Co toto video pokrývá
Soubor Nikon .nd2 jen zřídka obsahuje jediný obraz: v jednom souboru mohou být časové body, ohniskové roviny, kanály a pozice stolku. Toto video vysvětluje, co soubor ND2 obsahuje, a otevírá ho ve SlideScope na Macu nebo ve Windows.
Uvidíte ovládání času, hloubky a kanálů, metadata akvizice a kalibrované měření a poté poctivý výčet toho, co prohlížeč ve srovnání s NIS-Elements nebo Fiji nedělá.
Raději čtete? Jak otevřít soubory ND2: srovnání všech možností.
Přepis
Aktualizováno od natočení. Tam, kde komentář říká, že SlideScope neprovádí segmentaci ani dávkovou kvantifikaci, to neplatí: od verze 1.8.5 funkce Local Quantification segmentuje a počítá jádra, buňky nebo částice přímo ve vašem počítači a uložený postup umí spustit na celou složku. Skriptovací ani makro jazyk stále chybí. Zkušební verze z komentáře se novým registracím již nenabízí a uvedené ceny se změnily: vestavěná knihovna ukázek je zdarma se všemi nástroji a pro otevírání vlastních snímků potřebujete předplatné, účtované při předplacení přes PayPal nebo kartou. Aktuální ceny najdete na stránce s cenami. Viz ceny.
ND2 je formát společnosti Nikon. Vzniká v NIS-Elements a téměř nic jiného ho neotevře.
Soubory ND2 jen zřídka obsahují jediný obraz.
Jsou to časové série, Z-stacky a více kanálů, často všechno najednou.
Otevřete soubor .nd2 přímo. Bez převodu.
Tohle je časosběrný záznam. Projděte jednotlivé časové body.
Samostatný posuvník prochází hloubkou – tento soubor má jedenáct rovin Z.
Spojte kanály do jednoho zobrazení.
Zapínejte a vypínejte jednotlivé kanály a uvidíte, čím každý přispívá.
Metadata akvizice: objektiv, velikost pixelu, interval.
Díky této velikosti pixelu se měření zobrazuje v mikrometrech.
Je to prohlížeč. Vaše analytické rutiny z NIS-Elements nespustí.
Neovládá mikroskop a neprovádí dávkovou kvantifikaci.
Exportuje TIFF, takže práce plynule přejde do Fiji nebo CellProfiler.
Mac i Windows, stejná aplikace. Třídenní zkušební verze s plným přístupem, poté $25.00 měsíčně.