gratuitement, avec un aperçu gratuit qui permet d’ouvrir, de mesurer et d’annoter vos propres images (sans carte bancaire) et un essai gratuit de 3 jours de toutes les fonctionnalités (PayPal ou carte bancaire requis) ; après l’essai, SlideScope est un abonnement.

Ouvrir LIF sur un Mac

Utilisez macOS 14 ou ultérieur. Choisissez la version Apple Silicon ou Intel adaptée à votre Mac et copiez le fichier en local avant de l’ouvrir.

Si le fichier ne s’ouvre pas

Vérifiez que la copie est terminée. Si le problème persiste, contactez l’assistance en indiquant la version de l’application, le format et le message d’erreur.

À qui s’adresse SlideScope ?

Aux laboratoires de recherche, plateformes de microscopie, enseignants et équipes de revue en pathologie qui ont besoin d’un outil de consultation pratique.

Documentation du format

Consultez la documentation originale du format.

LIF

Recherches associées en français

Indépendance et marques

SlideScope est indépendant et n’est affilié ni à Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari, ni à OMERO. Les noms servent uniquement à une comparaison factuelle.

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Explorez des lames entières, des canaux de fluorescence et des piles d’images dans un espace de travail dédié pour Windows et macOS.

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