Полнослайдовые изображения на настольном компьютере

Просмотрщик для цифровой патологии для исследований, обучения и просмотра

SlideScope — настольный просмотрщик для цифровой патологии для Windows и macOS. Открывайте полнослайдовые изображения со сканеров Aperio, Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana и Akoya в полном разрешении, измеряйте в калиброванных микрометрах, сохраняйте аннотации привязанными к слайду, сравнивайте окраску H&E с повторной ИГХ-окраской бок о бок и отправляйте коллеге ссылку, которая открывает именно то поле зрения, на которое вы смотрите.

SVS, NDPI, MRXS, VSI, SCN, BIF, QPTIFF, DICOM Windows, Mac с Apple Silicon и Intel Попробуйте бесплатно на образцах

Что должен уметь просмотрщик для цифровой патологии

Полнослайдовое изображение — это не фотография. Сканер снимает стеклянный слайд при 20x или 40x в виде пирамиды тайлов, которая может занимать несколько гигабайт и иметь более 100 000 пикселей по стороне. Просмотрщик, который пытается загрузить это как одно изображение, не справится; просмотрщик, понимающий пирамиду, откроет его за секунды. Всё остальное, что нужно команде патологов, строится на этом.

Читает пирамиду сканера

SlideScope читает уровни разрешения, записанные сканером, поэтому слайд SVS или NDPI размером 3 ГБ открывается на обычном ноутбуке без сервера изображений, без конвертации и без загрузки куда-либо.

Измеряет в реальном масштабе

Значение «микрометры на пиксель», записанное сканером, определяет каждое измерение линейкой и площади, поэтому край опухоли, измеренный при 40x, даёт то же расстояние при 5x.

Сохраняет контекст просмотра

Аннотации, сохранённые области и заметки остаются привязанными к слайду и к вашей учётной записи, а ссылка на вид открывает то же положение, масштаб и плоскость на чужом компьютере.

Форматы полнослайдовых изображений, которые открывает SlideScope

Цифровая патология раздроблена по производителям сканеров. Каждый производитель записывает собственный контейнер, и просмотрщик, читающий только один из них, вынуждает лабораторию держать второй инструмент для каждого другого сканера, с которого приходят слайды. SlideScope читает следующие форматы производителей, большинство из них — через бэкенд OpenSlide, наряду со своими собственными модулями чтения файлов микроскопии.

Сканер или источникФорматПримечания
Aperio и Leica BiosystemsSVS, SVSLIDEСамый распространённый формат полнослайдовых изображений в исследовательских архивах. Открывается как в Windows, так и на Mac.
Hamamatsu NanoZoomerNDPI, NDPIS, VMS, VMUVMS и VMU хранят пиксели в сопутствующих файлах, поэтому открываются только с локального диска. Начиная с 1.10.0, флуоресцентные наборы NDPIS открываются с настоящими названиями и цветами каналов, а также открываются слайды NDPI, сжатые JPEG XR. Начиная с 1.20.0, аннотации, нарисованные в NDP.view (.ndpa), отображаются поверх слайда и их можно скопировать в свои измерения.
3DHISTECH PannoramicMRXSНужны файл .mrxs и папка с тем же именем рядом с ним. Только с локального диска.
Olympus и Evident (cellSens)VSIОткрываются напрямую начиная с 1.10.0: полнослайдовые и флуоресцентные сканы, включая слайды с несколькими областями сканирования, каждая из которых измеряется по собственному размеру пикселя.
Philips Ultra Fast Scanner и серия SGiSyntaxОткрываются напрямую начиная с 1.20.0, с этикеткой слайда и макроизображением. SlideScope показывает декодированные пиксели без фирменной обработки резкости и цвета Philips, поэтому слайд может выглядеть немного иначе, чем в просмотрщике Philips.
KFBio KF-PROKFBСветлопольные слайды KFB открываются напрямую начиная с 1.20.0. Флуоресцентные слайды KFBF не открываются.
Leica SCN400 и Aperio GTSCNЧитаются через бэкенд OpenSlide; начиная с 1.10.0 открываются и слайды SCN, которые OpenSlide прочитать не может.
Ventana и RocheBIFСветлопольные сканы со сканеров семейства iScan. Начиная с 1.10.0 открываются и слайды BIF, которые OpenSlide прочитать не может, хотя швы между их тайлами пока не сшиваются.
Akoya, PerkinElmer, VectraQPTIFFМультиплексная иммунофлуоресценция с настройкой цвета и интенсивности для каждого канала.
Agilent ARGOSAVSЧитается через бэкенд OpenSlide.
Экспорт с любого сканера или из PACSDICOM, пирамидальный TIFF, OME-TIFFЭкспорт, не привязанный к производителю, включая серии полнослайдовых изображений DICOM.
Исследовательские микроскопыCZI, ND2, LIF, IMS, OIB и OIR, LSM, ZVI, LOF и XLEF, DeltaVision, MetaMorph, OME-ZarrФайлы Zeiss, Nikon, конфокальных микроскопов Leica и Imaris из одного проекта открываются в одном окне. Модули чтения Olympus FluoView, Zeiss ZVI и LSM, Leica LOF и XLEF, DeltaVision, MetaMorph и OME-Zarr появились в 1.10.0; OME-Zarr открывается только из локальных папок.

