TIFF、OME-TIFF、SVS ファイルをここにドロップ
お使いのコンピューター上でブラウザーが読み込みます。何もアップロードされません。
| ファイル | ピクセルサイズの記録場所 |
|---|---|
| OME-TIFF | OME-XML（ImageDescription 内）の Pixels 要素にある PhysicalSizeX と PhysicalSizeXUnit |
| Aperio SVS | 最初の画像の ImageDescription にある MPP = 0.4990（1 ピクセルあたりの µm） |
| ImageJ / Fiji TIFF | ImageDescription にある unit=micron と、XResolution に記録された単位あたりのピクセル数 |
| 通常の TIFF | XResolution と ResolutionUnit（2 = インチ、3 = cm）。カメラソフトウェアは 72 または 300 dpi を書き込むことが多いですが、これは校正ではなく印刷用の設定です |
ビューアは、これらのうちどれが見つかったかを表示します。どれも見つからない場合は、計測の前にご自身でスケールを設定してください（方法はピクセルサイズ計算ツールで説明しています）。
全スライド画像のファイルには、ピクセル以外の情報も含まれていることがよくあります。ガラスラベルの写真（バーコード、症例番号、場合によっては氏名）、スライド全体のマクロ画像、スキャン日時、スキャナーのシリアル番号、ユーザー名、元のファイル名などです。このツールは、主要なタグの中で見つかったものを一覧表示します。スライドを施設外で共有する前に、これらを削除してください。詳しくはスライド画像からラベルと患者データを削除する方法をご覧ください。
tiffinfo file.tif（libtiff）はすべてのディレクトリを出力し、exiftool -a -G1 file.tif はメーカー固有のタグも表示します。Python では、tifffile.TiffFile(path) が .pages[i].tags、.ome_metadata、.imagej_metadata を提供します。SVS の場合は、openslide.OpenSlide(path).properties で解析済みのフィールドを取得できます（Python で SVS ファイルを読み込む方法を参照）。
ファイルを選ぶと、ブラウザーはディスク上のそのファイルへのハンドルをこのページに渡します。ページは必要なバイトだけを読み込みます。まず TIFF ディレクトリ、次に画面に表示されている部分のタイルを読み込み、オープンソースの TIFF リーダー（geotiff）を使ってページ内でデコードします。サーバーには何も送信されないため、未発表のデータや患者ラベル付きのスライドはコンピューター上に留まり、数ギガバイトのスライドもどこにもコピーされないので数秒で開きます。タブを閉じれば、ファイルはページから消えます。
このページは、slidescope.science から自身のスクリプトと、プライバシーに配慮したサイトのページビューカウンターを読み込みます。どちらも画像を見ることはありません。オープンソースライセンス：image-tools-vendor.LICENSE.txt。
このページで開くと、すべての画像のすべてのタグを一覧表示できます。または、tiffinfo、exiftool、Python の tifffile を使用してください。顕微鏡関連のメタデータの大半（OME-XML、ImageJ、Aperio のフィールド）は ImageDescription タグに格納されています。
OME-XML の PhysicalSizeX、Aperio の説明にある MPP、または ImageJ の unit と XResolution を探してください。72 または 300 dpi という単純な解像度は印刷用の設定であり、顕微鏡の校正値ではありません。
はい。「すべてのタグを JSON でダウンロード」で、ファイル内の最大 200 枚の画像のタグを保存できます（長い配列は短縮されます）。
いいえ。ブラウザーがお使いのコンピューター上でファイルを読み込み、どこにも送信されません。
はい、無料でアカウントも不要です。同じチームが開発したデスクトップ顕微鏡アプリ SlideScope は、無料のサンプルライブラリ（全ツール利用可）が付属する有料アプリで、ご自身の画像にはサブスクリプションが必要です。
SlideScope は Windows と Mac で、CZI、ND2、LIF、MRXS、JPEG 2000 SVS を含む 34 種類の顕微鏡・スライドスキャナー形式を開き、計測、注釈、細胞計数、フル解像度の OME-TIFF 書き出しに対応します。内蔵サンプルですべてのツールを無料でお試しいただけます。ご自身の画像を開くにはサブスクリプションが必要です。もうお決まりですか？今すぐ登録。