przeglądarka obrazów mikroskopowych

Jak otworzyć pliki IMS

Otwieraj pliki Imaris IMS (Bitplane, obecnie Oxford Instruments) w SlideScope w Windows lub macOS bez konwersji. Kanały otwierają się z kolorami i zakresami wyświetlania zapisanymi w pliku, płaszczyzny ogniskowe są podane w µm, punkty czasowe w sekundach, a skompresowane pliki IMS również się otwierają. SlideScope odczytuje poziom pełnej rozdzielczości pliku. Lokalne wyświetlanie nie przesyła obrazu na serwer.

CZI · ND2 · SVS · DICOM · TIFFWindows · macOSSlideScope 1.11.1

Jak otworzyć pliki IMS

  1. Pobierz wersję dla swojego komputera Windows lub Mac i zainstaluj ją. Bezpłatny podgląd nie wymaga konta.
  2. Otwórz SlideScope i przeciągnij plik .ims do przeglądarki.
  3. Wybierz scenę lub pozycję, jeśli występuje, a następnie przejrzyj dostępne kanały, przekroje Z i punkty czasowe.
  4. Przed pomiarem sprawdź rozmiar piksela w metadanych. Zachowaj plik źródłowy podczas eksportu.

Jak otworzyć pliki IMS

NarzędzieKosztPlatformyNajlepsze do
Imaris ViewerBezpłatny (do pobrania wymagany formularz rejestracyjny)Windows, macOS (Apple silicon i Intel)Przeglądarka 3D i 4D samego producenta przeznaczona do IMS
Fiji / ImageJ z Bio-FormatsBezpłatny, open sourceWindows, macOS, LinuxAnaliza z wtyczkami i makrami
SlideScopeBezpłatny podgląd (bez karty), 3-dniowy bezpłatny okres próbny, potem subskrypcja od $25 miesięcznieWindows 10+, macOS 14+ (Apple silicon i Intel)Przeglądanie, pomiary i adnotacje plików IMS obok CZI, ND2, SVS, NDPI, MRXS, DICOM i TIFF, a pliki pozostają na Twoim komputerze

Pliki Imaris IMS otworzysz w Imaris Viewer, bezpłatnej przeglądarce firmy Oxford Instruments dla Windows i Maca; w Fiji, które odczytuje IMS za pomocą Bio-Formats w systemach Windows, Mac i Linux; albo w SlideScope, przeglądarce desktopowej dla Windows i Maca z bezpłatnym okresem próbnym. Poniższe kroki dotyczą SlideScope.

Źródło: Zgodność plików: co otwiera SlideScope i jakie ma ograniczenia (w języku angielskim).

Kiedy SlideScope jest praktycznym wyborem

  • IMS z obrazowania wielokanałowego Imaris/Bitplane
  • Osoby oceniające potrzebują interfejsu desktopowego bez skryptów i konfiguracji wtyczek.
  • Przechodź między kanałami, płaszczyznami Z, punktami czasowymi i scenami, jeśli plik je zawiera, sprawdź rozmiar piksela w Details i mierz w skalibrowanych jednostkach.
  • Pomiary, notatki i regiony pozostają powiązane z preparatem i można je wyeksportować jako GeoJSON lub CSV.

Wybór według przepływu pracy

Rozważ SlideScope, gdy potrzebujesz jednej aplikacji desktopowej, która otwiera różne formaty mikroskopowe i mierzy standardowe obiekty na twoim własnym komputerze. Pozostań przy narzędziu źródłowym, jeśli potrzebujesz sterowania mikroskopem, programowalnego przetwarzania, skryptowanych potoków analizy lub instytucjonalnego zarządzania obrazami.

Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Rozszerzalne przetwarzanie, makra, wtyczki, skrypty, segmentacja, analiza patologiczna i naukowe procesy Python.

OMERO: Centralne repozytoria obrazów, uprawnienia, współpraca i zarządzanie danymi instytucji.

Pytania o pliki IMS

Czy Fiji otworzy pliki IMS?

Tak. Fiji odczytuje pliki Imaris IMS, w tym wersję 5.5 opartą na HDF5, za pomocą Bio-Formats. Imaris Viewer również jest bezpłatny, w systemach Windows i Mac. SlideScope można pobrać bezpłatnie. Zawiera bezpłatny podgląd, w którym otworzysz i zmierzysz własne obrazy oraz dodasz do nich adnotacje (bez karty), a także 3-dniowy bezpłatny okres próbny ze wszystkimi funkcjami (wymagany PayPal lub karta); po zakończeniu okresu próbnego korzystanie wymaga subskrypcji.

Otwieranie IMS na Macu

Używaj macOS 14 lub nowszego. Wybierz wersję Apple Silicon lub Intel odpowiednią dla Maca i przed otwarciem skopiuj plik na dysk lokalny.

Gdy plik się nie otwiera

Sprawdź, czy kopiowanie zostało zakończone. Jeśli problem trwa, podaj pomocy technicznej wersję aplikacji, format pliku i komunikat błędu.

Dla kogo jest przeznaczony?

Dla laboratoriów badawczych, pracowni mikroskopowych, dydaktyków, studentów i zespołów przeglądających obrazy patologiczne.

Dokumentacja formatu

Przeczytaj oryginalną dokumentację formatu.

IMS

Powiązane wyszukiwania po polsku

Niezależność i znaki towarowe

SlideScope jest niezależny i nie jest powiązany z Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ani OMERO. Nazwy służą wyłącznie rzetelnemu porównaniu.

Pobierz SlideScope

Przeglądaj całe preparaty, kanały fluorescencji i stosy obrazów w jednym przejrzystym środowisku pracy dla Windows i macOS.

Pobierz SlideScope

Masz plik, który się nie otwiera, albo format, którego nie ma na liście? Zgłoś plik lub format