macOS 上的 CZI

如何在 Mac 上開啟 CZI 檔案

SlideScope 可在 macOS 14 或更新版本、Apple Silicon 與 Intel Mac 上原生開啟 Zeiss CZI 檔案：涵蓋每個場景、通道、Z 平面與時間點，並採用檔案所記錄的像素尺寸。它可將您正在檢視的場景或所有場景匯出成一個 OME-TIFF 檔案。ZEISS 的免費檢視器 ZEN lite 僅能在 Windows 上執行。使用 Windows 嗎？請參閱如何在 Windows 與 Mac 上開啟 CZI 檔案。

試著開啟您的 CZI 檔案觀看操作示範
場景、通道、Z 與時間OME-TIFF 匯出Apple Silicon 與 Intel

在您的 Mac 上安裝 SlideScope

  1. 下載與您的 Mac 相符的 macOS 版本：Apple Silicon（M 系列）或 Intel。下載頁面會推薦合適的版本。
  2. 開啟 DMG，將 SlideScope 拖曳到「應用程式」資料夾。macOS 安裝指南以螢幕截圖說明每個步驟，包括 macOS 要求您確認首次開啟時該怎麼做。
  3. 開啟內建範例庫中的範例，或您自己的玻片。免費探索內建範例庫，所有工具皆可使用。開啟您自己的影像需要訂閱。只有在您於結帳時選擇訂閱後，訂閱才會開始。

多場景 CZI 檔案：檢視每個場景並匯出 OME-TIFF

一個 CZI 可以包含多個場景：培養盤的各個孔、拼接區域，或玻片的各個掃描區域。SlideScope 可單獨顯示每個場景，或一次顯示全部場景，並可將您正在檢視的場景或所有場景匯出為 OME-TIFF。以下影片與步驟使用一個公開的雙場景範例檔案。

觀看完整工作流程（1 分 41 秒）

開啟雙場景 CZI、切換場景、XY Overview、通道、Details、匯出單一場景與所有場景，並重新開啟 OME-TIFF。英文旁白；提供網站所有語言的字幕。以 Windows 上的 SlideScope 1.8.56 錄製；macOS 版本的控制項相同。錄製後已更新：開啟與匯出您自己的影像現在需要訂閱。內建範例仍可免費使用所有工具。
逐字稿

一個 CZI 檔案可以包含多個場景：培養盤的各個孔、拼接區域或掃描區域。以下說明如何檢視每個場景，並將它們匯出為 OME-TIFF。

直接開啟一個含兩個場景的 CZI。無需轉換。Scene 控制項可從一個場景切換到下一個。場景 2 是 D7 孔。場景 1 是 D6 孔。XY Overview 會將每個場景放在它被記錄的位置。這兩個孔相距 9 mm。

將各通道混合成單一檢視。關閉某個通道，看看它貢獻了什麼。放大。比例尺仍保持校正。Details 會列出像素尺寸、通道與擷取設定。

若要匯出，請選擇 File，然後選擇 Export Current Image as TIFF。檢視單一場景時，只會匯出該場景。開始之前，您會看到它將寫入的像素尺寸、通道與壓縮方式。若要匯出所有場景，請先開啟 XY Overview。所有場景都會寫入同一個 OME-TIFF 檔案。每個場景在其中都是一張獨立的影像。

開啟結果。兩個場景都在，分別是影像 1 與影像 2。像素尺寸與通道名稱都完整保留。

免費帳戶可讓您在任何試用之前，就開啟並檢視本機影像。匯出需要 3 天試用或訂閱。大型拼接掃描會以其概覽解析度匯出，而不是完整掃描解析度。macOS 與 Windows 上是同一個應用程式。這段畫面是在 Windows 上算繪的。

步驟 1

開啟 CZI 檔案

選擇 File › Open File…（Windows 上為 Ctrl+O，Mac 上為 ⌘O），或將 .czi 檔案拖曳到視窗中。第一個場景會立即出現。不會進行任何轉換，檔案也不會上傳。

步驟 2

逐一切換場景

含有多個場景的檔案會在影像下方顯示 Scene 控制項。使用 − 與 + 或輸入數字。每個場景都保留各自的尺寸，以及檔案中的名稱，例如孔位（D6、D7）或拼接區域。

SlideScope 顯示 CZI 檔案 2 個場景中的場景 2，影像下方的 Scene 控制項設為 2 of 2。
步驟 3

在 XY Overview 中查看所有場景

點選 Scene 控制項旁的 XY Overview，或選擇 View › XY Overview（Ctrl+Shift+X）。每個場景都會繪製在其記錄的位置，包括場景之間的間隔。按一下場景即可選取，按兩下即可開啟。彼此相距很遠的場景（例如相距 9 mm 的孔）一開始會顯示為小圖塊：放大即可看清楚。

