オンラインとデスクトップの顕微鏡画像ビューアの比較

比較表

2 種類のオンラインビューア

アップロード型ビューアは、ファイルをサーバーに送信し、そこで変換して画像をストリーミングで返します。未発表のデータや患者ラベル付きのスライドでは避けるべきなのはこちらで、ギガバイト級のファイルでは時間もかかります。ブラウザー内型ビューアは、ページ内でディスクからファイルを読み込み、どこにも何も送信しないため、プライバシーやファイルサイズは問題になりません。ただし、ブラウザーはページが持ち込んだデコーダーしか持たないため、すべての形式をデコードできるわけではありません。

当サイトのオンライン TIFF ビューアは後者のタイプです。無料でアカウント不要、16 ビットやマルチチャンネルの TIFF、OME-TIFF、Aperio SVS スライドを開けます。TIFF から PNG/JPEG への変換ツールやメタデータビューアもあります（すべての無料ツール）。CZI、ND2、LIF、MRXS、NDPI、JPEG 2000 SVS には、引き続きデスクトップビューアが必要です。

導入検討とラボでの採用においてこれが重要な理由

ビューアは、ラボにワークフローの変更を求める前に、手間を減らすものであるべきです。SlideScope なら、導入を検討する方が実際のファイルを試し、共有フォルダーを開き、メタデータを確認し、計測し、TIFF を書き出して、製品が合うかどうかをすばやく判断できます。ファイルが実際の研究資産である場合、汎用的なオンラインプレビューよりも説得力があります。

最適なワークフロー

• 共同研究者が、CZI、ND2、SVS、DICOM、TIFF ファイルの入った Google Drive、OneDrive、Dropbox のフォルダーを送ってくる。
• Mac ユーザーが、重い解析環境を用意せずに独自形式の顕微鏡ファイルを確認する必要がある。
• コアファシリティが、後段の解析の前にユーザーにファイルをプレビューしてもらいたい。
• 教員や学生が、本格的なスクリプト環境ではなく、シンプルなレビュー、計測、書き出しを必要としている。

プライバシーに関する重要な注意

患者を特定できるファイル、機密の臨床ファイル、未発表または制限付きの研究ファイルを、素性のわからないオンラインツールにアップロードしないでください。SlideScope のデスクトップワークフローは、ローカルでのレビューと、ユーザーが管理する共有リンクからの読み込みを前提に設計されていますが、機微なデータについては各ラボが独自のポリシーに従ってください。