Ouvrez des images OME-Zarr (OME-NGFF 0.4 et 0.5) dans SlideScope sous Windows ou macOS, y compris les plaques HCS avec chaque puits et chaque champ, ainsi que les sorties de bioformats2raw avec leurs métadonnées OME-XML. Les puits d’une plaque peuvent être parcourus un par un ou affichés ensemble dans la vue XY Overview. OME-Zarr s’ouvre uniquement depuis des dossiers locaux, pas depuis des liens https distants.
VSI, OIB/OIF et OIR Olympus/Evident, ZVI et LSM Zeiss, LOF et XLEF Leica, DV DeltaVision, STK et ND MetaMorph, NDPIS Hamamatsu et OME-Zarr (y compris les plaques HCS), avec les réglages d’instrument enregistrés dans chaque fichier
Les examinateurs ont besoin d’une interface de bureau sans scripts ni modules à installer.
Parcourez les canaux, plans Z, points temporels et scènes lorsque le fichier en contient, vérifiez la taille de pixel dans Details et mesurez en unités étalonnées.
Les mesures, notes et régions restent attachées à la lame et s’exportent en GeoJSON ou CSV.
Choisir selon le flux de travail
Évaluez SlideScope si vous cherchez une application de bureau qui ouvre plusieurs formats de microscopie et quantifie les objets courants sur votre propre machine. Gardez l’outil d’origine pour le pilotage du microscope, le traitement programmable, les chaînes d’analyse scriptées ou la gestion institutionnelle des images.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Traitement extensible, macros, modules, scripts, segmentation, analyse en pathologie et flux Python scientifiques.
OMERO: Référentiel central, droits d’accès, collaboration et gestion institutionnelle des données.
Questions sur les fichiers OME-Zarr
Ouvrir OME-Zarr sur un Mac
Utilisez macOS 14 ou ultérieur. Choisissez la version Apple Silicon ou Intel adaptée à votre Mac et copiez le fichier en local avant de l’ouvrir.
Si le fichier ne s’ouvre pas
Vérifiez que la copie est terminée. Si le problème persiste, contactez l’assistance en indiquant la version de l’application, le format et le message d’erreur.
À qui s’adresse SlideScope ?
Aux laboratoires de recherche, plateformes de microscopie, enseignants et équipes de revue en pathologie qui ont besoin d’un outil de consultation pratique.
SlideScope est indépendant et n’est affilié ni à Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari, ni à OMERO. Les noms servent uniquement à une comparaison factuelle.
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Explorez des lames entières, des canaux de fluorescence et des piles d’images dans un espace de travail dédié pour Windows et macOS.