visualizador de imagens de microscopia

Como abrir ficheiros IMS

Abra ficheiros Imaris IMS (Bitplane, agora Oxford Instruments) no SlideScope para Windows ou macOS sem conversão prévia. Os canais abrem com as cores e os intervalos de visualização guardados no ficheiro, os planos focais aparecem em µm e os pontos temporais em segundos, e os ficheiros IMS comprimidos também abrem. O SlideScope lê o nível de resolução total do ficheiro. A visualização local não envia a imagem para um servidor.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.11.1

Como abrir ficheiros IMS

  1. Transfira a versão Windows ou Mac adequada ao computador e instale-a. A pré-visualização gratuita não precisa de conta.
  2. Abra o SlideScope e arraste o ficheiro .ims para o visualizador.
  3. Selecione a cena ou posição, se existir, e examine os canais, cortes Z e pontos temporais disponíveis.
  4. Verifique o tamanho do píxel nos metadados antes de medir. Guarde o ficheiro original ao exportar.

Como abrir ficheiros IMS

FerramentaCustoPlataformasIdeal para
Imaris ViewerGratuito (é necessário preencher um formulário de registo para transferir)Windows, macOS (Apple silicon e Intel)O visualizador 3D e 4D do próprio fabricante para IMS
Fiji / ImageJ com Bio-FormatsGratuito, código abertoWindows, macOS, LinuxAnálise com plugins e macros
SlideScopePré-visualização gratuita (sem cartão), avaliação gratuita de 3 dias e depois subscrição a partir de $25/mêsWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon e Intel)Visualizar, medir e anotar IMS a par de CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM e TIFF, com os ficheiros guardados no seu computador

Pode abrir ficheiros Imaris IMS com o Imaris Viewer, o visualizador gratuito da Oxford Instruments para Windows e Mac; com o Fiji, que lê IMS através do Bio-Formats em Windows, Mac e Linux; ou com o SlideScope, um visualizador para computador, para Windows e Mac, com avaliação gratuita. Os passos abaixo utilizam o SlideScope.

Fonte: Compatibilidade de ficheiros: o que o SlideScope abre e os seus limites (em inglês).

Quando o SlideScope é uma opção prática

  • IMS do Imaris/Bitplane para imagens multicanal
  • Os revisores precisam de uma interface para computador sem scripts nem configuração de suplementos.
  • Percorra canais, planos Z, pontos temporais e cenas quando o ficheiro os tiver, verifique o tamanho de píxel em Details e meça em unidades calibradas.
  • As medições, notas e regiões ficam associadas à lâmina e são exportadas como GeoJSON ou CSV.

Escolha de acordo com o fluxo de trabalho

Avalie o SlideScope quando precisar de uma única aplicação para computador que abra vários formatos e quantifique objetos padrão na sua própria máquina. Mantenha a ferramenta original quando necessitar de controlar o microscópio, programar processamento de imagem, criar pipelines com scripts ou gerir imagens a nível institucional.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Processamento extensível, macros, suplementos, scripts, segmentação, análise patológica e fluxos científicos em Python.

OMERO: Repositórios centrais de imagens, permissões, colaboração e gestão institucional de dados.

Perguntas sobre ficheiros IMS

O Fiji consegue abrir ficheiros IMS?

Sim. O Fiji lê ficheiros Imaris IMS, incluindo a versão 5.5 baseada em HDF5, através do Bio-Formats. O Imaris Viewer também é gratuito, no Windows e no Mac. O SlideScope pode ser transferido gratuitamente, com uma pré-visualização gratuita que abre, mede e anota as suas próprias imagens (sem cartão) e uma avaliação gratuita de 3 dias com todas as funcionalidades (é necessário PayPal ou cartão); após a avaliação, funciona por subscrição.

Abrir IMS num Mac

Use macOS 14 ou posterior. Escolha a versão Apple Silicon ou Intel adequada ao Mac e copie o ficheiro para armazenamento local antes de o abrir.

Se o ficheiro não abrir

Confirme que a cópia terminou. Se o erro persistir, contacte o suporte com a versão da aplicação, o formato e a mensagem de erro.

A quem se destina?

A laboratórios de investigação, unidades de microscopia, docentes, estudantes e equipas de revisão de imagens de patologia.

Documentação do formato

Consulte a documentação original do formato.

IMS

Pesquisas relacionadas em português

Independência e marcas

O SlideScope é independente e não está associado à Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ou OMERO. Os nomes são utilizados apenas para comparações factuais.

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