Не поддерживаются: SQRAY SDPC, Motic MDSX, UNIC TMAP и флуоресцентные слайды KFBio KFBF. Olympus/Evident VSI открывается напрямую начиная с версии 1.10.0, а Philips iSyntax и светлопольные KFBio KFB — с версии 1.20.0. Для форматов других сканеров в сравнении сканеров для цифровой патологии перечислены открытые форматы DICOM и TIFF, в которые эти сканеры умеют экспортировать. Полный справочник по совместимости файлов перечисляет расширения, размерности и ограничения кодеков.

Инструменты просмотра, созданные для работы в патологии

Сравнение бок о бок. Откройте второй слайд рядом с первым, и обе панели будут показывать одну и ту же область при одинаковом увеличении. Масштаб согласуется в микрометрах, а не по коэффициенту увеличения, поэтому окраска H&E, отсканированная при 20x, и её повторная ИГХ-окраска, отсканированная при 40x, действительно совпадают. Перемещение или масштабирование одной панели сдвигает и другую.

Калиброванные измерения и аннотации. Линейки, площади и пронумерованные маркеры используют размер пикселя сканера и остаются привязанными к слайду. Области и измерения экспортируются в GeoJSON в полном разрешении слайда — его напрямую читают QuPath, ASAP и связанные с ними инструменты на Python, — а также в CSV для таблиц измерений.

Ссылки на вид. Ссылка передаёт слайд вместе с положением, масштабом и плоскостью. Установленный SlideScope открывает её одним щелчком; у кого нет приложения, тот сначала видит на сайте, на что указывает ссылка. Именно это делает практичными удалённый исследовательский просмотр, обсуждения в формате онкоконсилиума и обучение без сервера изображений.

Local Quantification. Сегментируйте ядра, клетки или частицы на своём компьютере и получайте калиброванные подсчёты, плотность на квадратный миллиметр, морфологию, среднюю интенсивность по каналам и положительность по маркерам с экспортом в CSV, GeoJSON и TIFF с масками. Пиксели никогда не покидают компьютер. Что эта функция делает и чего не делает — в руководстве по количественному анализу.

AI Analysis. По запросу SlideScope отправляет сжатое изображение текущего кадра и возвращает понятное объяснение того, что на нём видно, на 14 языках. Перед первой отправкой программа спрашивает разрешения и в остальных случаях ничего не отправляет, как описано на странице доверия и обработки данных.

Бесплатные просмотрщики для цифровой патологии и когда SlideScope подходит лучше

Есть несколько хороших бесплатных просмотрщиков, и этот сайт прямо об этом говорит. Aperio ImageScope бесплатен и хорошо читает SVS, но работает только в Windows, и Leica больше активно его не развивает. Hamamatsu NDP.view2 бесплатен для слайдов NDPI; для чтения форматов других производителей нужна платная редакция Plus. QuPath — программа с открытым исходным кодом, кроссплатформенная и правильный инструмент для анализа на скриптах, но её сложнее освоить тем, кому нужно только смотреть слайды. ObjectiveView — бесплатный просмотрщик для Windows и Mac, не привязанный к производителю.

SlideScope подходит лучше, когда лаборатория получает слайды с нескольких сканеров, когда есть пользователи Mac, когда нужны измерения и аннотации, которые сохраняются при передаче, когда нужно сравнить два слайда в одинаковом масштабе или отправить коллеге точное поле зрения вместо скриншота. Сравнение восьми просмотрщиков показывает платформы, цены, форматы и статус поддержки со ссылками на источники.

Кто использует SlideScope в цифровой патологии

  • Исследовательские группы в патологии, которые просматривают отсканированные когорты, измеряют очаги поражения и отмечают области для последующего анализа в QuPath.
  • Учебные лаборатории, проводящие курсы по виртуальной микроскопии, где каждый студент открывает один и тот же набор слайдов на своём ноутбуке с Windows или Mac.
  • Центры коллективного пользования, которые передают отсканированные слайды исследователям, у которых нет программ производителя сканера.
  • Доклинические и токсикологические команды, которые получают слайды от контрактной лаборатории и нуждаются в быстром повторном просмотре без системы управления изображениями.
  • Коллеги на Mac, которым прислали файл SVS или NDPI и которые не могут запустить ImageScope.

