Открывайте файлы Imaris IMS (Bitplane, теперь Oxford Instruments) в SlideScope на Windows или macOS без преобразования. Каналы открываются с цветами и диапазонами отображения, сохранёнными в файле, фокальные плоскости указаны в µm, временные точки — в секундах, а сжатые файлы IMS тоже открываются. SlideScope читает уровень файла с полным разрешением. Локальный просмотр не загружает изображение на сервер.
| Программа | Стоимость | Платформы | Подходит для |
|---|---|---|---|
| Imaris Viewer | Бесплатно (для скачивания нужно заполнить регистрационную форму) | Windows, macOS (Apple silicon и Intel) | Собственная программа производителя для просмотра IMS в 3D и 4D |
| Fiji / ImageJ с Bio-Formats | Бесплатно, открытый исходный код | Windows, macOS, Linux | Анализ с плагинами и макросами |
| SlideScope | Бесплатный предварительный просмотр (без карты), бесплатный пробный период (3 дн.), затем подписка от $25 в месяц | Windows 10+, macOS 14+ (Apple silicon и Intel) | Просмотр, измерение и аннотирование файлов IMS наряду с CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM и TIFF; файлы остаются на вашем компьютере |
Файлы Imaris IMS можно открыть в Imaris Viewer — бесплатной программе просмотра от Oxford Instruments для Windows и Mac; в Fiji, который читает IMS через Bio-Formats в Windows, на Mac и в Linux; или в SlideScope — настольной программе просмотра для Windows и Mac с бесплатным пробным периодом. В шагах ниже используется SlideScope.
Источник: Совместимость файлов: что открывает SlideScope и каковы ограничения (на английском).
Оцените SlideScope, если нужна одна настольная программа, которая открывает файлы разных микроскопов и считает стандартные объекты на вашем собственном компьютере. Оригинальная программа предпочтительнее для управления микроскопом, программируемой обработки, скриптовых конвейеров анализа или централизованного управления изображениями.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Расширяемой обработки, макросов, плагинов, сценариев, сегментации, анализа патологии и научных процессов Python.
OMERO: Централизованного хранилища, прав доступа, совместной работы и управления данными учреждения.
Да. Fiji читает файлы Imaris IMS, включая версию 5.5 на основе HDF5, через Bio-Formats. Программа Imaris Viewer тоже бесплатна, для Windows и Mac. SlideScope можно скачать бесплатно: есть бесплатный режим предварительного просмотра, в котором можно открывать, измерять и аннотировать собственные изображения (без карты), и бесплатный пробный период (3 дн.) со всеми функциями (нужен PayPal или карта); после пробного периода программа работает по подписке.
Используйте macOS 14 или новее. Выберите сборку Apple Silicon или Intel для своего Mac и перед открытием скопируйте файл на локальный диск.
Убедитесь, что копирование завершено. Если ошибка остаётся, сообщите поддержке версию приложения, формат файла и текст ошибки.
Для исследовательских лабораторий, центров микроскопии, преподавателей, студентов и групп просмотра патологических изображений.
Прочитайте исходную документацию формата.
SlideScope является независимым продуктом и не связан с Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari или OMERO. Названия используются только для объективного сравнения.
Изучайте целые препараты, каналы флуоресценции и стеки изображений в едином удобном рабочем пространстве для Windows и macOS.
Файл не открывается или формата нет в списке? Сообщить о файле или формате