XY Overview 顯示範例的兩個場景，標示為 D6 與 D7，位於相距 9 mm 的記錄位置。
步驟 4

檢查通道、像素尺寸與中繼資料

在 Display 中，勾選 Blend channels into one view 以產生彩色合成影像，或關閉個別通道。Details 會列出像素尺寸、維度、目前場景及其尺寸。亮度、對比與顏色只會改變您看到的畫面，絕不會更動儲存的像素。

Details 面板列出像素尺寸 100 nm、兩個通道、兩個 XY 位置，以及目前場景 1 of 2（D6）。
步驟 5

選擇 File › Export Current Image as TIFF

選擇 File › Export Current Image as TIFF…（Ctrl+Shift+C）。選擇資料夾與檔名；SlideScope 會建議一個以 .ome.tif 結尾的檔名。

開啟的 File 選單，其中 Export Current Image as TIFF 已反白。
步驟 6

匯出單一場景或所有場景

當畫面上只有單一場景時，只會匯出該場景，檔名類似 sample_scene-2.ome.tif。若要匯出所有場景，請先開啟 XY Overview：所有場景都會寫入同一個 OME-TIFF 檔案，每個場景各自為一張影像，並保有各自的尺寸。在寫入任何內容之前，確認畫面會顯示尺寸、像素尺寸、通道與壓縮方式。

場景 2（D7）的匯出確認畫面：以全解析度單獨匯出，為無損 OME-TIFF，記錄像素尺寸 0.1 µm、通道名稱與顏色。
步驟 7

開啟結果

匯出完成後，點選 Open Exported TIFF。SlideScope 會將每個匯出的場景顯示為一張影像；可用 Image 控制項逐一切換。支援單一檔案含多張影像的 OME-TIFF 讀取程式（例如 Fiji 中的 Bio-Formats）會將它們列為不同的序列。

匯出的 OME-TIFF 在 SlideScope 中重新開啟，顯示 2 張影像中的影像 2，20 µm 比例尺完好保留。

匯出的 OME-TIFF 包含哪些內容

  • 單一檔案。匯出畫面上的場景會寫出一張影像；從 XY Overview 匯出則會將每個場景寫成同一檔案中的獨立影像，各自保有原本的尺寸。它不會為每個場景各建立一個檔案。
  • 像素會原封不動地寫入，並採用無損壓縮（Deflate）。亮度、對比與 gamma 屬於顯示設定，不會套用到匯出結果。
  • 以微米為單位的像素尺寸、有 Z 堆疊時的 Z 間距、CZI 中記錄的通道名稱，以及目前在檢視器中設定的通道顏色。沒有記錄像素尺寸的檔案匯出時也不會有像素尺寸；SlideScope 不會自行捏造校正資訊。
  • 解析度：可放入記憶體的場景會以全解析度匯出。大型拼接掃描（例如玻片掃描器的掃描區域）會以其概覽解析度匯出。確認畫面會註明比例，例如 1:8，而記錄的像素尺寸也會相應調整。全解析度掃描仍可在 SlideScope 中逐區檢視。
  • 寬度或高度超過 4,096 像素的單張匯出影像，也會產生較低解析度的金字塔層級。含有多張影像的檔案則不會。超過 2 GiB 的檔案會以 BigTIFF 寫入。
  • 不會複製：其餘的 CZI 擷取中繼資料，以及以載物台座標表示的場景位置。請保留原始 CZI 作為封存檔案。
從 XY Overview 匯出的確認畫面：檔案含 2 個場景，每個場景都以獨立影像寫入 OME-TIFF，保有各自的尺寸、無損壓縮、各影像自身的像素尺寸、通道名稱與顏色。

您需要什麼

Windows 10 或 11，或在 Apple Silicon 或 Intel 上執行的 macOS 14 或更新版本。免費探索內建範例庫，所有工具皆可使用。開啟您自己的影像需要訂閱。訂閱費用為每月 $35.00，並包含匯出功能。

如果有地方看起來不對

只出現一個場景

當各場景具有相同的像素類型，以及相同的通道、Z 平面與時間點時，才能逐一切換。若不相同，SlideScope 會顯示第一個場景，並在 Details 中說明原因。如果這不是您預期的結果，請將檔案寄給我們。

