SlideScope membuka berkas Zeiss CZI secara native di macOS 14 atau yang lebih baru, pada Mac Apple Silicon maupun Intel: setiap scene, kanal, bidang Z, dan titik waktu, dengan ukuran piksel yang tercatat dalam berkas. SlideScope mengekspor scene yang sedang Anda lihat, atau semua scene, ke satu berkas OME-TIFF. ZEN lite, penampil gratis dari ZEISS, hanya berjalan di Windows. Memakai Windows? Lihat cara membuka berkas CZI di Windows & Mac.
Scene, kanal, Z, dan waktuEkspor OME-TIFFApple Silicon dan Intel
Pasang SlideScope di Mac Anda
Unduh build macOS yang sesuai dengan Mac Anda: Apple Silicon (seri M) atau Intel. Halaman unduhan merekomendasikan yang tepat.
Buka DMG dan seret SlideScope ke Applications. Panduan instalasi macOS menampilkan setiap langkah dengan tangkapan layar, termasuk apa yang harus dilakukan jika macOS meminta Anda mengonfirmasi pembukaan pertama.
Buka sampel dari pustaka bawaan, atau slide Anda sendiri. Jelajahi pustaka sampel bawaan secara gratis, dengan semua alat. Membuka citra Anda sendiri memerlukan langganan. Langganan baru dimulai ketika Anda memilihnya saat checkout.
Berkas CZI multi-scene: lihat setiap scene dan ekspor ke OME-TIFF
Berkas CZI dapat berisi beberapa scene: sumur-sumur pada pelat, region tile, atau region pindaian sebuah slide. SlideScope menampilkan setiap scene secara terpisah atau semuanya sekaligus, dan mengekspor scene yang sedang Anda lihat atau semua scene ke OME-TIFF. Video dan langkah-langkah di bawah ini memakai berkas sampel publik dengan dua scene.
Tonton seluruh alur kerja (1 mnt 41 dtk)
Membuka CZI dua scene, berpindah scene, XY Overview, kanal, Details, mengekspor satu scene dan semua scene, lalu membuka kembali OME-TIFF. Narasi dalam bahasa Inggris; teks terjemahan dalam setiap bahasa situs. Dirender dari SlideScope 1.8.56 di Windows; build macOS memiliki kontrol yang sama. Diperbarui sejak perekaman: membuka dan mengekspor citra Anda sendiri kini memerlukan langganan. Sampel bawaan tetap gratis dengan semua alat.Transkrip
Berkas CZI dapat berisi beberapa scene: sumur-sumur pada pelat, region tile, atau region pindaian. Berikut cara melihat masing-masing, dan mengekspornya sebagai OME-TIFF.
CZI dengan dua scene, dibuka secara langsung. Tanpa konversi. Kontrol Scene berpindah dari satu scene ke scene berikutnya. Scene 2 adalah sumur D7. Scene 1 adalah sumur D6. XY Overview menempatkan setiap scene di lokasi perekamannya. Kedua sumur ini berjarak 9 mm.
Gabungkan kanal-kanal ke dalam satu tampilan. Matikan satu kanal untuk melihat kontribusinya. Perbesar. Skala batang tetap terkalibrasi. Details mencantumkan ukuran piksel, kanal, dan pengaturan akuisisi.
Untuk mengekspor, pilih File, lalu Export Current Image as TIFF. Saat Anda melihat satu scene, hanya scene itu yang diekspor. Sebelum dimulai, Anda melihat ukuran piksel, kanal, dan kompresi yang akan ditulis. Untuk mengekspor semua scene, aktifkan XY Overview terlebih dahulu. Semua scene masuk ke dalam satu berkas OME-TIFF. Setiap scene menjadi citra tersendiri di dalamnya.
Buka hasilnya. Kedua scene ada di sana, sebagai citra 1 dan citra 2. Ukuran piksel dan nama kanal ikut terbawa.
Akun gratis memungkinkan Anda membuka dan melihat citra lokal sebelum uji coba apa pun. Ekspor memerlukan uji coba 3 hari atau langganan. Pindaian tile berukuran besar diekspor pada resolusi overview-nya, bukan pindaian penuh. Aplikasinya sama di macOS dan Windows. Rekaman ini dirender di Windows.
Langkah 1
Buka berkas CZI
Pilih File › Open File… (Ctrl+O di Windows, ⌘O di Mac) atau seret berkas .czi ke jendela. Scene pertama langsung muncul. Tidak ada yang dikonversi dan berkas tidak diunggah.
Langkah 2
Telusuri scene satu per satu
Berkas dengan beberapa scene menampilkan kontrol Scene di bawah citra. Gunakan − dan + atau ketik sebuah angka. Setiap scene mempertahankan ukurannya sendiri dan namanya dari berkas, seperti sumur (D6, D7) atau region tile.
