מציג תמונות מיקרוסקופיה

איך לפתוח קובצי IMS

פתחו קובצי Imaris IMS (של Bitplane, כיום Oxford Instruments) ב-SlideScope ב-Windows או ב-macOS ללא המרה. הערוצים נפתחים עם הצבעים וטווחי התצוגה השמורים בקובץ, מישורי המוקד מוצגים ב-µm ונקודות הזמן בשניות, וגם קובצי IMS דחוסים נפתחים. התוכנה SlideScope קוראת את רמת הרזולוציה המלאה של הקובץ. צפייה מקומית אינה מעלה את התמונה לשרת.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.11.1

איך לפתוח קובצי IMS

  1. הורידו את גרסת Windows או Mac המתאימה למחשב והתקינו אותה. התצוגה המקדימה החינמית לא דורשת חשבון.
  2. פתחו את SlideScope וגררו את קובץ .ims אל המציג.
  3. בחרו סצנה או מיקום אם קיימים, ואז בדקו את הערוצים, חתכי Z ונקודות הזמן הזמינים.
  4. בדקו את גודל הפיקסל במטא-נתונים לפני מדידה. שמרו את הקובץ המקורי בעת ייצוא.

דרכים לפתוח קובצי IMS

כליעלותפלטפורמותשימוש מומלץ
Imaris Viewerחינמי (נדרש טופס הרשמה להורדה)Windows, macOS (Apple silicon ו-Intel)מציג התלת-ממד והארבע-ממד של היצרן עצמו עבור IMS
Fiji / ImageJ עם Bio-Formatsחינמי, קוד פתוחWindows, macOS, Linuxניתוח באמצעות תוספים ומאקרו
SlideScopeתצוגה מקדימה חינמית (ללא כרטיס אשראי), ניסיון חינם של 3 ימים, ולאחר מכן מנוי החל מ-$25 לחודשWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon ו-Intel)צפייה, מדידה והוספת הערות לקובצי IMS לצד CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM ו-TIFF, כשהקבצים נשארים במחשב שלכם

אפשר לפתוח קובצי Imaris IMS באמצעות Imaris Viewer, המציג החינמי של Oxford Instruments ל-Windows ול-Mac; באמצעות Fiji, שקורא IMS דרך Bio-Formats ב-Windows, ב-Mac וב-Linux; או באמצעות SlideScope, מציג שולחני ל-Windows ול-Mac עם תקופת ניסיון חינמית. השלבים שלהלן משתמשים ב-SlideScope.

מקור: תאימות קבצים: מה SlideScope פותחת, ומה המגבלות שלה (באנגלית).

מתי SlideScope הוא הבחירה המעשית

  • IMS של Imaris/Bitplane לתמונות רב-ערוציות
  • הסוקרים זקוקים לממשק מחשב ללא סקריפטים או הגדרת תוספים.
  • עברו בין ערוצים, מישורי Z, נקודות זמן וסצנות כשהם קיימים בקובץ, בדקו את גודל הפיקסל ב־Details ומדדו ביחידות מכוילות.
  • מדידות, הערות ואזורים נשארים מקושרים לשקופית ומיוצאים כ־GeoJSON או CSV.

בחירה לפי תהליך העבודה

כדאי לבחון את SlideScope כאשר דרושה תוכנת מחשב אחת שפותחת קובצי מיקרוסקופיה במגוון פורמטים ומכמתת עצמים סטנדרטיים על המחשב שלכם. השאירו את הכלי המקורי כאשר נדרשים שליטה במיקרוסקופ, עיבוד ניתן לתכנות, צינורות ניתוח מבוססי סקריפט או ניהול תמונות ארגוני.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: עיבוד ניתן להרחבה, מאקרו, תוספים, סקריפטים, סגמנטציה, ניתוח פתולוגי ותהליכי Python מדעיים.

OMERO: מאגרי תמונות מרכזיים, הרשאות, שיתוף פעולה וניהול מידע ארגוני.

שאלות על קובצי IMS

האם Fiji יכול לפתוח קובצי IMS?

כן. Fiji קורא קובצי Imaris IMS, כולל גרסה 5.5 המבוססת על HDF5, דרך Bio-Formats. גם Imaris Viewer חינמי, ב-Windows וב-Mac. ההורדה של SlideScope חינמית, והיא כוללת תצוגה מקדימה חינמית שפותחת, מודדת ומוסיפה הערות לתמונות שלכם (ללא כרטיס אשראי), ותקופת ניסיון חינמית של 3 ימים לכל התכונות (נדרש PayPal או כרטיס אשראי); לאחר תקופת הניסיון השימוש הוא במנוי.

פתיחת IMS ב-Mac

השתמשו ב-macOS 14 ומעלה. בחרו הורדה ל-Apple Silicon או ל-Intel בהתאם ל-Mac שלכם והעתיקו את הקובץ לאחסון מקומי לפני פתיחתו.

אם הקובץ אינו נפתח

ודאו שהעתקת הקובץ הושלמה. אם הבעיה נמשכת, פנו לתמיכה עם גרסת היישום, פורמט הקובץ והודעת השגיאה כדי שנוכל לבדוק.

למי מיועד SlideScope?

למעבדות מחקר, יחידות מיקרוסקופיה, מרצים, סטודנטים וצוותים הסוקרים תמונות פתולוגיה.

תיעוד הפורמט

קראו את התיעוד המקורי של הפורמט.

IMS

חיפושים קשורים בעברית

עצמאות וסימני מסחר

SlideScope הוא מוצר עצמאי ואינו משויך ל-Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari או OMERO. שמות המוצרים משמשים רק להשוואה עובדתית.

הורדת SlideScope

סיירו בסליידים שלמים, בערוצי פלואורסצנציה ובערימות תמונות, בסביבת עבודה ממוקדת אחת ל-Windows ול-macOS.

הורדת SlideScope

יש לכם קובץ שלא נפתח או פורמט שעדיין לא ברשימה? דיווח על קובץ או פורמט