Como abrir ficheiros NDPI
Pode abrir ficheiros Hamamatsu NDPI com o NDP.view2, o visualizador gratuito da Hamamatsu para Windows e macOS; com o QuPath, gratuito em Windows, Mac e Linux; ou com o SlideScope, um visualizador para computador, para Windows e Mac, com biblioteca de amostras gratuita. Os passos abaixo utilizam o SlideScope.
Fonte: Comparação de visualizadores de imagens de lâmina completa (plataformas e preços, cada um com ligação à respetiva fonte) (em inglês).
Ver também: Hamamatsu NDP.view2: onde o transferir, suporte para Mac e as alternativas (em inglês).
Quando o SlideScope é uma opção prática
- Lâminas de scanner NDPI, VMS, VMU, MRXS, SCN, BIF, SVSLIDE, QPTIFF e AVS da Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana, Aperio, Vectra e Agilent ARGOS
- Os revisores precisam de uma interface para computador sem scripts nem configuração de suplementos.
- Percorra canais, planos Z, pontos temporais e cenas quando o ficheiro os tiver, verifique o tamanho de píxel em Details e meça em unidades calibradas.
- As medições, notas e regiões ficam associadas à lâmina e são exportadas como GeoJSON ou CSV.
Escolha de acordo com o fluxo de trabalho
Avalie o SlideScope quando precisar de uma única aplicação para computador que abra vários formatos e quantifique objetos padrão na sua própria máquina. Mantenha a ferramenta original quando necessitar de controlar o microscópio, programar processamento de imagem, criar pipelines com scripts ou gerir imagens a nível institucional.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Processamento extensível, macros, suplementos, scripts, segmentação, análise patológica e fluxos científicos em Python.
OMERO: Repositórios centrais de imagens, permissões, colaboração e gestão institucional de dados.
Independência e marcas
O SlideScope é independente e não está associado à Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ou OMERO. Os nomes são utilizados apenas para comparações factuais.