Langkah 3
Lihat semua scene di XY Overview
Klik XY Overview di samping kontrol Scene, atau pilih View › XY Overview (Ctrl+Shift+X). Setiap scene digambar di lokasi perekamannya, termasuk celah di antaranya. Klik sebuah scene untuk memilihnya dan klik dua kali untuk membukanya. Scene yang letaknya berjauhan, seperti sumur yang berjarak 9 mm, awalnya tampil sebagai tile kecil: perbesar untuk melihatnya.
Langkah 4
Periksa kanal, ukuran piksel, dan metadata
Di Display, centang Blend channels into one view untuk komposit warna, atau matikan kanal tertentu. Details mencantumkan ukuran piksel, dimensi, scene saat ini, dan ukurannya. Kecerahan, kontras, dan warna hanya mengubah apa yang Anda lihat, tidak pernah mengubah piksel yang tersimpan.
Langkah 5
Pilih File › Export Current Image as TIFF
Pilih File › Export Current Image as TIFF… (Ctrl+Shift+C). Pilih folder dan nama; SlideScope menyarankan nama yang berakhiran .ome.tif.
Langkah 6
Ekspor satu scene, atau semua scene
Saat satu scene tampil di layar, hanya scene itu yang diekspor, dengan nama seperti sample_scene-2.ome.tif. Untuk mengekspor semua scene, aktifkan XY Overview terlebih dahulu: semua scene masuk ke dalam satu berkas OME-TIFF, masing-masing sebagai citra tersendiri dengan ukurannya sendiri. Sebelum apa pun ditulis, konfirmasi menampilkan ukuran, ukuran piksel, kanal, dan kompresinya.
Langkah 7
Buka hasilnya
Klik Open Exported TIFF setelah ekspor selesai. SlideScope menampilkan setiap scene yang diekspor sebagai citra; telusuri satu per satu dengan kontrol Image. Pembaca OME-TIFF yang mendukung beberapa citra per berkas, seperti Bio-Formats di Fiji, mencantumkannya sebagai series terpisah.
Isi berkas OME-TIFF hasil ekspor
Satu berkas. Mengekspor scene yang tampil di layar menulis satu citra; mengekspor dari XY Overview menulis setiap scene sebagai citra terpisah di dalam berkas yang sama, masing-masing dengan ukurannya sendiri. Tidak dibuat satu berkas per scene.
Piksel ditulis tanpa diubah, dengan kompresi lossless (Deflate). Kecerahan, kontras, dan gamma adalah pengaturan tampilan dan tidak diterapkan pada hasil ekspor.
Ukuran piksel dalam mikrometer, langkah Z bila ada Z stack, nama kanal yang tercatat dalam CZI, dan warna kanal yang sedang diatur di penampil. Berkas tanpa ukuran piksel yang tercatat diekspor tanpa ukuran piksel; SlideScope tidak mengarang kalibrasi.
Resolusi: scene yang muat di memori diekspor pada resolusi penuh. Pindaian tile berukuran besar, seperti region dari pemindai slide, diekspor pada resolusi overview-nya. Konfirmasi menyebutkan rasionya, misalnya 1:8, dan ukuran piksel yang tercatat diskalakan agar sesuai. Pindaian beresolusi penuh tetap dapat dilihat region demi region di SlideScope.
Satu citra hasil ekspor yang lebar atau tingginya lebih dari 4.096 piksel juga mendapat level piramida beresolusi lebih rendah. Berkas dengan beberapa citra tidak. Berkas di atas 2 GiB ditulis sebagai BigTIFF.
Tidak disalin: metadata akuisisi CZI lainnya, dan posisi scene sebagai koordinat pentas. Simpan CZI asli sebagai berkas arsip.
Yang Anda perlukan
Windows 10 atau 11, atau macOS 14 atau yang lebih baru pada Apple Silicon atau Intel. Jelajahi pustaka sampel bawaan secara gratis, dengan semua alat. Membuka citra Anda sendiri memerlukan langganan. Langganan seharga $35.00 per bulan dan sudah termasuk ekspor.
Jika ada yang tampak salah
Hanya satu scene yang muncul
Scene dapat ditelusuri satu per satu bila memiliki tipe piksel yang sama serta kanal, bidang Z, dan titik waktu yang sama. Jika tidak, SlideScope menampilkan scene pertama dan menjelaskan alasannya di Details. Jika itu bukan yang Anda harapkan, kirimkan berkasnya kepada kami.
Warnanya berbeda dari ZEN
Warna kanal diambil dari berkas jika berkas mencatatnya. Ubah warnanya di Display › Channel colour…; hasil ekspor mencatat warna yang Anda atur.
Hasil ekspor lebih kecil daripada pindaiannya
Pindaian tile berukuran besar diekspor pada resolusi overview-nya, dan konfirmasi menyebutkan hal itu sebelum apa pun ditulis. Pindaian beresolusi penuh tetap dapat dilihat di SlideScope.
Ekspor meminta Anda berlangganan
Pada sampel bawaan, semua alat berfungsi gratis, termasuk ekspor. Mengekspor citra Anda sendiri memerlukan langganan.