Коротко о SlideScope как просмотрщике для цифровой патологии

Лучше всего подходит: исследовательским, учебным и рецензирующим командам, которые получают полнослайдовые изображения с разных сканеров и работают и в Windows, и в macOS.

Ключевые преимущества: поддержка полнослайдовых изображений независимо от производителя, быстрая навигация по пирамиде, калиброванные измерения, экспорт GeoJSON для QuPath, сравнение бок о бок, ссылки на вид, количественный анализ на устройстве и дополнительные объяснения от ИИ.

Важное ограничение: SlideScope не является диагностическим устройством и системой управления изображениями. Он не ведёт случаи, не формирует заключения и не выполняет конвейеры анализа на скриптах.

Цена: бесплатная библиотека образцов со всеми инструментами; для собственных изображений нужна подписка: индивидуальный месячный план стоит $35.00 USD в месяц, оплата при оформлении. PayPal или карта, отменить можно в любой момент в своей учётной записи. См. планы и цены.

Последняя проверка: 26 сентября 2026 г.

Вопросы команд патологов

Что такое просмотрщик для цифровой патологии?

Просмотрщик для цифровой патологии — это программа, которая открывает полнослайдовые изображения, то есть гигапиксельные сканы, которые сканер слайдов создаёт со стеклянного препарата, и позволяет перемещаться и масштабировать их так, как вы двигали бы препарат под микроскопом. Хороший просмотрщик читает пирамиду изображения сканера, чтобы слайд открывался за секунды, выдаёт измерения в калиброванных микрометрах и сохраняет аннотации привязанными к слайду.

Какие форматы полнослайдовых изображений открывает SlideScope?

SlideScope открывает полнослайдовые изображения Aperio SVS, Hamamatsu NDPI, NDPIS, VMS и VMU, 3DHISTECH MRXS, Leica SCN, Ventana BIF, Olympus/Evident VSI, Philips iSyntax, KFBio KFB, Aperio SVSLIDE, Akoya и PerkinElmer QPTIFF и Agilent ARGOS AVS, а также DICOM, пирамидальный TIFF и OME-TIFF. VSI и NDPIS открываются начиная с версии 1.10.0, iSyntax и KFB — с версии 1.20.0. SQRAY SDPC, Motic MDSX и UNIC TMAP он не читает.

SlideScope — бесплатный просмотрщик для цифровой патологии?

SlideScope — платное настольное приложение. Начать можно бесплатно на встроенной библиотеке образцов, со всеми инструментами. Для собственных изображений нужна подписка: индивидуальный месячный план стоит $35.00 USD в месяц, оплата при оформлении; PayPal или карта. Отменить можно в любой момент в своей учётной записи. Бесплатные просмотрщики, такие как Aperio ImageScope (только Windows), Hamamatsu NDP.view2 (бесплатен для NDPI) и QuPath (открытый исходный код), остаются правильным выбором для некоторых команд; когда именно — объясняет сравнение просмотрщиков полнослайдовых изображений на этом сайте.

Работает ли просмотрщик для цифровой патологии на Mac?

Да. SlideScope выпускается в нативных сборках для Mac с Apple Silicon и Intel на macOS 14 и новее, а также для Windows 10 и 11. Aperio ImageScope работает только в Windows, поэтому многие пользователи Mac, получающие файлы SVS, используют вместо него SlideScope.

Можно ли использовать SlideScope для клинической диагностики?

Нет. SlideScope — просмотрщик для цифровой патологии для исследований, обучения и просмотра. Он не является медицинским изделием и не допущен для первичной диагностики. Клиническое внедрение должно соответствовать требованиям вашего учреждения к валидации и регулированию.

Когда SlideScope — правильный выбор

Выбирайте SlideScope, если вам нужно одно нативное настольное приложение для Mac или ПК с Windows, которое открывает слайды и файлы микроскопии разных производителей (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM и другие), измеряет в калиброванных единицах и подсчитывает ядра и клетки без программирования, причём все файлы остаются на вашем компьютере.

Это платное приложение с бесплатной библиотекой образцов: все инструменты работают на встроенных образцах, а для собственных изображений нужна подписка (PayPal или карта). Если вы открываете файлы только одного производителя в Windows, вам может хватить бесплатного просмотрщика этого производителя; для анализа с помощью скриптов есть бесплатные программы с открытым исходным кодом QuPath и Fiji.

Попробуйте SlideScope на своих полнослайдовых изображениях

Бесплатная библиотека образцов включает все инструменты, а приложение бесплатно проверяет, открываются ли ваши собственные файлы, — так вы сможете проверить навигацию по пирамиде, точность измерений, сравнение бок о бок и передачу в QuPath на настоящих отсканированных слайдах, прежде чем принимать решение.

Скачать SlideScope