この動画の内容
Nikon の .nd2 ファイルが 1 枚の画像だけであることはまれです。時点、焦点面、チャンネル、ステージ位置を 1 つのファイルに保存できます。この動画では ND2 の中身を説明し、Mac または Windows の SlideScope で実際に開きます。
時間・深さ・チャンネルの操作、取得時のメタデータ、校正済みの計測をご覧いただいた後、NIS-Elements や Fiji と比べてビューアではできないことを率直に挙げています。
文章で読みたい方は:ND2 ファイルを開く方法:すべての選択肢を比較。
文字起こし
収録後の更新。ナレーションで SlideScope はセグメンテーションやバッチ定量を行わないと述べている箇所は正しくありません。v1.8.5 以降、Local Quantification がご自身のコンピューター上で核、細胞、粒子をセグメンテーションして数え、保存したレシピをフォルダー全体に適用できます。スクリプトやマクロ言語には引き続き対応していません。ナレーションのトライアルは新規登録者には提供されなくなり、紹介されている価格も変更されています。内蔵のサンプルライブラリはすべてのツールとともに無料で使え、ご自身の画像を開くにはサブスクリプションが必要です(ご登録時に PayPal またはカードで請求)。現在の価格は料金ページに掲載しています。料金をご覧ください。
ND2 は Nikon の形式です。NIS-Elements から出力され、ほかにこれを開けるソフトはほとんどありません。
ND2 ファイルが 1 枚の画像だけであることはまれです。
タイムシリーズ、Z スタック、複数のチャンネルで、多くの場合それらすべてを同時に含みます。
.nd2 を直接開きます。変換は不要です。
このファイルはタイムラプスです。時点をスクラブして確認します。
別のスライダーで深さを切り替えます。このファイルには 11 枚の Z 平面があります。
チャンネルを 1 つのビューに重ね合わせます。
チャンネルを個別にオン・オフして、それぞれの寄与を確認します。
取得時のメタデータ:対物レンズ、ピクセルサイズ、取得間隔。
このピクセルサイズがあるので、計測値がマイクロメートルで表示されます。
これはビューアです。NIS-Elements の解析ルーチンは実行しません。
顕微鏡の制御はせず、バッチ定量も行いません。
TIFF に書き出せるので、Fiji や CellProfiler へスムーズに作業を引き継げます。
Mac と Windows で同じアプリです。3 日間のフルアクセストライアルの後、月額 $25.00 です。