visionneuse d’images de microscopie

Comment ouvrir des fichiers ICS / IDS

Ouvrez les images Image Cytometry Standard (ICS) dans SlideScope sous Windows ou macOS sans conversion préalable, comme les images déconvoluées par SVI Huygens ou enregistrées par DIPlib. Les paires .ics et .ids de la version 1 et les fichiers uniques de la version 2 s’ouvrent, y compris les données compressées gzip, avec leur taille de pixel et leurs dimensions ; les pixels correspondent à ce que lit Bio-Formats. Gardez le fichier .ids à côté de son en-tête .ics. La visualisation locale ne téléverse pas l’image.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.23.0

Comment ouvrir des fichiers ICS / IDS

  1. Téléchargez la version Windows ou Mac adaptée et installez-la. La bibliothèque d’échantillons intégrée est gratuite, avec tous les outils ; pour ouvrir vos propres images, un abonnement est nécessaire.
  2. Ouvrez SlideScope et faites glisser votre fichier .ics / .ids dans la visionneuse.
  3. Sélectionnez la scène ou position, si présente, puis examinez les canaux, plans Z et points temporels disponibles.
  4. Vérifiez la taille des pixels dans les métadonnées avant de mesurer. Conservez le fichier original lors de l’export.

Quand SlideScope constitue un choix pratique

  • Numérisations de lames entières Philips iSyntax et KFBio KFB, images ICS/IDS issues de SVI Huygens et de DIPlib, micrographies électroniques Gatan DM3/DM4 et images Olympus SIS, chacune avec son échelle et ses métadonnées
  • Les examinateurs ont besoin d’une interface de bureau sans scripts ni modules à installer.
  • Parcourez les canaux, plans Z, points temporels et scènes lorsque le fichier en contient, vérifiez la taille de pixel dans Details et mesurez en unités étalonnées.
  • Les mesures, notes et régions restent attachées à la lame et s’exportent en GeoJSON ou CSV.

Choisir selon le flux de travail

Évaluez SlideScope si vous cherchez une application de bureau qui ouvre plusieurs formats de microscopie et quantifie les objets courants sur votre propre machine. Gardez l’outil d’origine pour le pilotage du microscope, le traitement programmable, les chaînes d’analyse scriptées ou la gestion institutionnelle des images.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Traitement extensible, macros, modules, scripts, segmentation, analyse en pathologie et flux Python scientifiques.

OMERO: Référentiel central, droits d’accès, collaboration et gestion institutionnelle des données.

Questions sur les fichiers ICS / IDS

Ouvrir ICS / IDS sur un Mac

Utilisez macOS 14 ou ultérieur. Choisissez la version Apple Silicon ou Intel adaptée à votre Mac et copiez le fichier en local avant de l’ouvrir.

Si le fichier ne s’ouvre pas

Vérifiez que la copie est terminée. Si le problème persiste, contactez l’assistance en indiquant la version de l’application, le format et le message d’erreur.

À qui s’adresse SlideScope ?

Aux laboratoires de recherche, plateformes de microscopie, enseignants et équipes de revue en pathologie qui ont besoin d’un outil de consultation pratique.

Documentation du format

Consultez la documentation originale du format.

ICS / IDS

Recherches associées en français

Indépendance et marques

SlideScope est indépendant et n’est affilié ni à Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari, ni à OMERO. Les noms servent uniquement à une comparaison factuelle.

Télécharger SlideScope

Explorez des lames entières, des canaux de fluorescence et des piles d’images dans un espace de travail dédié pour Windows et macOS.

Télécharger SlideScope

Un fichier ne s’ouvre pas, ou un format manque à la liste ? Signaler un fichier ou un format