本影片涵蓋內容
一個 ZEISS .czi 檔案可以包含多個場景:培養盤的各個孔、拼接區域,或切片的各個掃描區域。本教學在 SlideScope 中開啟一個含兩個場景的 CZI,逐一切換每個場景,並使用 XY Overview 顯示各場景的記錄位置。
接著檢查通道與像素尺寸,將單一場景或所有場景匯出為 OME-TIFF,再重新開啟結果。匯出的檔案會保留像素尺寸與通道名稱,因此 Fiji、QuPath 及其他 Bio-Formats 讀取器都能正確開啟。
比較喜歡用讀的?如何開啟 CZI 檔案,包括多場景檔案。
逐字稿
錄製後已更新。關於旁白中提到的匯出試用:旁白中的試用已不再提供給新註冊的使用者,所提到的價格也已變更:內建範例庫可免費使用所有工具,開啟您自己的影像則需要訂閱,訂閱時即透過 PayPal 或信用卡收費。最新價格請見價格頁面。請參閱價格。
一個 CZI 檔案可以包含多個場景:培養盤的各個孔、拼接區域或掃描區域。
以下說明如何檢視每個場景,並將它們匯出為 OME-TIFF。
直接開啟一個含兩個場景的 CZI。無需轉換。
Scene 控制項可從一個場景切換到下一個。
場景 2 是 D7 孔。場景 1 是 D6 孔。
XY Overview 會將每個場景放在它被記錄的位置。
這兩個孔相距 9 mm。
將各通道混合成單一檢視。
關閉某個通道,看看它貢獻了什麼。
放大。比例尺仍保持校正。
Details 會列出像素尺寸、通道與擷取設定。
若要匯出,請選擇 File,然後選擇 Export Current Image as TIFF。
檢視單一場景時,只會匯出該場景。
開始之前,您會看到它將寫入的像素尺寸、通道與壓縮方式。
若要匯出所有場景,請先開啟 XY Overview。
所有場景都會寫入同一個 OME-TIFF 檔案。每個場景在其中都是一張獨立的影像。
開啟結果。兩個場景都在,分別是影像 1 與影像 2。
像素尺寸與通道名稱都完整保留。
免費帳戶可讓您在任何試用之前,就開啟並檢視本機影像。
匯出需要 3 天試用或訂閱。
大型拼接掃描會以其概覽解析度匯出,而不是完整掃描解析度。
macOS 與 Windows 上是同一個 App。這段畫面是在 Windows 上算繪的。