программа для просмотра микроскопических изображений

Как открыть файлы NDPI

Открывайте полнослайдовые изображения Hamamatsu NDPI в SlideScope на Windows или macOS без предварительного преобразования. Перемещайтесь и масштабируйте весь препарат, измеряйте в мкм по калибровке сканера и добавляйте аннотации. Локальный просмотр не загружает изображение на сервер.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.17.2

Как открыть файлы NDPI

  1. Скачайте версию для своего компьютера Windows или Mac и установите её. Встроенная библиотека образцов бесплатна, со всеми инструментами; собственные препараты открываются в бесплатном пробном периоде, для которого при оплате нужно подтверждение через PayPal или карту.
  2. Перетащите файл .ndpi в окно просмотра или выберите File › Open File… Открывайте сканы препаратов с локального диска.
  3. С помощью обзорной миниатюры перейдите к нужной области и увеличьте её. SlideScope загружает уровень пирамиды, соответствующий видимой области.
  4. Перед измерением проверьте размер пикселя (мкм/пикс.) в сведениях о файле, затем измеряйте, добавляйте аннотации и экспортируйте текущий вид как изображение.

Чем открыть файлы NDPI

ПрограммаСтоимостьПлатформыПодходит для
Hamamatsu NDP.view2Бесплатно для слайдов Hamamatsu (NDP.view2 Plus — платный)Windows 10/11, macOS 13–26 (Apple silicon и Intel)Собственная программа производителя для NDPI
QuPathБесплатно, открытый исходный кодWindows, macOS, LinuxПроекты анализа полнослайдовых изображений и написание скриптов
SlideScopeБесплатные образцы со всеми инструментами, бесплатный пробный период (3 дн.) для собственных изображений, затем подписка от $25 в месяцWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon и Intel)Просмотр, измерение и аннотирование файлов NDPI наряду с CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM и TIFF; файлы остаются на вашем компьютере

Файлы Hamamatsu NDPI можно открыть в NDP.view2 — бесплатной программе просмотра от Hamamatsu для Windows и macOS; в QuPath — бесплатно в Windows, на Mac и в Linux; или в SlideScope — настольной программе просмотра для Windows и Mac с бесплатным пробным периодом. В шагах ниже используется SlideScope.

Источник: Сравнение программ для просмотра полнослайдовых изображений (платформы и цены, у каждой — ссылка на источник) (на английском).

См. также: Hamamatsu NDP.view2: где скачать, поддержка Mac и альтернативы.

Когда SlideScope является практичным выбором

  • Слайды сканеров NDPI, VMS, VMU, MRXS, SCN, BIF, SVSLIDE, QPTIFF и AVS от Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana, Aperio, Vectra и Agilent ARGOS
  • Пользователям нужен настольный интерфейс без сценариев и настройки плагинов.
  • Переключайтесь между каналами, Z-плоскостями, временными точками и сценами, если они есть в файле, проверьте размер пикселя в Details и измеряйте в калиброванных единицах.
  • Измерения, заметки и области остаются привязанными к препарату и экспортируются в GeoJSON или CSV.

Выбор по рабочему процессу

Оцените SlideScope, если нужна одна настольная программа, которая открывает файлы разных микроскопов и считает стандартные объекты на вашем собственном компьютере. Оригинальная программа предпочтительнее для управления микроскопом, программируемой обработки, скриптовых конвейеров анализа или централизованного управления изображениями.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Расширяемой обработки, макросов, плагинов, сценариев, сегментации, анализа патологии и научных процессов Python.

OMERO: Централизованного хранилища, прав доступа, совместной работы и управления данными учреждения.

Вопросы о файлах NDPI

Можно ли открыть файлы NDPI бесплатно?

Да. NDP.view2 от Hamamatsu и QuPath бесплатны. SlideScope можно скачать бесплатно: встроенная библиотека образцов доступна бесплатно, со всеми инструментами, а собственные изображения открываются в бесплатном пробном периоде (3 дн.; нужен PayPal или карта); после пробного периода программа работает по подписке.

Открытие препаратов NDPI на Mac

SlideScope работает на macOS 14 и новее нативно, поэтому не нужны ни ПК с Windows, ни виртуальная машина для программы производителя. Выберите сборку Apple Silicon или Intel и перед открытием скопируйте препарат на локальный диск.

Если препарат не открывается

Убедитесь, что файл полностью скопирован на локальный диск. Если ошибка остаётся, сообщите поддержке версию приложения, формат файла и текст ошибки.

Для кого предназначен SlideScope?

Для исследовательских лабораторий, центров микроскопии, преподавателей, студентов и групп просмотра патологических изображений.

Документация формата

Прочитайте исходную документацию формата.

NDPI

Связанные запросы на русском языке

Независимость и товарные знаки

SlideScope является независимым продуктом и не связан с Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari или OMERO. Названия используются только для объективного сравнения.

Скачать SlideScope

Изучайте целые препараты, каналы флуоресценции и стеки изображений в едином удобном рабочем пространстве для Windows и macOS.

Скачать SlideScope

Файл не открывается или формата нет в списке? Сообщить о файле или формате