דרכים לפתוח קובצי SVS
אפשר לפתוח קובצי Aperio SVS באמצעות Aperio ImageScope, המציג החינמי של Leica ל-Windows, שכבר אינו בפיתוח פעיל; באמצעות QuPath, שהוא חינמי ב-Windows, ב-Mac וב-Linux; או באמצעות SlideScope, מציג שולחני ל-Windows ול-Mac עם תקופת ניסיון חינמית. ב-Mac אין אפשרות להשתמש ב-ImageScope. השלבים שלהלן משתמשים ב-SlideScope.
מקור: השוואת מציגי תמונות שקופית מלאה (פלטפורמות ומחירים, כל אחד עם קישור למקור) (באנגלית).
ראו גם: ImageScope ב-Mac: מאיפה להוריד והחלופות (באנגלית); קריאת קובצי SVS ב-Python עם OpenSlide או tifffile (באנגלית).
מתי SlideScope הוא הבחירה המעשית
- SVS של Aperio לסריקות פתולוגיה של שקופית שלמה
- הסוקרים זקוקים לממשק מחשב ללא סקריפטים או הגדרת תוספים.
- עברו בין ערוצים, מישורי Z, נקודות זמן וסצנות כשהם קיימים בקובץ, בדקו את גודל הפיקסל ב־Details ומדדו ביחידות מכוילות.
- מדידות, הערות ואזורים נשארים מקושרים לשקופית ומיוצאים כ־GeoJSON או CSV.
בחירה לפי תהליך העבודה
כדאי לבחון את SlideScope כאשר דרושה תוכנת מחשב אחת שפותחת קובצי מיקרוסקופיה במגוון פורמטים ומכמתת עצמים סטנדרטיים על המחשב שלכם. השאירו את הכלי המקורי כאשר נדרשים שליטה במיקרוסקופ, עיבוד ניתן לתכנות, צינורות ניתוח מבוססי סקריפט או ניהול תמונות ארגוני.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: עיבוד ניתן להרחבה, מאקרו, תוספים, סקריפטים, סגמנטציה, ניתוח פתולוגי ותהליכי Python מדעיים.
OMERO: מאגרי תמונות מרכזיים, הרשאות, שיתוף פעולה וניהול מידע ארגוני.
עצמאות וסימני מסחר
SlideScope הוא מוצר עצמאי ואינו משויך ל-Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari או OMERO. שמות המוצרים משמשים רק להשוואה עובדתית.