顏色與 ZEN 不同

若檔案有記錄通道顏色，就會沿用檔案中的顏色。您可以在 Display › Channel colour… 中變更；匯出時會記錄您設定的顏色。

匯出結果比掃描影像小

大型拼接掃描會以其概覽解析度匯出，確認畫面會在寫入任何內容之前說明這一點。全解析度掃描仍可在 SlideScope 中檢視。

匯出時要求訂閱

在內建範例上，所有工具皆可免費使用，包括匯出。匯出您自己的影像需要訂閱。

影片與螢幕截圖中的範例：czitools 範例資料中的 S2_3x3_CH2.czi（Sebastian Rhode / ZEISS，GPL-3.0），為 3 × 3 拼接的兩個場景，含 DAPI 與 EGFP。不含任何客戶資料。

CZI 支援的測試程度

在我們於 2026-09-18 執行並公開的格式測試中，48 個 CZI 檔案全數開啟成功，最多含 8 個通道、56 個 Z 平面與 10 個時間點；最大的檔案為 4.5 GB。這是我們針對正式發行之讀取程式所做的自家測試，並公開原始資料，不是獨立認證，而且範例檔案並未涵蓋實際使用中的所有 CZI 變體。公開測試檔案包括多場景培養盤與拼接區域，但沒有多場景的玻片掃描器 CZI，因此這種情況的涵蓋程度較低。請參閱格式基準測試與相容性參考。

在 Mac 上開啟 CZI 的其他方式

工具適合用途注意事項
SlideScope在 Mac 上開啟、審閱、量測與匯出 CZI 檔案，並同時支援 ND2、SVS 及其他格式。檢視與審閱工具。不支援腳本或自訂分析流程。
Fiji / ImageJ 搭配 Bio-Formats免費、開源的分析軟體，支援外掛程式與巨集；可在 macOS 上讀取 CZI。分析平台；每個場景都透過匯入對話框以序列方式匯入。
QuPath免費的全玻片分析軟體；透過 Bio-Formats 讀取 CZI。以玻片分析專案為核心，而不是快速審閱多維影像堆疊。
ZEISS ZEN lite廠商的免費檢視器，最接近擷取軟體。僅限 Windows，因此在沒有 Windows 的 Mac 上無法使用。

常見問題

可以在 Mac 上開啟 CZI 檔案嗎？

可以。SlideScope 可在 macOS 14 或更新版本、Apple Silicon 與 Intel Mac 上原生開啟 CZI 檔案，包括含有多個場景、通道、Z 平面與時間點的檔案。搭配 Bio-Formats 的 Fiji 也能在 Mac 上開啟 CZI。ZEISS 的免費檢視器 ZEN lite 是 Windows 應用程式。

如何查看 CZI 檔案的所有場景？

使用影像下方的 Scene 控制項逐一切換場景，或開啟 XY Overview，在各場景的記錄位置上查看全部場景。每個場景都保留各自的尺寸與名稱。

可以將 CZI 場景匯出為 OME-TIFF 嗎？

可以。File › Export Current Image as TIFF 會匯出畫面上的場景，開啟 XY Overview 時則匯出所有場景。每個場景都會成為同一個 OME-TIFF 檔案中的獨立影像，採用無損壓縮，並保留像素尺寸與通道名稱。匯出您自己的檔案需要訂閱；內建範例可免費匯出。

SlideScope 與 ZEISS 有關聯嗎？

沒有。SlideScope 為獨立產品，與 ZEISS 並無關聯。產品名稱僅用於說明檔案格式與比較用途。

獨立性

SlideScope 與 ZEISS 並無關聯。提及 ZEISS、ZEN 與 CZI 僅為說明檔案相容性。SlideScope 適用於研究、教育與審閱，不適用於診斷。

何時適合選擇 SlideScope

如果您想要一款原生桌面應用程式，在 Mac 或 Windows 電腦上開啟多家廠商的切片與顯微影像檔案（SVS、NDPI、MRXS、CZI、ND2、LIF、VSI、DICOM 等），以校正單位進行量測，並且不必撰寫程式碼就能計數細胞核與細胞，同時所有檔案都保留在您自己的電腦上，請選擇 SlideScope。

這是一款付費應用程式，附有免費範例庫：所有工具都能在內建範例上使用，開啟您自己的影像則需要訂閱（PayPal 或信用卡）。如果您只在 Windows 上開啟單一廠商的格式，該廠商的免費檢視器可能就已足夠；若要進行腳本化分析，QuPath 與 Fiji 是免費的開源軟體。

在您自己的 CZI 檔案上試試看

免費探索內建範例庫，所有工具皆可使用。開啟您自己的影像需要訂閱。訂閱費用為每月 $35.00，訂閱時即收費（PayPal 或信用卡）。可隨時在帳戶中取消。

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