prohlížeč mikroskopických snímků

Jak otevřít soubory IMS

Otevírejte soubory Imaris IMS (Bitplane, nyní Oxford Instruments) v aplikaci SlideScope ve Windows nebo macOS bez převodu. Kanály se otevřou s barvami a rozsahy zobrazení uloženými v souboru, ohniskové roviny jsou v µm a časové body v sekundách a otevřou se i komprimované soubory IMS. SlideScope čte úroveň souboru v plném rozlišení. Místní prohlížení neodesílá obraz na server.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.11.1

Jak otevřít soubory IMS

  1. Stáhněte verzi pro svůj počítač Windows nebo Mac a nainstalujte ji. Bezplatný náhled nevyžaduje účet.
  2. Otevřete SlideScope a přetáhněte soubor .ims do prohlížeče.
  3. Pokud jsou k dispozici, vyberte scénu nebo pozici a prohlédněte kanály, řezy Z a časové body.
  4. Před měřením zkontrolujte velikost pixelu v metadatech. Při exportu zachovejte původní soubor.

Jak otevřít soubory IMS

NástrojCenaPlatformyVhodné pro
Imaris ViewerZdarma (ke stažení je potřeba vyplnit registrační formulář)Windows, macOS (Apple silicon i Intel)Vlastní 3D a 4D prohlížeč výrobce pro IMS
Fiji / ImageJ s Bio-FormatsZdarma, open sourceWindows, macOS, LinuxAnalýza s pluginy a makry
SlideScopeBezplatný náhled (bez karty), 3denní bezplatná zkušební doba, poté předplatné od $25 měsíčněWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon i Intel)Prohlížení, měření a anotace souborů IMS vedle CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM a TIFF, přičemž soubory zůstávají ve vašem počítači

Soubory Imaris IMS otevřete v Imaris Viewer, bezplatném prohlížeči společnosti Oxford Instruments pro Windows a Mac; ve Fiji, které čte IMS pomocí Bio-Formats ve Windows, na Macu i v Linuxu; nebo ve SlideScope, desktopovém prohlížeči pro Windows a Mac s bezplatnou zkušební dobou. Následující kroky používají SlideScope.

Zdroj: Kompatibilita souborů: co SlideScope otevře a jaká má omezení (v angličtině).

Kdy je SlideScope praktickou volbou

  • IMS z vícekanálového zobrazování Imaris/Bitplane
  • Hodnotitelé potřebují desktopové rozhraní bez skriptů a nastavování pluginů.
  • Procházejte kanály, roviny Z, časové body a scény, pokud je soubor obsahuje, zkontrolujte velikost pixelu v Details a měřte v kalibrovaných jednotkách.
  • Měření, poznámky a oblasti zůstávají připojené k preparátu a exportují se jako GeoJSON nebo CSV.

Výběr podle pracovního postupu

Zvažte SlideScope, pokud potřebujete jednu desktopovou aplikaci, která otevře různé mikroskopické formáty a spočítá standardní objekty přímo na vašem počítači. Původní nástroj použijte pro ovládání mikroskopu, programovatelné zpracování, skriptované analytické pipeline nebo institucionální správu snímků.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Rozšiřitelné zpracování, makra, pluginy, skripty, segmentace, patologická analýza a vědecké postupy Python.

OMERO: Centrální úložiště snímků, oprávnění, spolupráce a institucionální správa dat.

Otázky k souborům IMS

Umí Fiji otevřít soubory IMS?

Ano. Fiji čte soubory Imaris IMS, včetně verze 5.5 založené na HDF5, pomocí Bio-Formats. Imaris Viewer je také zdarma, ve Windows i na Macu. SlideScope si můžete zdarma stáhnout. Obsahuje bezplatný náhled, ve kterém otevřete, změříte a anotujete vlastní snímky (bez karty), a 3denní bezplatnou zkušební dobu se všemi funkcemi (vyžaduje PayPal nebo kartu); po skončení zkušební doby funguje na předplatné.

Otevření IMS na Macu

Použijte macOS 14 nebo novější. Vyberte verzi Apple Silicon nebo Intel pro svůj Mac a před otevřením zkopírujte soubor na místní úložiště.

Pokud soubor nelze otevřít

Ověřte, že kopírování skončilo. Pokud problém trvá, sdělte podpoře verzi aplikace, formát souboru a chybovou zprávu.

Pro koho je určen?

Pro výzkumné laboratoře, mikroskopická pracoviště, pedagogy, studenty a týmy hodnotící patologické snímky.

Dokumentace formátu

Přečtěte si původní dokumentaci formátu.

IMS

Související vyhledávání v češtině

Nezávislost a ochranné známky

SlideScope je nezávislý a není spojen se společnostmi či projekty Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ani OMERO. Názvy slouží pouze k věcnému srovnání.

Stáhnout SlideScope

Prozkoumejte celé preparáty, fluorescenční kanály a sady obrazových řezů v jednom přehledném pracovním prostředí pro Windows a macOS.

Stáhnout SlideScope

Máte soubor, který se neotevírá, nebo formát, který v seznamu chybí? Nahlásit soubor nebo formát