przeglądarka obrazów mikroskopowych

Jak otworzyć pliki NDPI

Otwieraj skany całych preparatów Hamamatsu NDPI w SlideScope w Windows lub macOS bez wcześniejszej konwersji. Przesuwaj i powiększaj cały preparat, mierz w µm z kalibracją skanera i dodawaj adnotacje. Lokalne wyświetlanie nie przesyła obrazu na serwer.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.17.2

Jak otworzyć pliki NDPI

  1. Pobierz wersję dla swojego komputera Windows lub Mac i zainstaluj ją. Wbudowana biblioteka przykładów jest bezpłatna, ze wszystkimi narzędziami; własne preparaty otworzysz w ramach bezpłatnego okresu próbnego, który wymaga zatwierdzenia przez PayPal lub kartę przy płatności.
  2. Przeciągnij plik .ndpi do przeglądarki lub wybierz File › Open File… Otwieraj skany preparatów z dysku lokalnego.
  3. Użyj podglądu całości, aby przejść do wybranego obszaru, a następnie powiększ. SlideScope wczytuje poziom piramidy odpowiadający widocznemu fragmentowi.
  4. Przed pomiarem sprawdź rozmiar piksela (µm/px) w szczegółach pliku, a następnie mierz, dodawaj adnotacje i eksportuj bieżący widok jako obraz.

Jak otworzyć pliki NDPI

NarzędzieKosztPlatformyNajlepsze do
Hamamatsu NDP.view2Bezpłatny dla preparatów Hamamatsu (NDP.view2 Plus jest płatny)Windows 10/11, macOS 13–26 (Apple silicon i Intel)Przeglądarka samego producenta przeznaczona do NDPI
QuPathBezpłatny, open sourceWindows, macOS, LinuxProjekty analizy obrazów całych preparatów (WSI) i skrypty
SlideScopeBezpłatne przykłady ze wszystkimi narzędziami, 3-dniowy bezpłatny okres próbny dla własnych obrazów, potem subskrypcja od $25 miesięcznieWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon i Intel)Przeglądanie, pomiary i adnotacje plików NDPI obok CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM i TIFF, a pliki pozostają na Twoim komputerze

Pliki Hamamatsu NDPI otworzysz w NDP.view2, bezpłatnej przeglądarce firmy Hamamatsu dla Windows i macOS; w QuPath, bezpłatnym w systemach Windows, Mac i Linux; albo w SlideScope, przeglądarce desktopowej dla Windows i Maca z bezpłatnym okresem próbnym. Poniższe kroki dotyczą SlideScope.

Źródło: Porównanie przeglądarek obrazów całych preparatów (platformy i ceny, każda pozycja z odnośnikiem do źródła) (w języku angielskim).

Zobacz też: Hamamatsu NDP.view2: skąd go pobrać, obsługa Maca i alternatywy (w języku angielskim).

Kiedy SlideScope jest praktycznym wyborem

  • Preparaty ze skanerów NDPI, VMS, VMU, MRXS, SCN, BIF, SVSLIDE, QPTIFF i AVS firm Hamamatsu, 3DHISTECH, Leica, Ventana, Aperio, Vectra i Agilent ARGOS
  • Osoby oceniające potrzebują interfejsu desktopowego bez skryptów i konfiguracji wtyczek.
  • Przechodź między kanałami, płaszczyznami Z, punktami czasowymi i scenami, jeśli plik je zawiera, sprawdź rozmiar piksela w Details i mierz w skalibrowanych jednostkach.
  • Pomiary, notatki i regiony pozostają powiązane z preparatem i można je wyeksportować jako GeoJSON lub CSV.

Wybór według przepływu pracy

Rozważ SlideScope, gdy potrzebujesz jednej aplikacji desktopowej, która otwiera różne formaty mikroskopowe i mierzy standardowe obiekty na twoim własnym komputerze. Pozostań przy narzędziu źródłowym, jeśli potrzebujesz sterowania mikroskopem, programowalnego przetwarzania, skryptowanych potoków analizy lub instytucjonalnego zarządzania obrazami.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Rozszerzalne przetwarzanie, makra, wtyczki, skrypty, segmentacja, analiza patologiczna i naukowe procesy Python.

OMERO: Centralne repozytoria obrazów, uprawnienia, współpraca i zarządzanie danymi instytucji.

Pytania o pliki NDPI

Czy można bezpłatnie otworzyć pliki NDPI?

Tak. NDP.view2 firmy Hamamatsu i QuPath są bezpłatne. SlideScope można pobrać bezpłatnie. Wbudowana biblioteka przykładów jest bezpłatna i działa ze wszystkimi narzędziami, a własne obrazy otworzysz w ramach 3-dniowego bezpłatnego okresu próbnego (wymagany PayPal lub karta); po zakończeniu okresu próbnego korzystanie wymaga subskrypcji.

Otwieranie preparatów NDPI na Macu

SlideScope działa natywnie w macOS 14 lub nowszym, więc nie potrzebujesz komputera z Windows ani maszyny wirtualnej dla przeglądarki producenta. Wybierz wersję Apple Silicon lub Intel i przed otwarciem skopiuj preparat na dysk lokalny.

Gdy preparat się nie otwiera

Sprawdź, czy plik został w całości skopiowany na dysk lokalny. Jeśli problem trwa, podaj pomocy technicznej wersję aplikacji, format pliku i komunikat błędu.

Dla kogo jest przeznaczony?

Dla laboratoriów badawczych, pracowni mikroskopowych, dydaktyków, studentów i zespołów przeglądających obrazy patologiczne.

Dokumentacja formatu

Przeczytaj oryginalną dokumentację formatu.

NDPI

Powiązane wyszukiwania po polsku

Niezależność i znaki towarowe

SlideScope jest niezależny i nie jest powiązany z Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ani OMERO. Nazwy służą wyłącznie rzetelnemu porównaniu.

Pobierz SlideScope

Przeglądaj całe preparaty, kanały fluorescencji i stosy obrazów w jednym przejrzystym środowisku pracy dla Windows i macOS.

Pobierz SlideScope

Masz plik, który się nie otwiera, albo format, którego nie ma na liście? Zgłoś plik lub format