Выбор по рабочему процессу
Оцените SlideScope, если нужна одна настольная программа, которая открывает файлы разных микроскопов и считает стандартные объекты на вашем собственном компьютере. Оригинальная программа предпочтительнее для управления микроскопом, программируемой обработки, скриптовых конвейеров анализа или централизованного управления изображениями.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Расширяемой обработки, макросов, плагинов, сценариев, сегментации, анализа патологии и научных процессов Python.
OMERO: Централизованного хранилища, прав доступа, совместной работы и управления данными учреждения.