この動画の内容
ZEISS の .czi ファイルは Mac でダブルクリックしても開きません。また、ベンダーの無料ビューアである ZEISS ZEN lite は Windows 専用です。Fiji はどのプラットフォームでも Bio-Formats 経由で CZI を開けますが、解析プラットフォームです。この動画では選択肢を比較したうえで、実際の CZI を SlideScope で開きます。
ファイルを変換せずに画像ピラミッドが読み込まれる様子、チャンネルを個別表示とカラー合成で表示する様子、Z スタックを 1 平面ずつ切り替える様子、取得時のメタデータ、そして校正済みのマイクロメートル単位での計測をご覧いただけます。
文章で読みたい方は:CZI ファイルを開く方法:すべての選択肢を比較。
文字起こし
収録後の更新。ナレーションで SlideScope はセグメンテーションやバッチ定量を行わないと述べている箇所は正しくありません。v1.8.5 以降、Local Quantification がご自身のコンピューター上で核、細胞、粒子をセグメンテーションして数え、保存したレシピをフォルダー全体に適用できます。スクリプトやマクロ言語には引き続き対応していません。ナレーションのトライアルは新規登録者には提供されなくなり、紹介されている価格も変更されています。内蔵のサンプルライブラリはすべてのツールとともに無料で使え、ご自身の画像を開くにはサブスクリプションが必要です(ご登録時に PayPal またはカードで請求)。現在の価格は料金ページに掲載しています。料金をご覧ください。
これは Zeiss 顕微鏡の CZI ファイルです。Mac でダブルクリックしても何も起こりません。
ZEN lite はベンダーの無料ツールですが、Windows 専用です。
Fiji は Mac でも Bio-Formats 経由で CZI を読み込めますが、1 枚の画像を対象とした解析プラットフォームです。
.czi を直接開きます。インポート手順も変換も不要です。
画像ピラミッドを読み込むので、ファイル全体を読み込まずにズームできます。
フル解像度でパンします。スケールバーは校正されたままです。
チャンネルは左側に一覧表示されます。Composite はそれらをカラーで重ね合わせます。
チャンネルを個別にオン・オフして、それぞれの寄与を確認します。
このファイルは Z スタックです。スライダーで焦点面を切り替えます。
メタデータは画像の横に表示されます:対物レンズ、ピクセルサイズ、取得設定。
ピクセルサイズを読み取っているので、計測値はマイクロメートルで表示されます。
対応範囲を率直に言うと、これはビューアです。セグメンテーション、バッチ定量、スクリプトには対応していません。
TIFF を書き出せるので、領域をきれいに受け渡せます。
研究、教育、レビュー用です。臨床診断用ではありません。
Windows 10 以降と macOS 14 以降(Apple Silicon または Intel)で同じアプリが使えます。
Windows 版は SSL.com によるコード署名済みです。
3 日間のフルアクセストライアルの後、月額 $25.00 です。リンクは概要欄にあります。