Jak otevřít soubory NDPI
Soubory Hamamatsu NDPI otevřete v NDP.view2, bezplatném prohlížeči společnosti Hamamatsu pro Windows a macOS; v QuPath, který je zdarma ve Windows, na Macu i v Linuxu; nebo ve SlideScope, desktopovém prohlížeči pro Windows a Mac s bezplatnou zkušební dobou. Následující kroky používají SlideScope.
Zdroj: Srovnání prohlížečů celých skenů preparátů (platformy a ceny, každý údaj s odkazem na zdroj) (v angličtině).
Viz také: Hamamatsu NDP.view2: kde ho stáhnout, podpora Macu a alternativy (v angličtině).
Kdy je SlideScope praktickou volbou
- Preparáty ze skenerů NDPI, VMS, VMU, MRXS, SCN, BIF, SVSLIDE, QPTIFF a AVS od Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana, Aperio, Vectra a Agilent ARGOS
- Hodnotitelé potřebují desktopové rozhraní bez skriptů a nastavování pluginů.
- Procházejte kanály, roviny Z, časové body a scény, pokud je soubor obsahuje, zkontrolujte velikost pixelu v Details a měřte v kalibrovaných jednotkách.
- Měření, poznámky a oblasti zůstávají připojené k preparátu a exportují se jako GeoJSON nebo CSV.
Výběr podle pracovního postupu
Zvažte SlideScope, pokud potřebujete jednu desktopovou aplikaci, která otevře různé mikroskopické formáty a spočítá standardní objekty přímo na vašem počítači. Původní nástroj použijte pro ovládání mikroskopu, programovatelné zpracování, skriptované analytické pipeline nebo institucionální správu snímků.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Rozšiřitelné zpracování, makra, pluginy, skripty, segmentace, patologická analýza a vědecké postupy Python.
OMERO: Centrální úložiště snímků, oprávnění, spolupráce a institucionální správa dat.
Nezávislost a ochranné známky
SlideScope je nezávislý a není spojen se společnostmi či projekty Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ani OMERO. Názvy slouží pouze k věcnému srovnání.