דרכים לפתוח קובצי IMS
אפשר לפתוח קובצי Imaris IMS באמצעות Imaris Viewer, המציג החינמי של Oxford Instruments ל-Windows ול-Mac; באמצעות Fiji, שקורא IMS דרך Bio-Formats ב-Windows, ב-Mac וב-Linux; או באמצעות SlideScope, מציג שולחני ל-Windows ול-Mac עם תקופת ניסיון חינמית. השלבים שלהלן משתמשים ב-SlideScope.
מקור: תאימות קבצים: מה SlideScope פותחת, ומה המגבלות שלה (באנגלית).
מתי SlideScope הוא הבחירה המעשית
- IMS של Imaris/Bitplane לתמונות רב-ערוציות
- הסוקרים זקוקים לממשק מחשב ללא סקריפטים או הגדרת תוספים.
- עברו בין ערוצים, מישורי Z, נקודות זמן וסצנות כשהם קיימים בקובץ, בדקו את גודל הפיקסל ב־Details ומדדו ביחידות מכוילות.
- מדידות, הערות ואזורים נשארים מקושרים לשקופית ומיוצאים כ־GeoJSON או CSV.
בחירה לפי תהליך העבודה
כדאי לבחון את SlideScope כאשר דרושה תוכנת מחשב אחת שפותחת קובצי מיקרוסקופיה במגוון פורמטים ומכמתת עצמים סטנדרטיים על המחשב שלכם. השאירו את הכלי המקורי כאשר נדרשים שליטה במיקרוסקופ, עיבוד ניתן לתכנות, צינורות ניתוח מבוססי סקריפט או ניהול תמונות ארגוני.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: עיבוד ניתן להרחבה, מאקרו, תוספים, סקריפטים, סגמנטציה, ניתוח פתולוגי ותהליכי Python מדעיים.
OMERO: מאגרי תמונות מרכזיים, הרשאות, שיתוף פעולה וניהול מידע ארגוני.
עצמאות וסימני מסחר
SlideScope הוא מוצר עצמאי ואינו משויך ל-Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari או OMERO. שמות המוצרים משמשים רק להשוואה עובדתית.