Jak otworzyć pliki IMS
Pliki Imaris IMS otworzysz w Imaris Viewer, bezpłatnej przeglądarce firmy Oxford Instruments dla Windows i Maca; w Fiji, które odczytuje IMS za pomocą Bio-Formats w systemach Windows, Mac i Linux; albo w SlideScope, przeglądarce desktopowej dla Windows i Maca z bezpłatnym okresem próbnym. Poniższe kroki dotyczą SlideScope.
Źródło: Zgodność plików: co otwiera SlideScope i jakie ma ograniczenia (w języku angielskim).
Kiedy SlideScope jest praktycznym wyborem
- IMS z obrazowania wielokanałowego Imaris/Bitplane
- Osoby oceniające potrzebują interfejsu desktopowego bez skryptów i konfiguracji wtyczek.
- Przechodź między kanałami, płaszczyznami Z, punktami czasowymi i scenami, jeśli plik je zawiera, sprawdź rozmiar piksela w Details i mierz w skalibrowanych jednostkach.
- Pomiary, notatki i regiony pozostają powiązane z preparatem i można je wyeksportować jako GeoJSON lub CSV.
Wybór według przepływu pracy
Rozważ SlideScope, gdy potrzebujesz jednej aplikacji desktopowej, która otwiera różne formaty mikroskopowe i mierzy standardowe obiekty na twoim własnym komputerze. Pozostań przy narzędziu źródłowym, jeśli potrzebujesz sterowania mikroskopem, programowalnego przetwarzania, skryptowanych potoków analizy lub instytucjonalnego zarządzania obrazami.
Fiji/ImageJ, QuPath, napari: Rozszerzalne przetwarzanie, makra, wtyczki, skrypty, segmentacja, analiza patologiczna i naukowe procesy Python.
OMERO: Centralne repozytoria obrazów, uprawnienia, współpraca i zarządzanie danymi instytucji.
Niezależność i znaki towarowe
SlideScope jest niezależny i nie jest powiązany z Leica Biosystems, ZEISS, Nikon, ImageJ, Fiji, QuPath, napari ani OMERO. Nazwy służą wyłącznie rzetelnemu porównaniu.