דרכים לפתוח קובצי NDPI
אפשר לפתוח קובצי Hamamatsu NDPI באמצעות NDP.view2, המציג החינמי של Hamamatsu ל-Windows ול-macOS; באמצעות QuPath, שהוא חינמי ב-Windows, ב-Mac וב-Linux; או באמצעות SlideScope, מציג שולחני ל-Windows ול-Mac עם תקופת ניסיון חינמית. השלבים שלהלן משתמשים ב-SlideScope.
מקור: השוואת מציגי תמונות שקופית מלאה (פלטפורמות ומחירים, כל אחד עם קישור למקור) (באנגלית).
ראו גם: Hamamatsu NDP.view2: מאיפה להוריד, תמיכה ב-Mac והחלופות (באנגלית).
מתי SlideScope הוא הבחירה המעשית
- שקופיות סורקים בפורמטים NDPI, VMS, VMU, MRXS, SCN, BIF, SVSLIDE, QPTIFF ו-AVS של Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana, Aperio, Vectra ו-Agilent ARGOS
- הסוקרים זקוקים לממשק מחשב ללא סקריפטים או הגדרת תוספים.
- עברו בין ערוצים, מישורי Z, נקודות זמן וסצנות כשהם קיימים בקובץ, בדקו את גודל הפיקסל ב־Details ומדדו ביחידות מכוילות.
- מדידות, הערות ואזורים נשארים מקושרים לשקופית ומיוצאים כ־GeoJSON או CSV.
בחירה לפי תהליך העבודה
כדאי לבחון את SlideScope כאשר דרושה תוכנת מחשב אחת שפותחת קובצי מיקרוסקופיה במגוון פורמטים ומכמתת עצמים סטנדרטיים על המחשב שלכם. השאירו את הכלי המקורי כאשר נדרשים שליטה במיקרוסקופ, עיבוד ניתן לתכנות, צינורות ניתוח מבוססי סקריפט או ניהול תמונות ארגוני.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: עיבוד ניתן להרחבה, מאקרו, תוספים, סקריפטים, סגמנטציה, ניתוח פתולוגי ותהליכי Python מדעיים.
OMERO: מאגרי תמונות מרכזיים, הרשאות, שיתוף פעולה וניהול מידע ארגוני.
עצמאות וסימני מסחר
SlideScope הוא מוצר עצמאי ואינו משויך ל-Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari או OMERO. שמות המוצרים משמשים רק להשוואה עובדתית.