Pelajari SlideScope

Dari terpasang sampai hasil yang nyata

Setiap panduan di bawah adalah tugas yang memang perlu diselesaikan seseorang, dengan perkiraan waktu yang jujur dan tiga langkah. Mulailah dari jalur awal bila SlideScope masih baru bagi Anda, atau langsung lompat ke pekerjaan yang ada di depan Anda.

Mulai uji cobaUnduhan dan uji coba
CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.8.5

Mulai di sini

Sekitar sepuluh menit, sekali saja. Kerjakan berurutan dan sisanya di halaman ini akan masuk akal.

  1. Pasang dan aktifkan

    Unduh build bertanda tangan untuk Windows atau macOS lalu masuk dengan akun yang Anda pakai untuk uji coba atau langganan. Aktivasi terikat pada mesin, dan satu langganan mencakup dua perangkat, jadi laptop dan workstation Anda bisa sama-sama tetap masuk.

  2. Buka preparat pertama Anda

    Seret berkas CZI, ND2, SVS, NDPI, DICOM, atau TIFF ke jendela. Tidak ada langkah impor maupun konversi: SlideScope membaca piramida pemindai secara langsung, sehingga preparat gigapiksel terbuka di laptop biasa.

  3. Kenali tempatnya

    Gulir untuk memperbesar, seret untuk menggeser, dan pakai navigator ikhtisar untuk melompat di seluruh preparat tanpa kehilangan posisi. Lihat panel metadata sejak awal: ukuran piksel yang tercatat di sana itulah yang membuat setiap pengukuran berikutnya terkalibrasi, bukan kira-kira.

Panduan menurut tugas

Pilih yang cocok dengan apa yang ingin Anda kerjakan hari ini.

Menghitung inti sel pada citra fluoresensi

6 mnt
  1. Buka citranya dan pilih wilayah yang ingin dihitung. Mengkuantifikasi wilayah alih-alih seluruh preparat menjaga prosesnya tetap cepat dan hasilnya tetap pada jaringan yang Anda pedulikan.
  2. Di panel kuantifikasi pilih Inti, tetapkan InstanSeg sebagai mesin, dan arahkan kanal segmentasi ke DAPI atau pewarnaan inti Anda. Biarkan pengaturan lanjutan apa adanya pada proses pertama.
  3. Jalankan, lalu baca hamparannya sebelum membaca angkanya. Klik objek mana pun yang tampak keliru untuk dikecualikan, kemudian ekspor CSV bersama ringkasan metodenya.

Mengukur struktur dalam mikrometer

4 mnt
  1. Pastikan panel metadata menampilkan ukuran piksel. Bila pemindai mencatatnya, hasil pengukuran keluar dalam mikrometer sungguhan; bila tidak, kalibrasikan manual sebelum mengukur apa pun.
  2. Pilih alat ukur lalu tarik melintasi struktur. Jarak dan luas dihitung pada resolusi penuh preparat, bukan pada tingkat perbesaran yang kebetulan Anda lihat.
  3. Simpan pengukurannya agar tetap menempel pada preparat, lalu ekspor tabelnya sebagai CSV atau wilayahnya sebagai GeoJSON ketika Anda memerlukannya di tempat lain.

Membandingkan HE dengan IHK pasangannya

5 mnt
  1. Buka preparat pertama, lalu buka yang kedua di sebelahnya. Kedua panel terkunci pada bagian jaringan yang sama dengan perbesaran yang sama.
  2. Skala disamakan dalam mikrometer, bukan lewat faktor perbesaran, sehingga dua pindaian beresolusi berbeda benar-benar bersesuaian. Geser atau perbesar salah satu panel, panel lain mengikuti.
  3. Beri anotasi di panel yang masuk akal. Catatan tetap menempel pada preparatnya sendiri dan pada akun Anda, jadi peninjau berikutnya akan melihatnya.

Mengkuantifikasi satu folder penuh sekali jalan

8 mnt
  1. Benarkan satu citra dulu. Setel jenis objek, mesin, kanal, dan batas luas pada satu citra representatif sampai hamparannya terlihat benar.
  2. Simpan pengaturan itu sebagai resep dan beri nama yang masih Anda kenali tiga bulan lagi.
  3. Pilih proses batch folder, arahkan ke direktorinya, lalu biarkan berjalan. Anda memperoleh ekspor per citra plus CSV ringkasan batch gabungan, dengan setiap citra dianalisis memakai pengaturan yang identik.

Membagikan tampilan persis yang Anda lihat

3 mnt
  1. Arahkan ke bidang pandang yang ingin dilihat orang lain, pada perbesaran dan bidang yang Anda maksud.
  2. Buat tautan tampilan bersama. Tautan itu membawa preparat berikut posisi, perbesaran, dan bidangnya, jadi tak seorang pun perlu menyisir pindaian gigapiksel.
  3. Kirimkan. Siapa pun yang punya SlideScope membukanya sekali klik lewat skema slidescope://; yang belum punya akan melihat dulu di situs web ke mana tautan itu menunjuk.

Rujukan

Biarkan ini terbuka di satu tab selagi Anda bekerja.

Kuantifikasiformat berkas yang didukungKepercayaan dan penanganan dataKontakCatatan Rilis

Pertanyaan umum

Saya benar-benar baru. Mulai dari mana?

Kerjakan tiga langkah awal berurutan, lalu panduan pengukuran. Empat hal itu menutupi sebagian besar kebutuhan pengguna baru pada minggu pertama. Panduan penghitungan layak dikerjakan berikutnya meski Anda merasa belum butuh kuantifikasi, sebab itulah cara tercepat memahami bagaimana SlideScope memperlakukan kalibrasi.

Apakah saya perlu belajar skrip?

Tidak. Tidak ada satu pun di halaman ini yang menuntut skrip, makro, plugin, atau lingkungan Python. Kuantifikasi digerakkan oleh resep tersimpan alih-alih kode: itulah pertukarannya — kurang luwes dibanding platform yang bisa diprogram, jauh lebih cepat sampai ke hasil.

Bagaimana melatih anggota lab yang lain?

Kirimi mereka tautan tampilan bersama yang menunjuk ke preparat sungguhan dari pekerjaan Anda sendiri, bersama halaman ini. Membuka sesuatu yang familier lebih ampuh daripada berkas latihan buatan, dan tautannya memastikan mereka melihat bidang pandang yang sama dengan Anda, bukan sudut lain dari pindaian.

Pelajari dengan citra Anda sendiri

Uji coba 14 hari memberi akses penuh. Kerjakan panduan ini memakai preparat yang benar-benar ditangani laboratorium Anda, bukan berkas contoh.

Mulai uji coba
format berkas yang didukungCatatan RilisAlternatifKepercayaan dan penanganan data