Lokale beoordeling of upload in de browser

Online of desktop: welke microscopieviewer?

Online bestandsviewers kunnen handig zijn, maar microscopiebestanden zijn vaak groot, privé, in een eigen leveranciersformaat of verbonden aan gevoelig onderzoek. Voor veel labs is een desktopviewer die gedeelde links kan laden de betere middenweg.

Geen upload naar onbekende diensten nodigGedeelde links openenLokaal cachen

Vergelijkingstabel

BehoefteOnline viewerDesktopviewer
Zeer grote CZI-, ND2- of SVS-bestandenUploaden kan pijnlijk lang duren of mislukken.Open lokale bestanden of sla gedeelde bestanden lokaal op in de cache.
Gevoelig onderzoek of bestanden met een link naar patiëntenVereist vertrouwen in de uploaddienst.Houdt de beoordeling op de computer van de gebruiker, tenzij de gebruiker kiest voor een workflow met gedeelde links.
Metadata en metingenVaak beperkt.Ingebouwd in SlideScope voor ondersteunde workflows.
Links van samenwerkingspartnersHet bestand moet mogelijk opnieuw worden geüpload.SlideScope kan directe links of gedeelde mappen uit gangbare cloudbronnen openen.
Herhaalde beoordelingVereist mogelijk nog een upload.Lokale caching maakt herhaalde beoordeling sneller.

Twee soorten online viewers

Uploadviewers sturen je bestand naar een server, zetten het daar om en streamen het beeld terug. Die moet je vermijden voor ongepubliceerde data en coupes met patiëntlabels, en ze zijn traag voor bestanden van gigabytes. In-browserviewers lezen het bestand van je schijf binnen de pagina en sturen nergens iets naartoe, zodat privacy en bestandsgrootte geen probleem meer zijn; wat ze niet kunnen is elk formaat decoderen, want een browser heeft alleen de decoders die een pagina meebrengt.

Onze online TIFF-viewer is van de tweede soort: gratis, zonder account, en hij opent 16-bit- en meerkanaals-TIFF, OME-TIFF en Aperio SVS-coupes, plus een TIFF-naar-PNG/JPEG-converter en een metadataviewer (alle gratis tools). Voor CZI, ND2, LIF, MRXS, NDPI en JPEG 2000-SVS heb je nog steeds een desktopviewer nodig.

Waarom dit telt voor aankoop en adoptie in het lab

Een viewer moet drempels wegnemen voordat hij een lab vraagt een workflow te veranderen. Met SlideScope kan een koper echte bestanden testen, een gedeelde map openen, metadata bekijken, meten, TIFF exporteren en snel beslissen of het product past. Dat is sterker dan een algemene online preview wanneer de bestanden echte onderzoeksdata zijn.

Workflows die het best passen

  • Een samenwerkingspartner stuurt een map in Google Drive, OneDrive of Dropbox met CZI-, ND2-, SVS-, DICOM- of TIFF-bestanden.
  • Een Mac-gebruiker moet microscopiebestanden in leveranciersformaten bekijken zonder zware analyseopzet.
  • Een core facility wil dat gebruikers bestanden kunnen voorvertonen vóór de verdere analyse.
  • Een docent of student heeft eenvoudig bekijken, meten en exporteren nodig in plaats van een volledige scriptomgeving.

Belangrijke opmerking over privacy

Upload geen patiëntidentificerende, vertrouwelijke klinische, ongepubliceerde of beperkt toegankelijke onderzoeksbestanden naar onbekende online tools. De desktopworkflow van SlideScope is ontworpen voor lokale beoordeling en het laden van gedeelde links onder controle van de gebruiker, maar elk lab moet zijn eigen beleid voor gevoelige gegevens volgen.

Controleer gratis je eigen bestanden

Controleer gratis of de bestanden waarmee je lab echt werkt openen, en probeer daarna de desktopworkflow op de ingebouwde voorbeelden. Al besloten? Nu abonneren.

Verken de ingebouwde voorbeeldbibliotheek gratis, met elke tool. Voor het openen van je eigen beelden heb je een abonnement nodig: $35/maand, gefactureerd wanneer je je abonneert (PayPal of kaart), en je kunt altijd opzeggen vanuit je account. Jaarlijkse facturering is beschikbaar voor $349.99/jaar, wat neerkomt op ongeveer twee maanden gratis.

SlideScope downloaden