Como abrir ficheiros LIF
Pode abrir ficheiros Leica LIF com o LAS X Office, o visualizador gratuito da Leica para Windows; com o Fiji, que é gratuito e lê LIF através do Bio-Formats em Windows, Mac e Linux; ou com o SlideScope, um visualizador para computador, para Windows e Mac, com avaliação gratuita. O SlideScope abre a primeira imagem de um projeto LIF que contenha várias; o Fiji permite escolher qualquer uma delas. Os passos abaixo utilizam o SlideScope.
Fonte: Compatibilidade de ficheiros: o que o SlideScope abre e os seus limites (em inglês).
Quando o SlideScope é uma opção prática
- LIF da Leica para microscopia confocal e de campo largo
- Os revisores precisam de uma interface para computador sem scripts nem configuração de suplementos.
- Percorra canais, planos Z, pontos temporais e cenas quando o ficheiro os tiver, verifique o tamanho de píxel em Details e meça em unidades calibradas.
- As medições, notas e regiões ficam associadas à lâmina e são exportadas como GeoJSON ou CSV.
Escolha de acordo com o fluxo de trabalho
Avalie o SlideScope quando precisar de uma única aplicação para computador que abra vários formatos e quantifique objetos padrão na sua própria máquina. Mantenha a ferramenta original quando necessitar de controlar o microscópio, programar processamento de imagem, criar pipelines com scripts ou gerir imagens a nível institucional.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Processamento extensível, macros, suplementos, scripts, segmentação, análise patológica e fluxos científicos em Python.
OMERO: Repositórios centrais de imagens, permissões, colaboração e gestão institucional de dados.
Independência e marcas
O SlideScope é independente e não está associado à Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ou OMERO. Os nomes são utilizados apenas para comparações factuais.