Isi video ini
Berkas ZEISS .czi dapat berisi beberapa scene: sumur-sumur pada pelat, region tile, atau region pindaian sebuah slide. Panduan ini membuka CZI dua scene di SlideScope, menelusuri setiap scene, dan menunjukkan lokasi perekaman masing-masing dengan XY Overview.
Selanjutnya panduan ini memeriksa kanal dan ukuran piksel, mengekspor satu scene atau semua scene ke OME-TIFF, lalu membuka kembali hasilnya. Berkas hasil ekspor mempertahankan ukuran piksel dan nama kanal, sehingga Fiji, QuPath, dan pembaca Bio-Formats lainnya membukanya dengan benar.
Lebih suka membaca? Cara membuka berkas CZI, termasuk berkas multi-scene.
Transkrip
Diperbarui sejak perekaman. Bagian narasi yang menyebut uji coba untuk ekspor: uji coba dalam narasi tidak lagi ditawarkan kepada pendaftar baru, dan harga yang disebutkan telah berubah: pustaka sampel bawaan gratis dengan semua alat, dan membuka citra Anda sendiri memerlukan langganan, ditagih saat Anda berlangganan dengan PayPal atau kartu. Harga terkini ada di halaman harga. Lihat harga.
Berkas CZI dapat berisi beberapa scene: sumur-sumur pada pelat, region tile, atau region pindaian.
Berikut cara melihat masing-masing, dan mengekspornya sebagai OME-TIFF.
CZI dengan dua scene, dibuka secara langsung. Tanpa konversi.
Kontrol Scene berpindah dari satu scene ke scene berikutnya.
Scene 2 adalah sumur D7. Scene 1 adalah sumur D6.
XY Overview menempatkan setiap scene di lokasi perekamannya.
Kedua sumur ini berjarak 9 mm.
Gabungkan kanal-kanal ke dalam satu tampilan.
Matikan satu kanal untuk melihat kontribusinya.
Perbesar. Skala batang tetap terkalibrasi.
Details mencantumkan ukuran piksel, kanal, dan pengaturan akuisisi.
Untuk mengekspor, pilih File, lalu Export Current Image as TIFF.
Saat Anda melihat satu scene, hanya scene itu yang diekspor.
Sebelum dimulai, Anda melihat ukuran piksel, kanal, dan kompresi yang akan ditulis.
Untuk mengekspor semua scene, aktifkan XY Overview terlebih dahulu.
Semua scene masuk ke dalam satu berkas OME-TIFF. Setiap scene menjadi citra tersendiri di dalamnya.
Buka hasilnya. Kedua scene ada di sana, sebagai citra 1 dan citra 2.
Ukuran piksel dan nama kanal ikut terbawa.
Akun gratis memungkinkan Anda membuka dan melihat citra lokal sebelum uji coba apa pun.
Ekspor memerlukan uji coba 3 hari atau langganan.
Pindaian tile berukuran besar diekspor pada resolusi overview-nya, bukan pindaian penuh.
Aplikasinya sama di macOS dan Windows. Rekaman ini dirender di Windows.