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顕微鏡画像のためのオンライン TIFF ビューア

コンピューター上の TIFF を開いて、正しく表示できます。コントラストを調整できる 16 ビット・32 ビット画像、マルチチャンネルの合成表示、Z スタック、タイムシリーズ、ページ、そしてズームできるギガピクセル級のピラミッド型 TIFF や SVS スライドに対応しています。ファイルはブラウザーが読み込み、アップロードされることはありません。

オンライン TIFF ビューア

TIFF、OME-TIFF、SVS ファイルをここにドロップ

お使いのコンピューター上でブラウザーが読み込みます。何もアップロードされません。

開けるファイル

開ける形式詳細
TIFF と BigTIFF8・16・32 ビットの整数および浮動小数点、グレースケール、RGB、パレット。ストリップ形式またはタイル形式。マルチページ
OME-TIFFOME-XML のチャンネル、Z、時間、チャンネル名と色、ピクセルサイズ、SubIFD ピラミッド
ImageJ / Fiji TIFFハイパースタック(チャンネル、スライス、フレーム)と ImageJ の校正情報
Aperio SVSJPEG 圧縮されたスライドとそのピラミッド、サムネイル、ラベル、マクロ、MPP
ピラミッド型 TIFF汎用のタイル型ピラミッド(vips や bfconvert で作成したものなど)
圧縮なし、LZW、Deflate(Zip)、PackBits、JPEG、WebP

ドラッグでパン、スクロールまたはピンチでズーム、ダブルクリックで拡大します。+ キーと − キーも使えます。ファイルにピクセルサイズが記録されていれば、ズームに合わせてスケールバーが表示されます。「表示を PNG で保存」で画面に表示されている内容を保存できます。

多くのオンラインビューアで 16 ビット TIFF が真っ黒に表示される理由

顕微鏡カメラは 1 ピクセルあたり 12、14、16 ビットで記録しますが、画面が表示できるのは 8 ビットです。0〜65,535 をそのまま 0〜255 に割り当てるビューアでは、信号が数百から数千の間に収まる一般的な蛍光画像が、下位のわずかなグレーレベルに押し込まれてしまい、真っ黒になります。このビューアは、各チャンネルの表示範囲をデータの 0.1 パーセンタイルと 99.9 パーセンタイルから設定します(Fiji の Auto ボタンと同じ考え方です)。最小値と最大値を正確に入力したり、全範囲に戻したりすることもできます。変わるのは表示だけで、ファイルが変更されることはありません。

開けないもの

  • JPEG 2000 SVS(Aperio 圧縮 33003/33005)、JPEG XR、JPEG XL は WebAssembly なしではブラウザーでデコードできず、このページは WebAssembly を読み込みません。
  • TIFF ベースではない形式:CZI、ND2、LIF、MRXS、VSI、IMS、OIB/OIR、DICOM にはデスクトップのリーダーが必要です。NDPI は TIFF に似ていますが、各レベルを 1 つの巨大な JPEG として保存しているため、ブラウザーのタブで扱うには大きすぎます。
  • 複数のシリーズを含む OME-TIFF は、最初のシリーズを表示します。
  • 計測、注釈、解析はできません。あくまでビューアです。

これらの形式や、ご自身の画像での計測・注釈・細胞計数には、SlideScope が Windows と Mac で 34 種類の顕微鏡・スライドスキャナー形式を開けます。同じチームが開発したデスクトップ顕微鏡アプリ SlideScope は、無料のサンプルライブラリ(全ツール利用可)が付属する有料アプリで、ご自身の画像にはサブスクリプションが必要です。無料の代替手段:Fiji(Bio-Formats)と QuPath。

アップロードせずにファイルを開く仕組み

ファイルを選ぶと、ブラウザーはディスク上のそのファイルへのハンドルをこのページに渡します。ページは必要なバイトだけを読み込みます。まず TIFF ディレクトリ、次に画面に表示されている部分のタイルを読み込み、オープンソースの TIFF リーダー(geotiff)を使ってページ内でデコードします。サーバーには何も送信されないため、未発表のデータや患者ラベル付きのスライドはコンピューター上に留まり、数ギガバイトのスライドもどこにもコピーされないので数秒で開きます。タブを閉じれば、ファイルはページから消えます。

このページは、slidescope.science から自身のスクリプトと、プライバシーに配慮したサイトのページビューカウンターを読み込みます。どちらも画像を見ることはありません。オープンソースライセンス:image-tools-vendor.LICENSE.txt。

質問

TIFF ファイルをアップロードせずにオンラインで表示するには?

このページで開いてください。ブラウザーがディスクからファイルを読み込んでページ内に描画し、サーバーには何も送信されません。他のオンライン TIFF ビューアの多くは、まずファイルをアップロードします。

TIFF が真っ黒または真っ白に見えるのはなぜですか?

ほとんどの場合、0〜65,535 の範囲のごく一部しか値を使っていない 16 ビット画像です。自動コントラストはデータの実際の範囲を画面の表示範囲に引き伸ばします。画像どうしを比較する場合は、最小値と最大値を手動で設定してください。

非常に大きな TIFF ファイルも開けますか?

はい、ファイルがタイル形式でピラミッドを持っていれば開けます(全スライド画像、ピラミッド型 OME-TIFF、BigTIFF)。画面に表示されているタイルだけを読み込むため、数 GB のスライドでもすばやく開きます。ピラミッドのない大きな画像は、ズームとパンで見ていくことはできますが、全体を一度に表示することはできません。

マルチページ TIFF や Z スタックも開けますか?

はい。ページ、Z 平面、時点にはスライダーが表示されます。OME-TIFF と ImageJ のハイパースタックは、チャンネル、Z、時間として読み込まれます。

Mac や iPhone でも使えますか?

macOS と iOS の Safari を含め、現行のブラウザーであればどれでも動作します。Safari は単純な TIFF なら単体で表示できますが、16 ビット、マルチチャンネル、ピラミッド型の TIFF は表示できません。

この TIFF ビューアは無料ですか?

はい、無料でアカウントも不要です。同じチームが開発したデスクトップ顕微鏡アプリ SlideScope は、無料のサンプルライブラリ(全ツール利用可)が付属する有料アプリで、ご自身の画像にはサブスクリプションが必要です。

ブラウザーでできる以上のことが必要ですか?

SlideScope は Windows と Mac で、CZI、ND2、LIF、MRXS、JPEG 2000 SVS を含む 34 種類の顕微鏡・スライドスキャナー形式を開き、計測、注釈、細胞計数、フル解像度の OME-TIFF 書き出しに対応します。内蔵サンプルですべてのツールを無料でお試しいただけます。ご自身の画像を開くにはサブスクリプションが必要です。もうお決まりですか?今すぐ登録。

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