visualizador de imagens de microscopia

Como abrir ficheiros ICS / IDS

Abra imagens Image Cytometry Standard (ICS) no SlideScope para Windows ou macOS sem conversão prévia, como imagens desconvoluídas do SVI Huygens ou imagens guardadas pelo DIPlib. Abrem os pares .ics e .ids da versão 1 e os ficheiros únicos da versão 2, incluindo dados comprimidos com gzip, com o respetivo tamanho de píxel e dimensões; os píxeis coincidem com o que o Bio-Formats lê. Mantenha o ficheiro .ids junto ao respetivo cabeçalho .ics. A visualização local não envia a imagem para um servidor.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.23.0

Como abrir ficheiros ICS / IDS

  1. Transfira a versão Windows ou Mac adequada ao computador e instale-a. A biblioteca de amostras incluída é gratuita, com todas as ferramentas; para abrir as suas próprias imagens precisa de uma subscrição.
  2. Abra o SlideScope e arraste o ficheiro .ics / .ids para o visualizador.
  3. Selecione a cena ou posição, se existir, e examine os canais, cortes Z e pontos temporais disponíveis.
  4. Verifique o tamanho do píxel nos metadados antes de medir. Guarde o ficheiro original ao exportar.

Quando o SlideScope é uma opção prática

  • Digitalizações de lâminas completas Philips iSyntax e KFBio KFB, imagens ICS/IDS do SVI Huygens e do DIPlib, micrografias eletrónicas Gatan DM3/DM4 e imagens Olympus SIS, cada uma com a sua escala e os seus metadados
  • Os revisores precisam de uma interface para computador sem scripts nem configuração de suplementos.
  • Percorra canais, planos Z, pontos temporais e cenas quando o ficheiro os tiver, verifique o tamanho de píxel em Details e meça em unidades calibradas.
  • As medições, notas e regiões ficam associadas à lâmina e são exportadas como GeoJSON ou CSV.

Escolha de acordo com o fluxo de trabalho

Avalie o SlideScope quando precisar de uma única aplicação para computador que abra vários formatos e quantifique objetos padrão na sua própria máquina. Mantenha a ferramenta original quando necessitar de controlar o microscópio, programar processamento de imagem, criar pipelines com scripts ou gerir imagens a nível institucional.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Processamento extensível, macros, suplementos, scripts, segmentação, análise patológica e fluxos científicos em Python.

OMERO: Repositórios centrais de imagens, permissões, colaboração e gestão institucional de dados.

Perguntas sobre ficheiros ICS / IDS

Abrir ICS / IDS num Mac

Use macOS 14 ou posterior. Escolha a versão Apple Silicon ou Intel adequada ao Mac e copie o ficheiro para armazenamento local antes de o abrir.

Se o ficheiro não abrir

Confirme que a cópia terminou. Se o erro persistir, contacte o suporte com a versão da aplicação, o formato e a mensagem de erro.

A quem se destina?

A laboratórios de investigação, unidades de microscopia, docentes, estudantes e equipas de revisão de imagens de patologia.

Documentação do formato

Consulte a documentação original do formato.

ICS / IDS

Pesquisas relacionadas em português

Independência e marcas

O SlideScope é independente e não está associado à Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ou OMERO. Os nomes são utilizados apenas para comparações factuais.

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