Sampel dalam video dan tangkapan layar: S2_3x3_CH2.czi dari data sampel czitools (Sebastian Rhode / ZEISS, GPL-3.0), dua scene dari mosaik 3 × 3 dengan DAPI dan EGFP. Tanpa data pelanggan.
Seberapa baik dukungan CZI diuji
Dalam uji format yang kami publikasikan, dijalankan pada 2026-09-18, ke-48 dari 48 berkas CZI berhasil dibuka, dengan hingga 8 kanal, 56 bidang Z, dan 10 titik waktu; yang terbesar berukuran 4,5 GB. Ini adalah uji kami sendiri terhadap loader yang dirilis, dipublikasikan beserta data mentahnya, bukan sertifikasi independen, dan berkas sampelnya tidak mencakup setiap varian CZI yang digunakan. Berkas uji publik mencakup pelat sumur multi-scene dan region tile, tetapi tidak ada CZI multi-scene dari pemindai slide, sehingga kasus tersebut kurang tercakup. Lihat benchmark format dan referensi kompatibilitas.
Cara lain membuka CZI di Mac
Alat
Cocok untuk
Perlu diingat
SlideScope
Membuka, meninjau, mengukur, dan mengekspor berkas CZI di Mac, bersama ND2, SVS, dan format lainnya.
Alat penampil dan peninjauan. Tanpa skrip atau pipeline analisis kustom.
Fiji / ImageJ dengan Bio-Formats
Analisis gratis dan open source dengan plugin dan makro; membaca CZI di macOS.
Platform analisis; setiap scene diimpor sebagai series melalui dialog impor.
QuPath
Analisis whole slide gratis; membaca CZI melalui Bio-Formats.
Dirancang untuk proyek analisis slide, bukan untuk peninjauan cepat stack multidimensi.
ZEISS ZEN lite
Penampil gratis dari vendor, paling dekat dengan perangkat lunak akuisisinya.
Hanya untuk Windows, jadi bukan pilihan di Mac tanpa Windows.
Pertanyaan
Bisakah saya membuka berkas CZI di Mac?
Ya. SlideScope membuka berkas CZI secara native di macOS 14 atau yang lebih baru, pada Mac Apple Silicon maupun Intel, termasuk berkas dengan beberapa scene, kanal, bidang Z, dan titik waktu. Fiji dengan Bio-Formats juga dapat membuka CZI di Mac. ZEN lite, penampil gratis dari ZEISS, adalah aplikasi Windows.
Bagaimana cara melihat setiap scene dalam berkas CZI?
Gunakan kontrol Scene di bawah citra untuk berpindah dari satu scene ke scene lain, atau aktifkan XY Overview untuk melihat setiap scene di posisi perekamannya. Setiap scene mempertahankan ukuran dan namanya sendiri.
Bisakah saya mengekspor scene CZI ke OME-TIFF?
Ya. File › Export Current Image as TIFF mengekspor scene yang tampil di layar, atau semua scene bila XY Overview aktif. Setiap scene menjadi citra tersendiri di dalam satu berkas OME-TIFF, dengan kompresi lossless, ukuran piksel, dan nama kanal. Mengekspor berkas Anda sendiri memerlukan langganan; sampel bawaan dapat diekspor secara gratis.
Apakah SlideScope berafiliasi dengan ZEISS?
Tidak. SlideScope bersifat independen dan tidak berafiliasi dengan ZEISS. Nama produk hanya digunakan untuk menjelaskan format berkas dan keperluan perbandingan.
SlideScope tidak berafiliasi dengan ZEISS. ZEISS, ZEN, dan CZI disebutkan untuk menjelaskan kompatibilitas berkas. SlideScope ditujukan untuk riset, pendidikan, dan peninjauan, bukan untuk diagnosis.
Kapan SlideScope menjadi pilihan yang tepat
Pilih SlideScope bila Anda menginginkan satu aplikasi desktop native, di Mac atau PC Windows, yang membuka slide dan berkas mikroskopi dari banyak vendor (SVS, NDPI, MRXS, CZI, ND2, LIF, VSI, DICOM, dan lainnya), mengukur dalam satuan terkalibrasi, serta menghitung inti sel dan sel tanpa menulis kode, dengan setiap berkas tetap tersimpan di komputer Anda sendiri.
Ini adalah aplikasi berbayar dengan pustaka sampel gratis: semua alat berfungsi pada sampel bawaan, sedangkan untuk membuka citra Anda sendiri diperlukan langganan (PayPal atau kartu). Jika Anda hanya membuka format satu vendor di Windows, penampil gratis dari vendor tersebut mungkin sudah cukup; untuk analisis berbasis skrip, QuPath dan Fiji gratis dan open source.
Coba pada berkas CZI Anda sendiri
Jelajahi pustaka sampel bawaan secara gratis, dengan semua alat. Membuka citra Anda sendiri memerlukan langganan. Langganan seharga $35.00 per bulan, ditagih saat Anda berlangganan (PayPal atau kartu). Batalkan kapan saja dari akun Anda.
