Logiciels pour ouvrir les fichiers NDPI
Vous pouvez ouvrir les fichiers Hamamatsu NDPI avec NDP.view2, la visionneuse gratuite de Hamamatsu pour Windows et macOS ; avec QuPath, gratuit sous Windows, Mac et Linux ; ou avec SlideScope, une visionneuse de bureau pour Windows et Mac avec bibliothèque d’échantillons gratuite. Les étapes ci-dessous utilisent SlideScope.
Source : Comparatif des visionneuses de lames virtuelles : plateformes et prix, chacun lié à sa source (en anglais).
Voir aussi : Hamamatsu NDP.view2 : où le télécharger, la prise en charge du Mac et les alternatives.
Quand SlideScope constitue un choix pratique
- Lames de scanner NDPI, VMS, VMU, MRXS, SCN, BIF, SVSLIDE, QPTIFF et AVS de Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana, Aperio, Vectra et Agilent ARGOS
- Les examinateurs ont besoin d’une interface de bureau sans scripts ni modules à installer.
- Parcourez les canaux, plans Z, points temporels et scènes lorsque le fichier en contient, vérifiez la taille de pixel dans Details et mesurez en unités étalonnées.
- Les mesures, notes et régions restent attachées à la lame et s’exportent en GeoJSON ou CSV.
Choisir selon le flux de travail
Évaluez SlideScope si vous cherchez une application de bureau qui ouvre plusieurs formats de microscopie et quantifie les objets courants sur votre propre machine. Gardez l’outil d’origine pour le pilotage du microscope, le traitement programmable, les chaînes d’analyse scriptées ou la gestion institutionnelle des images.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Traitement extensible, macros, modules, scripts, segmentation, analyse en pathologie et flux Python scientifiques.
OMERO: Référentiel central, droits d’accès, collaboration et gestion institutionnelle des données.
Indépendance et marques
SlideScope est indépendant et n’est affilié ni à Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari, ni à OMERO. Les noms servent uniquement à une comparaison factuelle.