prohlížeč mikroskopických snímků

Jak otevřít soubory SVS

Otevírejte celoplošné skeny preparátů Aperio SVS v aplikaci SlideScope ve Windows nebo macOS bez předchozího převodu. Posouvejte a zvětšujte celý preparát, měřte v µm podle kalibrace skeneru a přidávejte anotace. Místní prohlížení neodesílá obraz na server.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.17.2

Jak otevřít soubory SVS

  1. Stáhněte verzi pro svůj počítač Windows nebo Mac a nainstalujte ji. Vestavěná knihovna ukázek je zdarma, se všemi nástroji; vlastní preparáty otevřete v bezplatném zkušebním období, které při placení vyžaduje schválení přes PayPal nebo kartu.
  2. Přetáhněte soubor .svs do prohlížeče nebo zvolte File › Open File… Skeny preparátů otevírejte z místního úložiště.
  3. V přehledovém náhledu přejděte na požadovanou oblast a přibližte ji. SlideScope načte úroveň pyramidy odpovídající zobrazené oblasti.
  4. Před měřením zkontrolujte velikost pixelu (µm/px) v podrobnostech souboru, pak měřte, anotujte a exportujte aktuální zobrazení jako obrázek.

Jak otevřít soubory SVS

NástrojCenaPlatformyVhodné pro
Aperio ImageScopeZdarmaPouze WindowsProhlížeč společnosti Leica; podle Leicy se již aktivně nevyvíjí
QuPathZdarma, open sourceWindows, macOS, LinuxProjekty analýzy celých skenů preparátů (WSI) a skriptování
ASAPZdarma, open sourceWindows, Linux (předběžná podpora macOS)Anotace celých skenů preparátů
SlideScopeUkázky zdarma se všemi nástroji, 3denní bezplatná zkušební doba pro vlastní snímky, poté předplatné od $25 měsíčněWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon i Intel)Prohlížení, měření a anotace souborů SVS vedle CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM a TIFF, přičemž soubory zůstávají ve vašem počítači

Soubory Aperio SVS otevřete v Aperio ImageScope, bezplatném prohlížeči společnosti Leica pro Windows, který se již aktivně nevyvíjí; v QuPath, který je zdarma ve Windows, na Macu i v Linuxu; nebo ve SlideScope, desktopovém prohlížeči pro Windows a Mac s bezplatnou zkušební dobou. Na Macu ImageScope nepřipadá v úvahu. Následující kroky používají SlideScope.

Zdroj: Srovnání prohlížečů celých skenů preparátů (platformy a ceny, každý údaj s odkazem na zdroj) (v angličtině).

Viz také: ImageScope na Macu: kde ho stáhnout a alternativy (v angličtině); Čtení souborů SVS v Pythonu pomocí OpenSlide nebo tifffile (v angličtině).

Kdy je SlideScope praktickou volbou

  • SVS Aperio pro celoplošné patologické preparáty
  • Hodnotitelé potřebují desktopové rozhraní bez skriptů a nastavování pluginů.
  • Procházejte kanály, roviny Z, časové body a scény, pokud je soubor obsahuje, zkontrolujte velikost pixelu v Details a měřte v kalibrovaných jednotkách.
  • Měření, poznámky a oblasti zůstávají připojené k preparátu a exportují se jako GeoJSON nebo CSV.

Výběr podle pracovního postupu

Zvažte SlideScope, pokud potřebujete jednu desktopovou aplikaci, která otevře různé mikroskopické formáty a spočítá standardní objekty přímo na vašem počítači. Původní nástroj použijte pro ovládání mikroskopu, programovatelné zpracování, skriptované analytické pipeline nebo institucionální správu snímků.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Rozšiřitelné zpracování, makra, pluginy, skripty, segmentace, patologická analýza a vědecké postupy Python.

OMERO: Centrální úložiště snímků, oprávnění, spolupráce a institucionální správa dat.

Otázky k souborům SVS

Dají se soubory SVS otevřít zdarma?

Ano. Aperio ImageScope (Windows) a QuPath (Windows, Mac, Linux) jsou zdarma. SlideScope si můžete zdarma stáhnout. Vestavěná knihovna ukázek je zdarma, se všemi nástroji, a vlastní snímky otevřete s 3denní bezplatnou zkušební dobou (vyžaduje PayPal nebo kartu); po skončení zkušební doby funguje na předplatné.

Otevření preparátů SVS na Macu

SlideScope běží nativně v macOS 14 nebo novějším, takže pro prohlížeč výrobce nepotřebujete počítač s Windows ani virtuální počítač. Vyberte verzi Apple Silicon nebo Intel a před otevřením zkopírujte preparát na místní úložiště.

Pokud preparát nelze otevřít

Ověřte, že se soubor celý zkopíroval na místní úložiště. Pokud problém trvá, sdělte podpoře verzi aplikace, formát souboru a chybovou zprávu.

Pro koho je určen?

Pro výzkumné laboratoře, mikroskopická pracoviště, pedagogy, studenty a týmy hodnotící patologické snímky.

Dokumentace formátu

Přečtěte si původní dokumentaci formátu.

SVS

Související vyhledávání v češtině

Nezávislost a ochranné známky

SlideScope je nezávislý a není spojen se společnostmi či projekty Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ani OMERO. Názvy slouží pouze k věcnému srovnání.

Stáhnout SlideScope

Prozkoumejte celé preparáty, fluorescenční kanály a sady obrazových řezů v jednom přehledném pracovním prostředí pro Windows a macOS.

Stáhnout SlideScope

Máte soubor, který se neotevírá, nebo formát, který v seznamu chybí? Nahlásit soubor nebo formát