visualizador de imagens de microscopia

Como abrir ficheiros LSM

Abra ficheiros LSM de microscópios confocais Zeiss, do LSM 510 ao LSM 980, no SlideScope para Windows ou macOS sem conversão prévia. O painel Details mostra as definições que o ficheiro regista, como a objetiva, os lasers, os detetores e os respetivos ganhos, e o pinhole; os canais mantêm os nomes e cores reais, os planos focais aparecem em µm e os pontos temporais em segundos. A visualização local não envia a imagem para um servidor.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.10.0

Como abrir ficheiros LSM

  1. Transfira a versão Windows ou Mac adequada ao computador e instale-a. A pré-visualização gratuita não precisa de conta.
  2. Abra o SlideScope e arraste o ficheiro .lsm para o visualizador.
  3. Selecione a cena ou posição, se existir, e examine os canais, cortes Z e pontos temporais disponíveis.
  4. Verifique o tamanho do píxel nos metadados antes de medir. Guarde o ficheiro original ao exportar.

Quando o SlideScope é uma opção prática

  • VSI, OIB/OIF e OIR da Olympus/Evident, ZVI e LSM da Zeiss, LOF e XLEF da Leica, DV da DeltaVision, STK e ND do MetaMorph, NDPIS da Hamamatsu e OME-Zarr (incluindo placas HCS), com as definições do instrumento que cada ficheiro regista
  • Os revisores precisam de uma interface para computador sem scripts nem configuração de suplementos.
  • Percorra canais, planos Z, pontos temporais e cenas quando o ficheiro os tiver, verifique o tamanho de píxel em Details e meça em unidades calibradas.
  • As medições, notas e regiões ficam associadas à lâmina e são exportadas como GeoJSON ou CSV.

Escolha de acordo com o fluxo de trabalho

Avalie o SlideScope quando precisar de uma única aplicação para computador que abra vários formatos e quantifique objetos padrão na sua própria máquina. Mantenha a ferramenta original quando necessitar de controlar o microscópio, programar processamento de imagem, criar pipelines com scripts ou gerir imagens a nível institucional.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Processamento extensível, macros, suplementos, scripts, segmentação, análise patológica e fluxos científicos em Python.

OMERO: Repositórios centrais de imagens, permissões, colaboração e gestão institucional de dados.

Perguntas sobre ficheiros LSM

Abrir LSM num Mac

Use macOS 14 ou posterior. Escolha a versão Apple Silicon ou Intel adequada ao Mac e copie o ficheiro para armazenamento local antes de o abrir.

Se o ficheiro não abrir

Confirme que a cópia terminou. Se o erro persistir, contacte o suporte com a versão da aplicação, o formato e a mensagem de erro.

A quem se destina?

A laboratórios de investigação, unidades de microscopia, docentes, estudantes e equipas de revisão de imagens de patologia.

Documentação do formato

Consulte a documentação original do formato.

LSM

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Independência e marcas

O SlideScope é independente e não está associado à Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ou OMERO. Os nomes são utilizados apenas para comparações factuais.

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