Выбирайте QuPath или napari, если
Используйте QuPath, когда проекту нужны обученные классификаторы объектов, скрипты или конвейеры анализа полнослайдовых изображений, которые вы собираете сами. Используйте napari, когда нужен многомерный просмотр на Python, разработка плагинов или интеграция с научными процессами на Python. SlideScope покрывает стандартный количественный анализ ядер, клеток и частиц с сохраняемым рецептом, но он не программируемый и не позволяет создавать собственные конвейеры.
Где место других инструментов анализа
Если задача — воспроизводимый конвейер измерений, а не аннотирование или обнаружение объектов, сравните с CellProfiler. Если это макросы, плагины или опубликованная процедура — сравните с ImageJ и Fiji. Страница программ для анализа микроскопических изображений показывает, где место просмотру, калиброванным измерениям и количественному анализу.
Об отсутствии аффилированности
SlideScope — независимый продукт и не связан с QuPath или napari. Названия продуктов используются только для описания сравнения и поиска альтернатив.
Проверьте свои файлы бесплатно
Попробуйте SlideScope, если ваша текущая задача — просмотр, измерения и экспорт. Уже решили? Оформите подписку.
Изучайте встроенную библиотеку образцов бесплатно, со всеми инструментами. Чтобы открывать собственные изображения, нужна подписка: $35/мес., оплата при оформлении (PayPal или карта); отменить её можно в любой момент в своей учётной записи. Доступна и годовая оплата — $349.99/год, что даёт примерно два месяца бесплатно.