программа для просмотра микроскопических изображений

Как открыть файлы LIF

Открывайте файлы Leica LIF из LAS X в SlideScope на Windows или macOS без преобразования. Каналы сохраняют настоящие названия и цвета, фокальные плоскости указаны в µm, временные точки — в секундах, а панель Details показывает настройки, записанные в файле, например объектив, лазерные линии, детекторы и их усиление. Мозаичные сканы открываются как позиции, размещённые в XY Overview. Из проекта LIF с несколькими изображениями открывается первое изображение. Локальный просмотр не загружает изображение на сервер.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.11.1

Как открыть файлы LIF

  1. Скачайте версию для своего компьютера Windows или Mac и установите её. Для бесплатного предпросмотра учётная запись не нужна.
  2. Откройте SlideScope и перетащите файл .lif в окно просмотра.
  3. Выберите сцену или позицию, если они есть, затем просмотрите доступные каналы, Z-срезы и временные точки.
  4. Перед измерением проверьте размер пикселя в метаданных. При экспорте сохраните исходный файл.

Чем открыть файлы LIF

ПрограммаСтоимостьПлатформыПодходит для
Leica LAS X OfficeБесплатно (для скачивания нужно заполнить регистрационную форму)Windows 10/11, 64-битСобственная программа Leica: Z-стеки, проекции, масштабные линейки, экспорт в TIFF
Fiji / ImageJ с Bio-FormatsБесплатно, открытый исходный кодWindows, macOS, LinuxЛюбое изображение проекта; анализ с плагинами и макросами
SlideScopeБесплатный предварительный просмотр (без карты), бесплатный пробный период (3 дн.), затем подписка от $25 в месяцWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon и Intel)Просмотр, измерение и аннотирование файлов LIF наряду с CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM и TIFF; файлы остаются на вашем компьютере

Файлы Leica LIF можно открыть в LAS X Office — бесплатной программе просмотра от Leica для Windows; в Fiji, который бесплатен и читает LIF через Bio-Formats в Windows, на Mac и в Linux; или в SlideScope — настольной программе просмотра для Windows и Mac с бесплатным пробным периодом. SlideScope открывает первое изображение проекта LIF, содержащего несколько изображений; в Fiji можно выбрать любое из них. В шагах ниже используется SlideScope.

Источник: Совместимость файлов: что открывает SlideScope и каковы ограничения (на английском).

Когда SlideScope является практичным выбором

  • LIF для конфокальной и широкопольной микроскопии Leica
  • Пользователям нужен настольный интерфейс без сценариев и настройки плагинов.
  • Переключайтесь между каналами, Z-плоскостями, временными точками и сценами, если они есть в файле, проверьте размер пикселя в Details и измеряйте в калиброванных единицах.
  • Измерения, заметки и области остаются привязанными к препарату и экспортируются в GeoJSON или CSV.

Выбор по рабочему процессу

Оцените SlideScope, если нужна одна настольная программа, которая открывает файлы разных микроскопов и считает стандартные объекты на вашем собственном компьютере. Оригинальная программа предпочтительнее для управления микроскопом, программируемой обработки, скриптовых конвейеров анализа или централизованного управления изображениями.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Расширяемой обработки, макросов, плагинов, сценариев, сегментации, анализа патологии и научных процессов Python.

OMERO: Централизованного хранилища, прав доступа, совместной работы и управления данными учреждения.

Вопросы о файлах LIF

Может ли Fiji открыть файлы LIF?

Да. Fiji открывает файлы LIF через Bio-Formats и позволяет выбрать, какое изображение проекта открыть. Программа LAS X Office от Leica тоже бесплатна, для Windows. SlideScope можно скачать бесплатно: есть бесплатный режим предварительного просмотра, в котором можно открывать, измерять и аннотировать собственные изображения (без карты), и бесплатный пробный период (3 дн.) со всеми функциями (нужен PayPal или карта); после пробного периода программа работает по подписке.

Открытие LIF на Mac

Используйте macOS 14 или новее. Выберите сборку Apple Silicon или Intel для своего Mac и перед открытием скопируйте файл на локальный диск.

Если файл не открывается

Убедитесь, что копирование завершено. Если ошибка остаётся, сообщите поддержке версию приложения, формат файла и текст ошибки.

Для кого предназначен SlideScope?

Для исследовательских лабораторий, центров микроскопии, преподавателей, студентов и групп просмотра патологических изображений.

Документация формата

Прочитайте исходную документацию формата.

LIF

Связанные запросы на русском языке

Независимость и товарные знаки

SlideScope является независимым продуктом и не связан с Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari или OMERO. Названия используются только для объективного сравнения.

Скачать SlideScope

Изучайте целые препараты, каналы флуоресценции и стеки изображений в едином удобном рабочем пространстве для Windows и macOS.

Скачать SlideScope

Файл не открывается или формата нет в списке? Сообщить о файле или формате