visualizador de imagens de microscopia

Como abrir ficheiros NDPI

Abra imagens de lâmina inteira Hamamatsu NDPI no SlideScope para Windows ou macOS sem conversão prévia. Percorra e amplie a lâmina completa, meça em µm com a calibração do scanner e adicione anotações. A visualização local não envia a imagem para um servidor.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.23.0

Como abrir ficheiros NDPI

  1. Transfira a versão Windows ou Mac adequada ao computador e instale-a. A biblioteca de amostras incluída é gratuita, com todas as ferramentas; para abrir as suas próprias lâminas precisa de uma subscrição.
  2. Arraste o ficheiro .ndpi para o visualizador ou escolha File › Open File… Abra as lâminas digitalizadas a partir do armazenamento local.
  3. Use a vista geral para saltar para uma região e depois amplie. O SlideScope carrega o nível da pirâmide que corresponde ao que está no ecrã.
  4. Verifique o tamanho do píxel (µm/px) nos detalhes do ficheiro antes de medir; depois meça, anote e exporte a vista atual como imagem.

Como abrir ficheiros NDPI

FerramentaCustoPlataformasIdeal para
Hamamatsu NDP.view2Gratuito com lâminas Hamamatsu (o NDP.view2 Plus é pago)Windows 10/11, macOS 13–26 (Apple silicon e Intel)O visualizador do próprio fabricante para NDPI
QuPathGratuito, código abertoWindows, macOS, LinuxProjetos de análise de imagens de lâmina completa e criação de scripts
SlideScopeAmostras gratuitas com todas as ferramentas e depois subscrição a partir de $35/mês para as suas próprias imagensWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon e Intel)Visualizar, medir e anotar NDPI a par de CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM e TIFF, com os ficheiros guardados no seu computador

Pode abrir ficheiros Hamamatsu NDPI com o NDP.view2, o visualizador gratuito da Hamamatsu para Windows e macOS; com o QuPath, gratuito em Windows, Mac e Linux; ou com o SlideScope, um visualizador para computador, para Windows e Mac, com biblioteca de amostras gratuita. Os passos abaixo utilizam o SlideScope.

Fonte: Comparação de visualizadores de imagens de lâmina completa (plataformas e preços, cada um com ligação à respetiva fonte) (em inglês).

Ver também: Hamamatsu NDP.view2: onde o transferir, suporte para Mac e as alternativas (em inglês).

Quando o SlideScope é uma opção prática

  • Lâminas de scanner NDPI, VMS, VMU, MRXS, SCN, BIF, SVSLIDE, QPTIFF e AVS da Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana, Aperio, Vectra e Agilent ARGOS
  • Os revisores precisam de uma interface para computador sem scripts nem configuração de suplementos.
  • Percorra canais, planos Z, pontos temporais e cenas quando o ficheiro os tiver, verifique o tamanho de píxel em Details e meça em unidades calibradas.
  • As medições, notas e regiões ficam associadas à lâmina e são exportadas como GeoJSON ou CSV.

Escolha de acordo com o fluxo de trabalho

Avalie o SlideScope quando precisar de uma única aplicação para computador que abra vários formatos e quantifique objetos padrão na sua própria máquina. Mantenha a ferramenta original quando necessitar de controlar o microscópio, programar processamento de imagem, criar pipelines com scripts ou gerir imagens a nível institucional.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Processamento extensível, macros, suplementos, scripts, segmentação, análise patológica e fluxos científicos em Python.

OMERO: Repositórios centrais de imagens, permissões, colaboração e gestão institucional de dados.

Perguntas sobre ficheiros NDPI

Existe uma forma gratuita de abrir ficheiros NDPI?

Sim. O NDP.view2 da Hamamatsu e o QuPath são gratuitos. O SlideScope pode ser transferido gratuitamente: a biblioteca de amostras incluída é gratuita, com todas as ferramentas, e a aplicação verifica gratuitamente se os seus próprios ficheiros abrem; para abrir as suas próprias imagens precisa de uma subscrição a partir de $35/mês.

Abrir lâminas NDPI num Mac

O SlideScope funciona nativamente no macOS 14 ou posterior, pelo que não precisa de um PC Windows nem de uma máquina virtual para o visualizador do fabricante. Escolha a versão Apple Silicon ou Intel e copie a lâmina para armazenamento local antes de a abrir.

Se a lâmina não abrir

Confirme que o ficheiro foi totalmente copiado para armazenamento local. Se o erro persistir, contacte o suporte com a versão da aplicação, o formato do ficheiro e a mensagem de erro.

A quem se destina?

A laboratórios de investigação, unidades de microscopia, docentes, estudantes e equipas de revisão de imagens de patologia.

Documentação do formato

Consulte a documentação original do formato.

NDPI

Pesquisas relacionadas em português

Independência e marcas

O SlideScope é independente e não está associado à Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ou OMERO. Os nomes são utilizados apenas para comparações factuais.

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