Qué trata este vídeo
Un archivo .nd2 de Nikon rara vez es una sola imagen: puede contener puntos temporales, planos focales, canales y posiciones de platina en un único archivo. Este vídeo explica qué hay dentro de un ND2 y abre uno en SlideScope en Mac o Windows.
Verás los controles de tiempo, profundidad y canales, los metadatos de adquisición y una medición calibrada, seguidos de una lista honesta de lo que un visor no hace en comparación con NIS-Elements o Fiji.
¿Prefieres leer? Cómo abrir archivos ND2: todas las opciones comparadas.
Transcripción
Actualizado desde la grabación. Cuando la narración dice que SlideScope no hace segmentación ni cuantificación por lotes, no es correcto: desde la v1.8.5, Local Quantification segmenta y cuenta núcleos, células o partículas en tu propio ordenador y puede aplicar una receta guardada a una carpeta. Sigue sin haber lenguaje de scripts ni de macros. La prueba que menciona la narración ya no se ofrece a los nuevos registros, y los precios citados han cambiado: la biblioteca de muestras integrada es gratuita con todas las herramientas, y abrir tus propias imágenes requiere una suscripción, que se cobra al suscribirte con PayPal o tarjeta. Los precios actuales están en la página de precios. Consulta los precios.
ND2 es el formato de Nikon. Sale de NIS-Elements y casi nada más lo abre.
Los archivos ND2 rara vez son una sola imagen.
Son series temporales, pilas Z y varios canales, a menudo todo a la vez.
Abre el .nd2 directamente. Sin paso de conversión.
Este es un time-lapse. Recorre los puntos temporales.
Otro control deslizante recorre la profundidad: este archivo tiene once planos Z.
Combina los canales en una sola vista.
Activa o desactiva cada canal por separado para ver qué aporta.
Metadatos de adquisición: objetivo, tamaño de píxel, intervalo.
Ese tamaño de píxel es la razón por la que la medición se lee en micrómetros.
Esto es un visor. No ejecutará tus rutinas de análisis de NIS-Elements.
No controla el microscopio ni hace cuantificación por lotes.
Exporta TIFF, así que el trabajo pasa sin problemas a Fiji o CellProfiler.
Mac y Windows, la misma aplicación. Una prueba de 3 días con acceso completo y después $25.00 al mes.